RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 PRDM2Q13029 1718 aa16.61■□□□□ 0.25
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CLSTN3-201ENST00000266546 SAMD9Q5K651 1589 aa15.85■□□□□ 0.13
CLSTN3-201ENST00000266546 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.85■□□□□ 0.13
CLSTN3-201ENST00000266546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CLSTN3-201ENST00000266546 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.85■□□□□ 0.13
CLSTN3-201ENST00000266546 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
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CLSTN3-201ENST00000266546 KIAA0556O60303 1618 aa15.81■□□□□ 0.12
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
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