RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303212.2

NRTN-201, Transcript of neurturin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRTN, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTN-201ENST00000303212 JPH4Q96JJ6 628 aa48.38■■■■■ 5.34
NRTN-201ENST00000303212 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
NRTN-201ENST00000303212 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.31■■■■■ 5.32
NRTN-201ENST00000303212 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.28■■■■■ 5.32
NRTN-201ENST00000303212 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.98■■■■■ 5.27
NRTN-201ENST00000303212 IQGAP2Q13576 1575 aa47.93■■■■■ 5.26
NRTN-201ENST00000303212 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.85■■■■■ 5.25
NRTN-201ENST00000303212 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.77■■■■■ 5.24
NRTN-201ENST00000303212 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.73■■■■■ 5.23
NRTN-201ENST00000303212 PTPRGP23470 1445 aa47.72■■■■■ 5.23
NRTN-201ENST00000303212 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.7■■■■■ 5.23
NRTN-201ENST00000303212 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.62■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 MAPKBP1O60336 1514 aa47.61■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 PRXQ9BXM0 1461 aa47.6■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.59■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 DISP1Q96F81 1524 aa47.58■■■■■ 5.21
NRTN-201ENST00000303212 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.52■■■■■ 5.2
NRTN-201ENST00000303212 KIAA0556O60303 1618 aa47.48■■■■■ 5.19
NRTN-201ENST00000303212 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.46■■■■■ 5.19
NRTN-201ENST00000303212 EEA1Q15075 1411 aa47.4■■■■■ 5.18
NRTN-201ENST00000303212 ABCC2Q92887 1545 aa47.4■■■■■ 5.18
NRTN-201ENST00000303212 UACAQ9BZF9 1416 aa47.39■■■■■ 5.18
NRTN-201ENST00000303212 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.38■■■■■ 5.18
NRTN-201ENST00000303212 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.38■■■■■ 5.18
NRTN-201ENST00000303212 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.38■■■■■ 5.17
NRTN-201ENST00000303212 GOLGA3Q08378 1498 aa47.37■■■■■ 5.17
NRTN-201ENST00000303212 DIP2BQ9P265 1576 aa47.37■■■■■ 5.17
NRTN-201ENST00000303212 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.17■■■■■ 5.14
NRTN-201ENST00000303212 ASXL2Q76L83 1435 aa47.15■■■■■ 5.14
NRTN-201ENST00000303212 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.14■■■■■ 5.14
NRTN-201ENST00000303212 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
NRTN-201ENST00000303212 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
NRTN-201ENST00000303212 ABCA8O94911 1581 aa46.98■■■■■ 5.11
NRTN-201ENST00000303212 GLI2P10070 1586 aa46.98■■■■■ 5.11
NRTN-201ENST00000303212 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.97■■■■■ 5.11
NRTN-201ENST00000303212 TSPOAP1O95153 1857 aa46.96■■■■■ 5.11
NRTN-201ENST00000303212 KIF21BO75037 1637 aa46.93■■■■■ 5.1
NRTN-201ENST00000303212 SAMD9Q5K651 1589 aa46.91■■■■■ 5.1
NRTN-201ENST00000303212 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
NRTN-201ENST00000303212 P3H3Q8IVL6 736 aa46.86■■■■■ 5.09
NRTN-201ENST00000303212 KDM6BO15054 1643 aa46.84■■■■■ 5.09
NRTN-201ENST00000303212 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.82■■■■■ 5.09
NRTN-201ENST00000303212 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.72■■■■■ 5.07
NRTN-201ENST00000303212 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
NRTN-201ENST00000303212 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
NRTN-201ENST00000303212 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.64■■■■■ 5.06
NRTN-201ENST00000303212 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.63■■■■■ 5.06
NRTN-201ENST00000303212 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.63■■■■■ 5.05
NRTN-201ENST00000303212 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.58■■■■■ 5.05
NRTN-201ENST00000303212 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
NRTN-201ENST00000303212 ATP10BO94823 1461 aa46.56■■■■■ 5.04
NRTN-201ENST00000303212 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
NRTN-201ENST00000303212 ARID3CA6NKF2 412 aa46.53■■■■■ 5.04
NRTN-201ENST00000303212 KCNH8Q96L42 1107 aa46.53■■■■■ 5.04
NRTN-201ENST00000303212 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.52■■■■■ 5.04
NRTN-201ENST00000303212 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.48■■■■■ 5.03
NRTN-201ENST00000303212 CD109Q6YHK3 1445 aa46.46■■■■■ 5.03
NRTN-201ENST00000303212 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.41■■■■■ 5.02
NRTN-201ENST00000303212 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
NRTN-201ENST00000303212 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
NRTN-201ENST00000303212 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
NRTN-201ENST00000303212 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
NRTN-201ENST00000303212 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.25■■■■■ 4.99
NRTN-201ENST00000303212 FMN1Q68DA7 1419 aa46.2■■■■■ 4.99
NRTN-201ENST00000303212 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.19■■■■■ 4.99
NRTN-201ENST00000303212 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.15■■■■■ 4.98
NRTN-201ENST00000303212 HECW1Q76N89 1606 aa46.08■■■■■ 4.97
NRTN-201ENST00000303212 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.05■■■■■ 4.96
NRTN-201ENST00000303212 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
NRTN-201ENST00000303212 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.02■■■■■ 4.96
NRTN-201ENST00000303212 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
NRTN-201ENST00000303212 NEO1Q92859 1461 aa45.98■■■■■ 4.95
NRTN-201ENST00000303212 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.95■■■■■ 4.95
NRTN-201ENST00000303212 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.94
NRTN-201ENST00000303212 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
NRTN-201ENST00000303212 ADGRL1O94910 1474 aa45.85■■■■■ 4.93
NRTN-201ENST00000303212 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.83■■■■■ 4.93
NRTN-201ENST00000303212 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.82■■■■■ 4.93
NRTN-201ENST00000303212 FANCAO15360 1455 aa45.75■■■■■ 4.91
NRTN-201ENST00000303212 CLIP1P30622 1438 aa45.73■■■■■ 4.91
NRTN-201ENST00000303212 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
NRTN-201ENST00000303212 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.71■■■■■ 4.91
NRTN-201ENST00000303212 RAPGEF3O95398 923 aa45.69■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 AKNAQ7Z591 1439 aa45.69■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.68■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 KIF14Q15058 1648 aa45.67■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.66■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.64■■■■■ 4.9
NRTN-201ENST00000303212 PLCH2O75038 1416 aa45.61■■■■■ 4.89
NRTN-201ENST00000303212 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.61■■■■■ 4.89
NRTN-201ENST00000303212 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.59■■■■■ 4.89
NRTN-201ENST00000303212 RICTORQ6R327 1708 aa45.55■■■■■ 4.88
NRTN-201ENST00000303212 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.46■■■■■ 4.87
NRTN-201ENST00000303212 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.45■■■■■ 4.87
NRTN-201ENST00000303212 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.42■■■■■ 4.86
NRTN-201ENST00000303212 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.41■■■■■ 4.86
NRTN-201ENST00000303212 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.41■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms