RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 PBRM1Q86U86 1689 aa32.85■■■□□ 2.85
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C6orf136-201ENST00000293604 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.77■■■□□ 2.84
C6orf136-201ENST00000293604 MAP3K1Q13233 1512 aa32.76■■■□□ 2.83
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C6orf136-201ENST00000293604 GRIN2BQ13224 1484 aa32.73■■■□□ 2.83
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C6orf136-201ENST00000293604 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.53■■■□□ 2.8
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C6orf136-201ENST00000293604 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.46■■■□□ 2.79
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C6orf136-201ENST00000293604 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
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C6orf136-201ENST00000293604 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.27■■■□□ 2.76
C6orf136-201ENST00000293604 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
C6orf136-201ENST00000293604 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.17■■■□□ 2.74
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.15■■■□□ 2.74
C6orf136-201ENST00000293604 HECW1Q76N89 1606 aa32.15■■■□□ 2.74
C6orf136-201ENST00000293604 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.15■■■□□ 2.74
C6orf136-201ENST00000293604 KIAA0556O60303 1618 aa32.12■■■□□ 2.73
C6orf136-201ENST00000293604 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
C6orf136-201ENST00000293604 CEP170Q5SW79 1584 aa32.09■■■□□ 2.73
C6orf136-201ENST00000293604 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.09■■■□□ 2.73
C6orf136-201ENST00000293604 DISP1Q96F81 1524 aa32.08■■■□□ 2.73
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C6orf136-201ENST00000293604 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.07■■■□□ 2.72
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C6orf136-201ENST00000293604 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.9■■■□□ 2.7
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C6orf136-201ENST00000293604 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.8■■■□□ 2.68
C6orf136-201ENST00000293604 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
C6orf136-201ENST00000293604 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.76■■■□□ 2.68
C6orf136-201ENST00000293604 CHD1O14646 1710 aa31.74■■■□□ 2.67
C6orf136-201ENST00000293604 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.71■■■□□ 2.67
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C6orf136-201ENST00000293604 HFM1A2PYH4 1435 aa31.57■■■□□ 2.64
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C6orf136-201ENST00000293604 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.41■■■□□ 2.62
C6orf136-201ENST00000293604 ATP10BO94823 1461 aa31.4■■■□□ 2.62
C6orf136-201ENST00000293604 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.38■■■□□ 2.61
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C6orf136-201ENST00000293604 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
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