RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.7■■■■□ 3.47
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TSNARE1-201ENST00000307180 NACADO15069 1562 aa30.45■■■□□ 2.47
TSNARE1-201ENST00000307180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.44■■■□□ 2.46
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TSNARE1-201ENST00000307180 SCRIBQ14160 1630 aa29.76■■■□□ 2.35
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TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.81■■■□□ 2.2
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TSNARE1-201ENST00000307180 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.63■■■□□ 2.17
TSNARE1-201ENST00000307180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.58■■■□□ 2.17
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TSNARE1-201ENST00000307180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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TSNARE1-201ENST00000307180 SMARCA2P51531 1590 aa28.14■■■□□ 2.1
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TSNARE1-201ENST00000307180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-201ENST00000307180 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.07■■■□□ 2.08
TSNARE1-201ENST00000307180 WIZO95785 1651 aa28.06■■■□□ 2.08
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TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.44■■□□□ 1.98
TSNARE1-201ENST00000307180 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.34■■□□□ 1.97
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.32■■□□□ 1.96
TSNARE1-201ENST00000307180 ERCC6Q03468 1493 aa27.22■■□□□ 1.95
TSNARE1-201ENST00000307180 CFTRP13569 1480 aa27.22■■□□□ 1.95
TSNARE1-201ENST00000307180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.1■■□□□ 1.93
TSNARE1-201ENST00000307180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.05■■□□□ 1.92
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM2Q13029 1718 aa27■■□□□ 1.91
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.98■■□□□ 1.91
TSNARE1-201ENST00000307180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
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TSNARE1-201ENST00000307180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR62O43379 1518 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-201ENST00000307180 CUX2O14529 1486 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-201ENST00000307180 TOPBP1Q92547 1522 aa26.64■■□□□ 1.86
TSNARE1-201ENST00000307180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1-201ENST00000307180 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.6■■□□□ 1.85
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC8Q09428 1581 aa26.58■■□□□ 1.85
TSNARE1-201ENST00000307180 CUX1P39880 1505 aa26.55■■□□□ 1.84
TSNARE1-201ENST00000307180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-201ENST00000307180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1-201ENST00000307180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNJ1O43426 1573 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-201ENST00000307180 IFT140Q96RY7 1462 aa26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1-201ENST00000307180 TOP2BQ02880 1626 aa26.36■■□□□ 1.81
TSNARE1-201ENST00000307180 SOGA1O94964 1423 aa26.35■■□□□ 1.81
TSNARE1-201ENST00000307180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.35■■□□□ 1.81
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TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-201ENST00000307180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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TSNARE1-201ENST00000307180 WDR97A6NE52 1622 aa26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.14■■□□□ 1.77
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM41Q8WV44 630 aa26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1-201ENST00000307180 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26■■□□□ 1.75
TSNARE1-201ENST00000307180 GRIN2BQ13224 1484 aa25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1-201ENST00000307180 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.75
TSNARE1-201ENST00000307180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-201ENST00000307180 FBLN2P98095 1184 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF27Q86VH2 1401 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-201ENST00000307180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-201ENST00000307180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1-201ENST00000307180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.82■■□□□ 1.72
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TSNARE1-201ENST00000307180 SYNJ2O15056 1496 aa25.76■■□□□ 1.71
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TSNARE1-201ENST00000307180 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.64■■□□□ 1.7
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TSNARE1-201ENST00000307180 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1-201ENST00000307180 EEA1Q15075 1411 aa25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP170Q5SW79 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
TSNARE1-201ENST00000307180 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP160Q12769 1436 aa25.49■■□□□ 1.67
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TSNARE1-201ENST00000307180 PRXQ9BXM0 1461 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-201ENST00000307180 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.41■■□□□ 1.66
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