RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 IGF1RP08069 1367 aa36.19■■■■□ 3.38
SENP3-201ENST00000321337 HMGXB3Q12766 1538 aa36.19■■■■□ 3.38
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SENP3-201ENST00000321337 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
SENP3-201ENST00000321337 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.11■■■■□ 3.37
SENP3-201ENST00000321337 FKBP8Q14318 412 aa36.11■■■■□ 3.37
SENP3-201ENST00000321337 P3H3Q8IVL6 736 aa36.08■■■■□ 3.37
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
SENP3-201ENST00000321337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.02■■■■□ 3.36
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K1Q13233 1512 aa36.02■■■■□ 3.36
SENP3-201ENST00000321337 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.35
SENP3-201ENST00000321337 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.99■■■■□ 3.35
SENP3-201ENST00000321337 TRIM52Q96A61 297 aa35.93■■■■□ 3.34
SENP3-201ENST00000321337 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SENP3-201ENST00000321337 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.86■■■■□ 3.33
SENP3-201ENST00000321337 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.8■■■■□ 3.32
SENP3-201ENST00000321337 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.8■■■■□ 3.32
SENP3-201ENST00000321337 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.79■■■■□ 3.32
SENP3-201ENST00000321337 ANP32CO43423 234 aa35.75■■■■□ 3.31
SENP3-201ENST00000321337 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.74■■■■□ 3.31
SENP3-201ENST00000321337 CCER2I3L3R5 266 aa35.72■■■■□ 3.31
SENP3-201ENST00000321337 PRDM2Q13029 1718 aa35.72■■■■□ 3.31
SENP3-201ENST00000321337 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.69■■■■□ 3.3
SENP3-201ENST00000321337 NEFLP07196 543 aa35.69■■■■□ 3.3
SENP3-201ENST00000321337 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SENP3-201ENST00000321337 TONSLQ96HA7 1378 aa35.59■■■■□ 3.29
SENP3-201ENST00000321337 PTPRKQ15262 1439 aa35.57■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.56■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.56■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.54■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.53■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.52■■■■□ 3.28
SENP3-201ENST00000321337 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.279e-7■■□□□ 13.7
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SENP3-201ENST00000321337 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.263e-7■■■■■ 36
SENP3-201ENST00000321337 UACAQ9BZF9 1416 aa35.4■■■■□ 3.26
SENP3-201ENST00000321337 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.39■■■■□ 3.26
SENP3-201ENST00000321337 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.39■■■■□ 3.26
SENP3-201ENST00000321337 HFM1A2PYH4 1435 aa35.38■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.37■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.36■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 MSH5O43196 834 aa35.36■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.35■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.35■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 NAIPQ13075 1403 aa35.34■■■■□ 3.25
SENP3-201ENST00000321337 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SENP3-201ENST00000321337 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.31■■■■□ 3.24
SENP3-201ENST00000321337 BCL11AQ9H165 835 aa35.28■■■■□ 3.24
SENP3-201ENST00000321337 FMN1Q68DA7 1419 aa35.28■■■■□ 3.24
SENP3-201ENST00000321337 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.26■■■■□ 3.24
SENP3-201ENST00000321337 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.25■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.24■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 NCOA2Q15596 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 TOPBP1Q92547 1522 aa35.23■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.23■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.22■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 CCDC184Q52MB2 194 aa35.21■■■■□ 3.23
SENP3-201ENST00000321337 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.19■■■■□ 3.22
SENP3-201ENST00000321337 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.19■■■■□ 3.22
SENP3-201ENST00000321337 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.17■■■■□ 3.22
SENP3-201ENST00000321337 CUL7Q14999 1698 aa35.15■■■■□ 3.22
SENP3-201ENST00000321337 NESP48681 1621 aa35.14■■■■□ 3.22
SENP3-201ENST00000321337 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SENP3-201ENST00000321337 GRIN2BQ13224 1484 aa35.09■■■■□ 3.21
SENP3-201ENST00000321337 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 SAMD9Q5K651 1589 aa35.04■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.04■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 FOXD1Q16676 465 aa35.03■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 KDM6BO15054 1643 aa35.02■■■■□ 3.2
SENP3-201ENST00000321337 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.99■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.97■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.97■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.96■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 FAM9BQ8IZU0 186 aa34.96■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.96■■■■□ 3.19
SENP3-201ENST00000321337 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.95■■■■□ 3.18
SENP3-201ENST00000321337 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.9■■■■□ 3.18
SENP3-201ENST00000321337 ARHGEF11O15085 1522 aa34.9■■■■□ 3.18
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SENP3-201ENST00000321337 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
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SENP3-201ENST00000321337 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.86■■■■□ 3.17
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SENP3-201ENST00000321337 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.84■■■■□ 3.17
SENP3-201ENST00000321337 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.83■■■■□ 3.17
SENP3-201ENST00000321337 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
SENP3-201ENST00000321337 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.83■■■■□ 3.17
SENP3-201ENST00000321337 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.17
SENP3-201ENST00000321337 NCOA1Q15788 1441 aa34.81■■■■□ 3.16
SENP3-201ENST00000321337 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.81■■■■□ 3.16
SENP3-201ENST00000321337 ERICH6Q7L0X2 663 aa34.76■■■■□ 3.15
SENP3-201ENST00000321337 ERICH6BQ5W0A0 696 aa34.75■■■■□ 3.15
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