RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 JPH4Q96JJ6 628 aa43.09■■■■■ 4.49
CTXN1-201ENST00000318978 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
CTXN1-201ENST00000318978 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.02■■■■■ 4.48
CTXN1-201ENST00000318978 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.95■■■■■ 4.47
CTXN1-201ENST00000318978 IQGAP2Q13576 1575 aa42.79■■■■■ 4.44
CTXN1-201ENST00000318978 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
CTXN1-201ENST00000318978 PRXQ9BXM0 1461 aa42.67■■■■■ 4.42
CTXN1-201ENST00000318978 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.64■■■■■ 4.42
CTXN1-201ENST00000318978 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.64■■■■■ 4.42
CTXN1-201ENST00000318978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.64■■■■■ 4.42
CTXN1-201ENST00000318978 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.63■■■■■ 4.41
CTXN1-201ENST00000318978 EEA1Q15075 1411 aa42.61■■■■■ 4.41
CTXN1-201ENST00000318978 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CTXN1-201ENST00000318978 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CTXN1-201ENST00000318978 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.5■■■■■ 4.39
CTXN1-201ENST00000318978 PTPRGP23470 1445 aa42.48■■■■■ 4.39
CTXN1-201ENST00000318978 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.48■■■■■ 4.39
CTXN1-201ENST00000318978 DISP1Q96F81 1524 aa42.45■■■■■ 4.39
CTXN1-201ENST00000318978 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.42■■■■■ 4.38
CTXN1-201ENST00000318978 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
CTXN1-201ENST00000318978 KIAA0556O60303 1618 aa42.38■■■■■ 4.37
CTXN1-201ENST00000318978 GOLGA3Q08378 1498 aa42.29■■■■■ 4.36
CTXN1-201ENST00000318978 KIF21BO75037 1637 aa42.21■■■■■ 4.35
CTXN1-201ENST00000318978 UACAQ9BZF9 1416 aa42.18■■■■■ 4.34
CTXN1-201ENST00000318978 MAPKBP1O60336 1514 aa42.16■■■■■ 4.34
CTXN1-201ENST00000318978 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.11■■■■■ 4.33
CTXN1-201ENST00000318978 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.11■■■■■ 4.33
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC2Q92887 1545 aa42.11■■■■■ 4.33
CTXN1-201ENST00000318978 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.1■■■■■ 4.33
CTXN1-201ENST00000318978 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
CTXN1-201ENST00000318978 P3H3Q8IVL6 736 aa42.06■■■■■ 4.32
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 FAM69CQ0P6D2 419 aa42■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 SAMD9Q5K651 1589 aa41.98■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.98■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 DIP2BQ9P265 1576 aa41.96■■■■■ 4.31
CTXN1-201ENST00000318978 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
CTXN1-201ENST00000318978 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.91■■■■■ 4.3
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA8O94911 1581 aa41.9■■■■■ 4.3
CTXN1-201ENST00000318978 ASXL2Q76L83 1435 aa41.9■■■■■ 4.3
CTXN1-201ENST00000318978 TSPOAP1O95153 1857 aa41.77■■■■■ 4.28
CTXN1-201ENST00000318978 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.76■■■■■ 4.28
CTXN1-201ENST00000318978 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.76■■■■■ 4.28
CTXN1-201ENST00000318978 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.69■■■■■ 4.27
CTXN1-201ENST00000318978 ARID3CA6NKF2 412 aa41.69■■■■■ 4.26
CTXN1-201ENST00000318978 GLI2P10070 1586 aa41.64■■■■■ 4.26
CTXN1-201ENST00000318978 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.64■■■■■ 4.26
CTXN1-201ENST00000318978 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
CTXN1-201ENST00000318978 ATP10BO94823 1461 aa41.56■■■■■ 4.24
CTXN1-201ENST00000318978 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CTXN1-201ENST00000318978 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
CTXN1-201ENST00000318978 KCNH8Q96L42 1107 aa41.53■■■■■ 4.24
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.49■■■■■ 4.23
CTXN1-201ENST00000318978 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.49■■■■■ 4.23
CTXN1-201ENST00000318978 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CTXN1-201ENST00000318978 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
CTXN1-201ENST00000318978 KDM6BO15054 1643 aa41.42■■■■■ 4.22
CTXN1-201ENST00000318978 FMN1Q68DA7 1419 aa41.39■■■■■ 4.22
CTXN1-201ENST00000318978 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.36■■■■■ 4.21
CTXN1-201ENST00000318978 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
CTXN1-201ENST00000318978 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.33■■■■■ 4.21
CTXN1-201ENST00000318978 CD109Q6YHK3 1445 aa41.3■■■■■ 4.2
CTXN1-201ENST00000318978 HECW1Q76N89 1606 aa41.26■■■■■ 4.2
CTXN1-201ENST00000318978 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.25■■■■■ 4.19
CTXN1-201ENST00000318978 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
CTXN1-201ENST00000318978 CLIP1P30622 1438 aa41.2■■■■■ 4.19
CTXN1-201ENST00000318978 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.18■■■■■ 4.18
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.18■■■■■ 4.18
CTXN1-201ENST00000318978 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CTXN1-201ENST00000318978 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CTXN1-201ENST00000318978 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CTXN1-201ENST00000318978 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.03■■■■■ 4.16
CTXN1-201ENST00000318978 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.01■■■■■ 4.15
CTXN1-201ENST00000318978 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.97■■■■■ 4.15
CTXN1-201ENST00000318978 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
CTXN1-201ENST00000318978 CEP162Q5TB80 1403 aa40.94■■■■■ 4.14
CTXN1-201ENST00000318978 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.92■■■■■ 4.14
CTXN1-201ENST00000318978 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.91■■■■■ 4.14
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.91■■■■■ 4.14
CTXN1-201ENST00000318978 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
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CTXN1-201ENST00000318978 NEO1Q92859 1461 aa40.85■■■■■ 4.13
CTXN1-201ENST00000318978 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CTXN1-201ENST00000318978 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.83■■■■■ 4.13
CTXN1-201ENST00000318978 KIF14Q15058 1648 aa40.83■■■■■ 4.13
CTXN1-201ENST00000318978 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.78■■■■■ 4.12
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CTXN1-201ENST00000318978 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.75■■■■■ 4.11
CTXN1-201ENST00000318978 PLCH2O75038 1416 aa40.69■■■■■ 4.1
CTXN1-201ENST00000318978 AKNAQ7Z591 1439 aa40.69■■■■■ 4.1
CTXN1-201ENST00000318978 RAPGEF3O95398 923 aa40.68■■■■■ 4.1
CTXN1-201ENST00000318978 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
CTXN1-201ENST00000318978 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.58■■■■■ 4.09
CTXN1-201ENST00000318978 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.57■■■■■ 4.09
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.57■■■■■ 4.08
CTXN1-201ENST00000318978 RICTORQ6R327 1708 aa40.55■■■■■ 4.08
CTXN1-201ENST00000318978 ADGRL1O94910 1474 aa40.54■■■■■ 4.08
CTXN1-201ENST00000318978 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.52■■■■■ 4.08
CTXN1-201ENST00000318978 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.51■■■■■ 4.08
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