RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 ARHGEF11O15085 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
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PARL-202ENST00000317096 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.52■■■■□ 3.92
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PARL-202ENST00000317096 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.21■■■■□ 3.87
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PARL-202ENST00000317096 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.14■■■■□ 3.86
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PARL-202ENST00000317096 CLIP1P30622 1438 aa39.02■■■■□ 3.84
PARL-202ENST00000317096 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39■■■■□ 3.83
PARL-202ENST00000317096 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39■■■■□ 3.83
PARL-202ENST00000317096 CEP162Q5TB80 1403 aa38.97■■■■□ 3.83
PARL-202ENST00000317096 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
PARL-202ENST00000317096 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
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PARL-202ENST00000317096 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
PARL-202ENST00000317096 FMN1Q68DA7 1419 aa38.87■■■■□ 3.81
PARL-202ENST00000317096 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.82■■■■□ 3.8
PARL-202ENST00000317096 ATP10BO94823 1461 aa38.81■■■■□ 3.8
PARL-202ENST00000317096 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.8■■■■□ 3.8
PARL-202ENST00000317096 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
PARL-202ENST00000317096 ASXL2Q76L83 1435 aa38.72■■■■□ 3.79
PARL-202ENST00000317096 HECW1Q76N89 1606 aa38.71■■■■□ 3.79
PARL-202ENST00000317096 DIP2BQ9P265 1576 aa38.69■■■■□ 3.78
PARL-202ENST00000317096 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.68■■■■□ 3.78
PARL-202ENST00000317096 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.66■■■■□ 3.78
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PARL-202ENST00000317096 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
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PARL-202ENST00000317096 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.6■■■■□ 3.77
PARL-202ENST00000317096 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.56■■■■□ 3.76
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PARL-202ENST00000317096 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.43■■■■□ 3.74
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PARL-202ENST00000317096 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
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PARL-202ENST00000317096 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.35■■■■□ 3.73
PARL-202ENST00000317096 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.34■■■■□ 3.73
PARL-202ENST00000317096 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.3■■■■□ 3.72
PARL-202ENST00000317096 KCNH8Q96L42 1107 aa38.29■■■■□ 3.72
PARL-202ENST00000317096 KIF14Q15058 1648 aa38.27■■■■□ 3.72
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PARL-202ENST00000317096 CD109Q6YHK3 1445 aa38.15■■■■□ 3.7
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PARL-202ENST00000317096 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.01■■■■□ 3.67
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PARL-202ENST00000317096 KDM6BO15054 1643 aa37.98■■■■□ 3.67
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PARL-202ENST00000317096 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
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PARL-202ENST00000317096 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.85■■■■□ 3.65
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