RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.393e-14■■■■■ 58.3
AFG3L2-201ENST00000269143 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.014e-14■■■■□ 19.5
AFG3L2-201ENST00000269143 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 39
AFG3L2-201ENST00000269143 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 30.2
AFG3L2-201ENST00000269143 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.221e-8■■□□□ 12.8
AFG3L2-201ENST00000269143 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.091e-8■■■□□ 14.8
AFG3L2-201ENST00000269143 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.412e-8■■■■□ 20
AFG3L2-201ENST00000269143 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 33.4
AFG3L2-201ENST00000269143 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.61■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 89
AFG3L2-201ENST00000269143 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 17e-8■■□□□ 14.2
AFG3L2-201ENST00000269143 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.629e-8■□□□□ 9.4
AFG3L2-201ENST00000269143 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 29
AFG3L2-201ENST00000269143 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 28.3
AFG3L2-201ENST00000269143 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 8.9
AFG3L2-201ENST00000269143 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.972e-7■■■■□ 23.2
AFG3L2-201ENST00000269143 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.673e-7■□□□□ 11.2
AFG3L2-201ENST00000269143 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.43e-7■■■□□ 18.9
AFG3L2-201ENST00000269143 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 60
AFG3L2-201ENST00000269143 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■□ 25.5
AFG3L2-201ENST00000269143 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.015e-7■■□□□ 14.1
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.569e-7■■■■□ 21
AFG3L2-201ENST00000269143 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 33
AFG3L2-201ENST00000269143 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 14.4
AFG3L2-201ENST00000269143 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 19.5
AFG3L2-201ENST00000269143 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 10.1
AFG3L2-201ENST00000269143 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 20.1
AFG3L2-201ENST00000269143 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 18.8
AFG3L2-201ENST00000269143 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 13.5
AFG3L2-201ENST00000269143 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 26.3
AFG3L2-201ENST00000269143 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 23.5
AFG3L2-201ENST00000269143 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 188.4
AFG3L2-201ENST00000269143 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.513e-6■■■□□ 19.2
AFG3L2-201ENST00000269143 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 26.4
AFG3L2-201ENST00000269143 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 13.9
AFG3L2-201ENST00000269143 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 39.5
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.497e-6■■■■□ 20.5
AFG3L2-201ENST00000269143 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.279e-6■■■■■ 27.7
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