RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
AFG3L2-201ENST00000269143 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.13■■□□□ 1.29
AFG3L2-201ENST00000269143 CFTRP13569 1480 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-201ENST00000269143 ANP32CO43423 234 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L2-201ENST00000269143 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L2-201ENST00000269143 PRDM2Q13029 1718 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L2-201ENST00000269143 NBR1Q14596 966 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L2-201ENST00000269143 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
AFG3L2-201ENST00000269143 ARAP1Q96P48 1450 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2-201ENST00000269143 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2-201ENST00000269143 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L2-201ENST00000269143 CCER2I3L3R5 266 aa22.95■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 WDR97A6NE52 1622 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF27Q86VH2 1401 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 P3H3Q8IVL6 736 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AFG3L2-201ENST00000269143 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 MAPKBP1O60336 1514 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2-201ENST00000269143 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L2-201ENST00000269143 CUX2O14529 1486 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L2-201ENST00000269143 IGF1RP08069 1367 aa22.75■■□□□ 1.23
AFG3L2-201ENST00000269143 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2-201ENST00000269143 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2-201ENST00000269143 IL27Q8NEV9 243 aa22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2-201ENST00000269143 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2-201ENST00000269143 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.63■■□□□ 1.21
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC184Q52MB2 194 aa22.6■■□□□ 1.21
AFG3L2-201ENST00000269143 MAP3K1Q13233 1512 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L2-201ENST00000269143 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.58■■□□□ 1.21
AFG3L2-201ENST00000269143 TIAM1Q13009 1591 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 TONSLQ96HA7 1378 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2-201ENST00000269143 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.5■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.49■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.49■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.48■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 TOPBP1Q92547 1522 aa22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2-201ENST00000269143 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 MRS2Q9HD23 443 aa22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 NESP48681 1621 aa22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.41■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 ARID3CA6NKF2 412 aa22.39■■□□□ 1.18
AFG3L2-201ENST00000269143 CUL7Q14999 1698 aa22.39■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.37■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 NEFMP07197 916 aa22.35■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.35■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.33■■□□□ 1.17
AFG3L2-201ENST00000269143 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 AKNAQ7Z591 1439 aa22.32■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 33.4
AFG3L2-201ENST00000269143 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2-201ENST00000269143 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 SAMD9Q5K651 1589 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2-201ENST00000269143 FOXD1Q16676 465 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2-201ENST00000269143 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2-201ENST00000269143 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2-201ENST00000269143 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.15■■□□□ 1.14
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