RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323372.8

PIPOX-201, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PIPOX, Length 2,414 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-201ENST00000323372 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.31■■□□□ 1.48
PIPOX-201ENST00000323372 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.29■■□□□ 1.48
PIPOX-201ENST00000323372 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PIPOX-201ENST00000323372 TIAM1Q13009 1591 aa24.24■■□□□ 1.47
PIPOX-201ENST00000323372 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.471e-7■■■■■ 34.3
PIPOX-201ENST00000323372 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.22■■□□□ 1.47
PIPOX-201ENST00000323372 PBRM1Q86U86 1689 aa24.19■■□□□ 1.46
PIPOX-201ENST00000323372 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
PIPOX-201ENST00000323372 ITGAEP38570 1179 aa24.18■■□□□ 1.46
PIPOX-201ENST00000323372 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PIPOX-201ENST00000323372 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.14■■□□□ 1.46
PIPOX-201ENST00000323372 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.14■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 MAP3K1Q13233 1512 aa24.12■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 ERCC6Q03468 1493 aa24.12■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.11■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 WDR62O43379 1518 aa24.09■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
PIPOX-201ENST00000323372 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.07■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.06■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 ADAMTS12P58397 1594 aa24.05■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 IFT140Q96RY7 1462 aa24.05■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 SAMD9Q5K651 1589 aa24.05■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 GRIN2BQ13224 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 FMN1Q68DA7 1419 aa24.04■■□□□ 1.44
PIPOX-201ENST00000323372 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PIPOX-201ENST00000323372 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24■■□□□ 1.43
PIPOX-201ENST00000323372 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 IQGAP2Q13576 1575 aa23.94■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.93■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.9■■□□□ 1.42
PIPOX-201ENST00000323372 ARID3CA6NKF2 412 aa23.85■■□□□ 1.41
PIPOX-201ENST00000323372 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.84■■□□□ 1.41
PIPOX-201ENST00000323372 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PIPOX-201ENST00000323372 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PIPOX-201ENST00000323372 FBLN2P98095 1184 aa23.82■■□□□ 1.4
PIPOX-201ENST00000323372 GRIN2AQ12879 1464 aa23.8■■□□□ 1.4
PIPOX-201ENST00000323372 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PIPOX-201ENST00000323372 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.77■■□□□ 1.4
PIPOX-201ENST00000323372 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.76■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.75■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 NCOA2Q15596 1464 aa23.75■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.75■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.75■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.75■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 HECW1Q76N89 1606 aa23.74■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.72■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.71■■□□□ 1.39
PIPOX-201ENST00000323372 KIAA0556O60303 1618 aa23.7■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 DISP1Q96F81 1524 aa23.69■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 CEP170Q5SW79 1584 aa23.68■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 SYNJ2O15056 1496 aa23.67■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.67■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.38
PIPOX-201ENST00000323372 MAPKBP1O60336 1514 aa23.63■■□□□ 1.37
PIPOX-201ENST00000323372 PTPRKQ15262 1439 aa23.61■■□□□ 1.37
PIPOX-201ENST00000323372 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.58■■□□□ 1.37
PIPOX-201ENST00000323372 ARHGEF11O15085 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.55■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 NEUROD1Q13562 356 aa23.54■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.54■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 JPH4Q96JJ6 628 aa23.53■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.52■■□□□ 1.36
PIPOX-201ENST00000323372 NUP160Q12769 1436 aa23.51■■□□□ 1.35
PIPOX-201ENST00000323372 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.5■■□□□ 1.35
PIPOX-201ENST00000323372 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.47■■□□□ 1.35
PIPOX-201ENST00000323372 HFM1A2PYH4 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
PIPOX-201ENST00000323372 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
PIPOX-201ENST00000323372 NAIPQ13075 1403 aa23.44■■□□□ 1.34
PIPOX-201ENST00000323372 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PIPOX-201ENST00000323372 MIER1Q8N108 512 aa23.42■■□□□ 1.34
PIPOX-201ENST00000323372 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PIPOX-201ENST00000323372 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PIPOX-201ENST00000323372 MIA2Q96PC5 1412 aa23.38■■□□□ 1.33
PIPOX-201ENST00000323372 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PIPOX-201ENST00000323372 UACAQ9BZF9 1416 aa23.35■■□□□ 1.33
PIPOX-201ENST00000323372 CHD1O14646 1710 aa23.34■■□□□ 1.33
PIPOX-201ENST00000323372 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 TRIM52Q96A61 297 aa23.31■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 KDM6BO15054 1643 aa23.31■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 KIF14Q15058 1648 aa23.3■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.29■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 DAPK1P53355 1430 aa23.27■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 ABCA8O94911 1581 aa23.27■■□□□ 1.32
PIPOX-201ENST00000323372 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 ABCC5O15440 1437 aa23.24■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 ATP10BO94823 1461 aa23.22■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.22■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 TONSLQ96HA7 1378 aa23.22■■□□□ 1.31
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