RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.82■■■■■ 4.12
PPP4C-201ENST00000279387 JPH4Q96JJ6 628 aa40.81■■■■■ 4.12
PPP4C-201ENST00000279387 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.79■■■■■ 4.12
PPP4C-201ENST00000279387 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-201ENST00000279387 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PPP4C-201ENST00000279387 PRXQ9BXM0 1461 aa40.6■■■■■ 4.09
PPP4C-201ENST00000279387 IQGAP2Q13576 1575 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP4C-201ENST00000279387 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP4C-201ENST00000279387 EEA1Q15075 1411 aa40.49■■■■■ 4.07
PPP4C-201ENST00000279387 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP4C-201ENST00000279387 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
PPP4C-201ENST00000279387 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.34■■■■■ 4.05
PPP4C-201ENST00000279387 DISP1Q96F81 1524 aa40.32■■■■■ 4.05
PPP4C-201ENST00000279387 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.32■■■■■ 4.05
PPP4C-201ENST00000279387 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
PPP4C-201ENST00000279387 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.27■■■■■ 4.04
PPP4C-201ENST00000279387 PTPRGP23470 1445 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP4C-201ENST00000279387 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA0556O60303 1618 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP4C-201ENST00000279387 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.2■■■■■ 4.03
PPP4C-201ENST00000279387 KIF21BO75037 1637 aa40.18■■■■■ 4.02
PPP4C-201ENST00000279387 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
PPP4C-201ENST00000279387 GOLGA3Q08378 1498 aa40.06■■■■■ 4
PPP4C-201ENST00000279387 P3H3Q8IVL6 736 aa40.04■■■■■ 4
PPP4C-201ENST00000279387 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
PPP4C-201ENST00000279387 UACAQ9BZF9 1416 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP4C-201ENST00000279387 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PPP4C-201ENST00000279387 SAMD9Q5K651 1589 aa39.9■■■■□ 3.98
PPP4C-201ENST00000279387 ABCC2Q92887 1545 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP4C-201ENST00000279387 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP4C-201ENST00000279387 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4C-201ENST00000279387 MAPKBP1O60336 1514 aa39.84■■■■□ 3.97
PPP4C-201ENST00000279387 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.82■■■■□ 3.97
PPP4C-201ENST00000279387 ABCA8O94911 1581 aa39.76■■■■□ 3.96
PPP4C-201ENST00000279387 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.76■■■■□ 3.95
PPP4C-201ENST00000279387 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-201ENST00000279387 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4C-201ENST00000279387 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4C-201ENST00000279387 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4C-201ENST00000279387 DIP2BQ9P265 1576 aa39.69■■■■□ 3.94
PPP4C-201ENST00000279387 ARID3CA6NKF2 412 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP4C-201ENST00000279387 ASXL2Q76L83 1435 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP4C-201ENST00000279387 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.65■■■■□ 3.94
PPP4C-201ENST00000279387 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.58■■■■□ 3.93
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.53■■■■□ 3.92
PPP4C-201ENST00000279387 TSPOAP1O95153 1857 aa39.53■■■■□ 3.92
PPP4C-201ENST00000279387 ATP10BO94823 1461 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-201ENST00000279387 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
PPP4C-201ENST00000279387 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.43■■■■□ 3.9
PPP4C-201ENST00000279387 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-201ENST00000279387 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
PPP4C-201ENST00000279387 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
PPP4C-201ENST00000279387 KCNH8Q96L42 1107 aa39.38■■■■□ 3.89
PPP4C-201ENST00000279387 GLI2P10070 1586 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-201ENST00000279387 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-201ENST00000279387 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.28■■■■□ 3.88
PPP4C-201ENST00000279387 FMN1Q68DA7 1419 aa39.28■■■■□ 3.88
PPP4C-201ENST00000279387 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
PPP4C-201ENST00000279387 CLIP1P30622 1438 aa39.26■■■■□ 3.88
PPP4C-201ENST00000279387 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.26■■■■□ 3.87
PPP4C-201ENST00000279387 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-201ENST00000279387 HECW1Q76N89 1606 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4C-201ENST00000279387 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 KDM6BO15054 1643 aa39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 CEP162Q5TB80 1403 aa39.09■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 CD109Q6YHK3 1445 aa39.09■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.07■■■■□ 3.85
PPP4C-201ENST00000279387 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-201ENST00000279387 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.01■■■■□ 3.84
PPP4C-201ENST00000279387 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39■■■■□ 3.83
PPP4C-201ENST00000279387 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.95■■■■□ 3.83
PPP4C-201ENST00000279387 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
PPP4C-201ENST00000279387 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4C-201ENST00000279387 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.815e-11■■□□□ 12.7
PPP4C-201ENST00000279387 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.87■■■■□ 3.81
PPP4C-201ENST00000279387 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
PPP4C-201ENST00000279387 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.82■■■■□ 3.8
PPP4C-201ENST00000279387 KIF14Q15058 1648 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP4C-201ENST00000279387 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
PPP4C-201ENST00000279387 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.64■■■■□ 3.78
PPP4C-201ENST00000279387 NEO1Q92859 1461 aa38.64■■■■□ 3.78
PPP4C-201ENST00000279387 FANCAO15360 1455 aa38.63■■■■□ 3.77
PPP4C-201ENST00000279387 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.61■■■■□ 3.77
PPP4C-201ENST00000279387 PLCH2O75038 1416 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP4C-201ENST00000279387 RAPGEF3O95398 923 aa38.57■■■■□ 3.77
PPP4C-201ENST00000279387 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.57■■■■□ 3.77
PPP4C-201ENST00000279387 AKNAQ7Z591 1439 aa38.56■■■■□ 3.76
PPP4C-201ENST00000279387 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.56■■■■□ 3.76
PPP4C-201ENST00000279387 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.55■■■■□ 3.76
PPP4C-201ENST00000279387 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-201ENST00000279387 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.49■■■■□ 3.75
PPP4C-201ENST00000279387 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.48■■■■□ 3.75
PPP4C-201ENST00000279387 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-201ENST00000279387 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-201ENST00000279387 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
PPP4C-201ENST00000279387 ADGRL1O94910 1474 aa38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms