RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297720.9

LETM2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LETM2, Length 1,693 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2-201ENST00000297720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 IQGAP2Q13576 1575 aa26.29■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 NUP160Q12769 1436 aa26.29■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.28■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.28■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 CEP170Q5SW79 1584 aa26.28■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
LETM2-201ENST00000297720 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.26■■□□□ 1.79
LETM2-201ENST00000297720 CHD1O14646 1710 aa26.25■■□□□ 1.79
LETM2-201ENST00000297720 SAMD9Q5K651 1589 aa26.24■■□□□ 1.79
LETM2-201ENST00000297720 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.2■■□□□ 1.78
LETM2-201ENST00000297720 FBLN2P98095 1184 aa26.2■■□□□ 1.78
LETM2-201ENST00000297720 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.09■■□□□ 1.77
LETM2-201ENST00000297720 DISP1Q96F81 1524 aa26.05■■□□□ 1.76
LETM2-201ENST00000297720 KIAA0556O60303 1618 aa26.03■■□□□ 1.76
LETM2-201ENST00000297720 P3H3Q8IVL6 736 aa26.03■■□□□ 1.76
LETM2-201ENST00000297720 FMN1Q68DA7 1419 aa26.01■■□□□ 1.75
LETM2-201ENST00000297720 JPH4Q96JJ6 628 aa25.99■■□□□ 1.75
LETM2-201ENST00000297720 SHROOM2Q13796 1616 aa25.99■■□□□ 1.75
LETM2-201ENST00000297720 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.98■■□□□ 1.75
LETM2-201ENST00000297720 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
LETM2-201ENST00000297720 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.95■■□□□ 1.74
LETM2-201ENST00000297720 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.94■■□□□ 1.74
LETM2-201ENST00000297720 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.91■■□□□ 1.74
LETM2-201ENST00000297720 MAP3K1Q13233 1512 aa25.91■■□□□ 1.74
LETM2-201ENST00000297720 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LETM2-201ENST00000297720 APLP2Q06481 763 aa25.85■■□□□ 1.73
LETM2-201ENST00000297720 TIAM1Q13009 1591 aa25.83■■□□□ 1.73
LETM2-201ENST00000297720 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.82■■□□□ 1.72
LETM2-201ENST00000297720 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
LETM2-201ENST00000297720 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.79■■□□□ 1.72
LETM2-201ENST00000297720 HECW1Q76N89 1606 aa25.78■■□□□ 1.72
LETM2-201ENST00000297720 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 OSCARQ8IYS5 282 aa25.75■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.74■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.73■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.71■■□□□ 1.71
LETM2-201ENST00000297720 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 ABCA8O94911 1581 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.67■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 PTPRGP23470 1445 aa25.67■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
LETM2-201ENST00000297720 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
LETM2-201ENST00000297720 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.6■■□□□ 1.69
LETM2-201ENST00000297720 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
LETM2-201ENST00000297720 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.55■■□□□ 1.68
LETM2-201ENST00000297720 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.55■■□□□ 1.68
LETM2-201ENST00000297720 UACAQ9BZF9 1416 aa25.55■■□□□ 1.68
LETM2-201ENST00000297720 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.52■■□□□ 1.68
LETM2-201ENST00000297720 ABCC2Q92887 1545 aa25.5■■□□□ 1.67
LETM2-201ENST00000297720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.49■■□□□ 1.67
LETM2-201ENST00000297720 ATP10BO94823 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
LETM2-201ENST00000297720 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
LETM2-201ENST00000297720 ARHGEF11O15085 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
LETM2-201ENST00000297720 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.43■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 ARID3CA6NKF2 412 aa25.42■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 NCOA2Q15596 1464 aa25.42■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LETM2-201ENST00000297720 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.37■■□□□ 1.65
LETM2-201ENST00000297720 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.37■■□□□ 1.65
LETM2-201ENST00000297720 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
LETM2-201ENST00000297720 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
LETM2-201ENST00000297720 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.34■■□□□ 1.65
LETM2-201ENST00000297720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.31■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.29■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.28■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 KIF14Q15058 1648 aa25.28■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
LETM2-201ENST00000297720 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
LETM2-201ENST00000297720 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
LETM2-201ENST00000297720 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.26■■□□□ 1.63
LETM2-201ENST00000297720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.22■■□□□ 1.63
LETM2-201ENST00000297720 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
LETM2-201ENST00000297720 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LETM2-201ENST00000297720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.18■■□□□ 1.62
LETM2-201ENST00000297720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.17■■□□□ 1.62
LETM2-201ENST00000297720 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LETM2-201ENST00000297720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.14■■□□□ 1.61
LETM2-201ENST00000297720 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.1■■□□□ 1.61
LETM2-201ENST00000297720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
LETM2-201ENST00000297720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
LETM2-201ENST00000297720 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.08■■□□□ 1.61
LETM2-201ENST00000297720 ASXL2Q76L83 1435 aa25.06■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 PREX2Q70Z35 1606 aa25.05■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.03■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.03■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LETM2-201ENST00000297720 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.01■■□□□ 1.59
LETM2-201ENST00000297720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25■■□□□ 1.59
LETM2-201ENST00000297720 MAPKBP1O60336 1514 aa24.99■■□□□ 1.59
LETM2-201ENST00000297720 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.98■■□□□ 1.59
LETM2-201ENST00000297720 KCNH8Q96L42 1107 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms