RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 CEP162Q5TB80 1403 aa27.91■■■□□ 2.06
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PRAMEF20-201ENST00000316412 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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PRAMEF20-201ENST00000316412 NCOA2Q15596 1464 aa26.72■■□□□ 1.87
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PRAMEF20-201ENST00000316412 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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PRAMEF20-201ENST00000316412 ASXL2Q76L83 1435 aa26.58■■□□□ 1.84
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.56■■□□□ 1.84
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PRAMEF20-201ENST00000316412 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.54■■□□□ 1.84
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PRAMEF20-201ENST00000316412 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAPKBP1O60336 1514 aa26.52■■□□□ 1.84
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PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNH8Q96L42 1107 aa26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF20-201ENST00000316412 MIA2Q96PC5 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF20-201ENST00000316412 PREX2Q70Z35 1606 aa26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF20-201ENST00000316412 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
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PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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