RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGEF11O15085 1522 aa25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1-201ENST00000307180 JPH4Q96JJ6 628 aa25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF21BO75037 1637 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 SHROOM2Q13796 1616 aa25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1-201ENST00000307180 IQGAP2Q13576 1575 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1-201ENST00000307180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1-201ENST00000307180 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA3Q08378 1498 aa25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 ARAP1Q96P48 1450 aa25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-201ENST00000307180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-201ENST00000307180 DISP1Q96F81 1524 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-201ENST00000307180 P3H3Q8IVL6 736 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA0556O60303 1618 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-201ENST00000307180 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRGP23470 1445 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-201ENST00000307180 HRCP23327 699 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMD9Q5K651 1589 aa24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1-201ENST00000307180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-201ENST00000307180 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.83■■□□□ 1.56
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-201ENST00000307180 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-201ENST00000307180 UACAQ9BZF9 1416 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-201ENST00000307180 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CLIP1P30622 1438 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-201ENST00000307180 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP162Q5TB80 1403 aa24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC2Q92887 1545 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-201ENST00000307180 ARID3CA6NKF2 412 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA8O94911 1581 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-201ENST00000307180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-201ENST00000307180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
TSNARE1-201ENST00000307180 FMN1Q68DA7 1419 aa24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1-201ENST00000307180 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1-201ENST00000307180 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1-201ENST00000307180 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP10BO94823 1461 aa24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPKBP1O60336 1514 aa24.53■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ASXL2Q76L83 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-201ENST00000307180 HECW1Q76N89 1606 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNH8Q96L42 1107 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1-201ENST00000307180 DIP2BQ9P265 1576 aa24.39■■□□□ 1.49
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-201ENST00000307180 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-201ENST00000307180 GLI2P10070 1586 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPOAP1O95153 1857 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-201ENST00000307180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CD109Q6YHK3 1445 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF14Q15058 1648 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 APLP2Q06481 763 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TIAM1Q13009 1591 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-201ENST00000307180 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-201ENST00000307180 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP3K1Q13233 1512 aa24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PLCH2O75038 1416 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 FANCAO15360 1455 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 NCOA2Q15596 1464 aa23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms