RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298316.6

ARF6-201, Transcript of ADP ribosylation factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARF6, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6-201ENST00000298316 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ARF6-201ENST00000298316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
ARF6-201ENST00000298316 IGF1RP08069 1367 aa22.21■■□□□ 1.15
ARF6-201ENST00000298316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.21■■□□□ 1.15
ARF6-201ENST00000298316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
ARF6-201ENST00000298316 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.19■■□□□ 1.14
ARF6-201ENST00000298316 KCNH8Q96L42 1107 aa22.17■■□□□ 1.14
ARF6-201ENST00000298316 TONSLQ96HA7 1378 aa22.14■■□□□ 1.14
ARF6-201ENST00000298316 CFTRP13569 1480 aa22.13■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 NEFLP07196 543 aa22.13■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.13■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.11■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 BCANQ96GW7 911 aa22.08■■□□□ 1.13
ARF6-201ENST00000298316 CUX1P39880 1505 aa22.08■■□□□ 1.12
ARF6-201ENST00000298316 ANP32CO43423 234 aa22.05■■□□□ 1.12
ARF6-201ENST00000298316 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.04■■□□□ 1.12
ARF6-201ENST00000298316 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.01■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 FOXD1Q16676 465 aa21.99■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 KIF21BO75037 1637 aa21.97■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 TSPY4P0CV99 314 aa21.97■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 TSPY10P0CW01 314 aa21.97■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 HMGXB3Q12766 1538 aa21.96■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 ARAP1Q96P48 1450 aa21.95■■□□□ 1.11
ARF6-201ENST00000298316 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.93■■□□□ 1.1
ARF6-201ENST00000298316 TOP2BQ02880 1626 aa21.92■■□□□ 1.1
ARF6-201ENST00000298316 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ARF6-201ENST00000298316 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.89■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.88■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 PRXQ9BXM0 1461 aa21.88■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.84■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 RGL3Q3MIN7 710 aa21.84■■□□□ 1.09
ARF6-201ENST00000298316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.82■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 FMN1Q68DA7 1419 aa21.81■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 JPH4Q96JJ6 628 aa21.81■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 TOPBP1Q92547 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
ARF6-201ENST00000298316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.77■■□□□ 1.07
ARF6-201ENST00000298316 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ARF6-201ENST00000298316 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.76■■□□□ 1.07
ARF6-201ENST00000298316 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.68■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.67■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.66■■□□□ 1.06
ARF6-201ENST00000298316 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
ARF6-201ENST00000298316 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.6■■□□□ 1.05
ARF6-201ENST00000298316 FKBP8Q14318 412 aa21.59■■□□□ 1.05
ARF6-201ENST00000298316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.58■■□□□ 1.05
ARF6-201ENST00000298316 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.58■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 PKD2Q13563 968 aa21.57■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 MRS2Q9HD23 443 aa21.55■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.54■■□□□ 1.04
ARF6-201ENST00000298316 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.51■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.5■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.48■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.47■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.46■■□□□ 1.03
ARF6-201ENST00000298316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.45■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 GRIN2BQ13224 1484 aa21.45■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.45■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.44■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 NUP155O75694 1391 aa21.43■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 TMC1Q8TDI8 760 aa21.42■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 PTPRGP23470 1445 aa21.41■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 BCL11AQ9H165 835 aa21.4■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.4■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 NCOA2Q15596 1464 aa21.39■■□□□ 1.02
ARF6-201ENST00000298316 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.38■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.38■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.36■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.36■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 PRDM2Q13029 1718 aa21.36■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.33■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 TIAM1Q13009 1591 aa21.33■■□□□ 1.01
ARF6-201ENST00000298316 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.32■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 GGT6Q6P531 493 aa21.32■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.3■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.29■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.29■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ARF6-201ENST00000298316 IFT140Q96RY7 1462 aa21.27■■□□□ 1
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