RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.08■■■■□ 3.69
GFRA4-201ENST00000290417 JPH4Q96JJ6 628 aa38.08■■■■□ 3.69
GFRA4-201ENST00000290417 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.08■■■■□ 3.69
GFRA4-201ENST00000290417 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.04■■■■□ 3.68
GFRA4-201ENST00000290417 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
GFRA4-201ENST00000290417 PRXQ9BXM0 1461 aa37.91■■■■□ 3.66
GFRA4-201ENST00000290417 IQGAP2Q13576 1575 aa37.9■■■■□ 3.66
GFRA4-201ENST00000290417 EEA1Q15075 1411 aa37.88■■■■□ 3.65
GFRA4-201ENST00000290417 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.87■■■■□ 3.65
GFRA4-201ENST00000290417 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
GFRA4-201ENST00000290417 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.8■■■■□ 3.64
GFRA4-201ENST00000290417 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.68■■■■□ 3.62
GFRA4-201ENST00000290417 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.66■■■■□ 3.62
GFRA4-201ENST00000290417 DISP1Q96F81 1524 aa37.6■■■■□ 3.61
GFRA4-201ENST00000290417 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
GFRA4-201ENST00000290417 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.57■■■■□ 3.6
GFRA4-201ENST00000290417 PTPRGP23470 1445 aa37.55■■■■□ 3.6
GFRA4-201ENST00000290417 KIF21BO75037 1637 aa37.54■■■■□ 3.6
GFRA4-201ENST00000290417 KIAA0556O60303 1618 aa37.54■■■■□ 3.6
GFRA4-201ENST00000290417 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
GFRA4-201ENST00000290417 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.48■■■■□ 3.59
GFRA4-201ENST00000290417 GOLGA3Q08378 1498 aa37.45■■■■□ 3.59
GFRA4-201ENST00000290417 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
GFRA4-201ENST00000290417 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.36■■■■□ 3.57
GFRA4-201ENST00000290417 UACAQ9BZF9 1416 aa37.3■■■■□ 3.56
GFRA4-201ENST00000290417 SAMD9Q5K651 1589 aa37.26■■■■□ 3.56
GFRA4-201ENST00000290417 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 P3H3Q8IVL6 736 aa37.26■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.25■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 ABCC2Q92887 1545 aa37.25■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 MAPKBP1O60336 1514 aa37.22■■■■□ 3.55
GFRA4-201ENST00000290417 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.16■■■■□ 3.54
GFRA4-201ENST00000290417 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.14■■■■□ 3.54
GFRA4-201ENST00000290417 ABCA8O94911 1581 aa37.12■■■■□ 3.53
GFRA4-201ENST00000290417 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.09■■■■□ 3.53
GFRA4-201ENST00000290417 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
GFRA4-201ENST00000290417 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.06■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.06■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.04■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 DIP2BQ9P265 1576 aa37.03■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.02■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 ASXL2Q76L83 1435 aa37.01■■■■□ 3.52
GFRA4-201ENST00000290417 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.94■■■■□ 3.5
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.88■■■■□ 3.49
GFRA4-201ENST00000290417 ARID3CA6NKF2 412 aa36.86■■■■□ 3.49
GFRA4-201ENST00000290417 TSPOAP1O95153 1857 aa36.82■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 ATP10BO94823 1461 aa36.81■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.81■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 GLI2P10070 1586 aa36.79■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
GFRA4-201ENST00000290417 FMN1Q68DA7 1419 aa36.71■■■■□ 3.47
GFRA4-201ENST00000290417 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
GFRA4-201ENST00000290417 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
GFRA4-201ENST00000290417 KCNH8Q96L42 1107 aa36.67■■■■□ 3.46
GFRA4-201ENST00000290417 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.65■■■■□ 3.46
GFRA4-201ENST00000290417 CLIP1P30622 1438 aa36.63■■■■□ 3.45
GFRA4-201ENST00000290417 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
GFRA4-201ENST00000290417 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
GFRA4-201ENST00000290417 HECW1Q76N89 1606 aa36.59■■■■□ 3.45
GFRA4-201ENST00000290417 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.55■■■■□ 3.44
GFRA4-201ENST00000290417 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
GFRA4-201ENST00000290417 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.53■■■■□ 3.44
GFRA4-201ENST00000290417 KDM6BO15054 1643 aa36.48■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 CD109Q6YHK3 1445 aa36.48■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.48■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.46■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 CEP162Q5TB80 1403 aa36.46■■■■□ 3.43
GFRA4-201ENST00000290417 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.45■■■■□ 3.42
GFRA4-201ENST00000290417 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.44■■■■□ 3.42
GFRA4-201ENST00000290417 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.42■■■■□ 3.42
GFRA4-201ENST00000290417 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.39■■■■□ 3.42
GFRA4-201ENST00000290417 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
GFRA4-201ENST00000290417 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.3■■■■□ 3.4
GFRA4-201ENST00000290417 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
GFRA4-201ENST00000290417 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
GFRA4-201ENST00000290417 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.24■■■■□ 3.39
GFRA4-201ENST00000290417 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
GFRA4-201ENST00000290417 KIF14Q15058 1648 aa36.18■■■■□ 3.38
GFRA4-201ENST00000290417 NEO1Q92859 1461 aa36.11■■■■□ 3.37
GFRA4-201ENST00000290417 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.08■■■■□ 3.37
GFRA4-201ENST00000290417 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.08■■■■□ 3.37
GFRA4-201ENST00000290417 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.08■■■■□ 3.37
GFRA4-201ENST00000290417 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.06■■■■□ 3.36
GFRA4-201ENST00000290417 FANCAO15360 1455 aa36.05■■■■□ 3.36
GFRA4-201ENST00000290417 PLCH2O75038 1416 aa36.02■■■■□ 3.36
GFRA4-201ENST00000290417 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.01■■■■□ 3.35
GFRA4-201ENST00000290417 AKNAQ7Z591 1439 aa35.98■■■■□ 3.35
GFRA4-201ENST00000290417 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.92■■■■□ 3.34
GFRA4-201ENST00000290417 RAPGEF3O95398 923 aa35.92■■■■□ 3.34
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.91■■■■□ 3.34
GFRA4-201ENST00000290417 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.9■■■■□ 3.34
GFRA4-201ENST00000290417 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.9■■■■□ 3.34
GFRA4-201ENST00000290417 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.88■■■■□ 3.33
GFRA4-201ENST00000290417 PREX2Q70Z35 1606 aa35.88■■■■□ 3.33
GFRA4-201ENST00000290417 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
GFRA4-201ENST00000290417 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.6 ms