RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301323.7

RECQL4-201, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-201ENST00000301323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
RECQL4-201ENST00000301323 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.25■■■□□ 2.11
RECQL4-201ENST00000301323 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.25■■■□□ 2.11
RECQL4-201ENST00000301323 JPH4Q96JJ6 628 aa28.21■■■□□ 2.11
RECQL4-201ENST00000301323 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.09■■■□□ 2.09
RECQL4-201ENST00000301323 IQGAP2Q13576 1575 aa28.09■■■□□ 2.09
RECQL4-201ENST00000301323 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.98■■■□□ 2.07
RECQL4-201ENST00000301323 PRXQ9BXM0 1461 aa27.96■■■□□ 2.07
RECQL4-201ENST00000301323 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.93■■■□□ 2.06
RECQL4-201ENST00000301323 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.93■■■□□ 2.06
RECQL4-201ENST00000301323 DISP1Q96F81 1524 aa27.92■■■□□ 2.06
RECQL4-201ENST00000301323 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
RECQL4-201ENST00000301323 MAPKBP1O60336 1514 aa27.86■■■□□ 2.05
RECQL4-201ENST00000301323 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.86■■■□□ 2.05
RECQL4-201ENST00000301323 KIAA0556O60303 1618 aa27.85■■■□□ 2.05
RECQL4-201ENST00000301323 PTPRGP23470 1445 aa27.84■■■□□ 2.05
RECQL4-201ENST00000301323 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.83■■■□□ 2.05
RECQL4-201ENST00000301323 EEA1Q15075 1411 aa27.78■■■□□ 2.04
RECQL4-201ENST00000301323 DIP2BQ9P265 1576 aa27.73■■■□□ 2.03
RECQL4-201ENST00000301323 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.73■■■□□ 2.03
RECQL4-201ENST00000301323 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.73■■■□□ 2.03
RECQL4-201ENST00000301323 ABCC2Q92887 1545 aa27.72■■■□□ 2.03
RECQL4-201ENST00000301323 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.71■■■□□ 2.03
RECQL4-201ENST00000301323 UACAQ9BZF9 1416 aa27.69■■■□□ 2.02
RECQL4-201ENST00000301323 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
RECQL4-201ENST00000301323 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
RECQL4-201ENST00000301323 GOLGA3Q08378 1498 aa27.68■■■□□ 2.02
RECQL4-201ENST00000301323 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.61■■■□□ 2.01
RECQL4-201ENST00000301323 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.59■■■□□ 2.01
RECQL4-201ENST00000301323 KIF21BO75037 1637 aa27.59■■■□□ 2.01
RECQL4-201ENST00000301323 SAMD9Q5K651 1589 aa27.57■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.56■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 ASXL2Q76L83 1435 aa27.56■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.56■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 ABCA8O94911 1581 aa27.56■■■□□ 2
RECQL4-201ENST00000301323 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
RECQL4-201ENST00000301323 GLI2P10070 1586 aa27.48■■□□□ 1.99
RECQL4-201ENST00000301323 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
RECQL4-201ENST00000301323 TSPOAP1O95153 1857 aa27.42■■□□□ 1.98
RECQL4-201ENST00000301323 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
RECQL4-201ENST00000301323 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RECQL4-201ENST00000301323 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.39■■□□□ 1.98
RECQL4-201ENST00000301323 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.38■■□□□ 1.97
RECQL4-201ENST00000301323 P3H3Q8IVL6 736 aa27.35■■□□□ 1.97
RECQL4-201ENST00000301323 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.35■■□□□ 1.97
RECQL4-201ENST00000301323 KDM6BO15054 1643 aa27.33■■□□□ 1.97
RECQL4-201ENST00000301323 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.33■■□□□ 1.97
RECQL4-201ENST00000301323 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
RECQL4-201ENST00000301323 ATP10BO94823 1461 aa27.26■■□□□ 1.95
RECQL4-201ENST00000301323 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RECQL4-201ENST00000301323 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.22■■□□□ 1.95
RECQL4-201ENST00000301323 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
RECQL4-201ENST00000301323 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.19■■□□□ 1.94
RECQL4-201ENST00000301323 ARID3CA6NKF2 412 aa27.16■■□□□ 1.94
RECQL4-201ENST00000301323 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
RECQL4-201ENST00000301323 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.15■■□□□ 1.94
RECQL4-201ENST00000301323 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.94
RECQL4-201ENST00000301323 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.13■■□□□ 1.93
RECQL4-201ENST00000301323 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
RECQL4-201ENST00000301323 CD109Q6YHK3 1445 aa27.1■■□□□ 1.93
RECQL4-201ENST00000301323 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.1■■□□□ 1.93
RECQL4-201ENST00000301323 KCNH8Q96L42 1107 aa27.08■■□□□ 1.93
RECQL4-201ENST00000301323 FMN1Q68DA7 1419 aa27.03■■□□□ 1.92
RECQL4-201ENST00000301323 HECW1Q76N89 1606 aa27.01■■□□□ 1.92
RECQL4-201ENST00000301323 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RECQL4-201ENST00000301323 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
RECQL4-201ENST00000301323 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
RECQL4-201ENST00000301323 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.91■■□□□ 1.9
RECQL4-201ENST00000301323 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.9■■□□□ 1.9
RECQL4-201ENST00000301323 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
RECQL4-201ENST00000301323 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.89■■□□□ 1.9
RECQL4-201ENST00000301323 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RECQL4-201ENST00000301323 NEO1Q92859 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
RECQL4-201ENST00000301323 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.87■■□□□ 1.89
RECQL4-201ENST00000301323 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.87■■□□□ 1.89
RECQL4-201ENST00000301323 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.84■■□□□ 1.89
RECQL4-201ENST00000301323 CLIP1P30622 1438 aa26.82■■□□□ 1.88
RECQL4-201ENST00000301323 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.81■■□□□ 1.88
RECQL4-201ENST00000301323 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.8■■□□□ 1.88
RECQL4-201ENST00000301323 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.79■■□□□ 1.88
RECQL4-201ENST00000301323 KIF14Q15058 1648 aa26.76■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 ADGRL1O94910 1474 aa26.76■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.76■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 FANCAO15360 1455 aa26.74■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.74■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 RICTORQ6R327 1708 aa26.7■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.7■■□□□ 1.87
RECQL4-201ENST00000301323 PLCH2O75038 1416 aa26.68■■□□□ 1.86
RECQL4-201ENST00000301323 AKNAQ7Z591 1439 aa26.68■■□□□ 1.86
RECQL4-201ENST00000301323 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RECQL4-201ENST00000301323 RAPGEF3O95398 923 aa26.65■■□□□ 1.86
RECQL4-201ENST00000301323 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RECQL4-201ENST00000301323 CEP162Q5TB80 1403 aa26.64■■□□□ 1.85
RECQL4-201ENST00000301323 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.63■■□□□ 1.85
RECQL4-201ENST00000301323 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.63■■□□□ 1.85
RECQL4-201ENST00000301323 PREX2Q70Z35 1606 aa26.57■■□□□ 1.84
RECQL4-201ENST00000301323 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms