RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LRP11-201ENST00000239367 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.41■■□□□ 1.34
LRP11-201ENST00000239367 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LRP11-201ENST00000239367 TIAM1Q13009 1591 aa23.33■■□□□ 1.33
LRP11-201ENST00000239367 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
LRP11-201ENST00000239367 PRDM2Q13029 1718 aa23.33■■□□□ 1.32
LRP11-201ENST00000239367 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.32■■□□□ 1.32
LRP11-201ENST00000239367 IGF1RP08069 1367 aa23.32■■□□□ 1.32
LRP11-201ENST00000239367 MAPKBP1O60336 1514 aa23.3■■□□□ 1.32
LRP11-201ENST00000239367 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP11-201ENST00000239367 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP11-201ENST00000239367 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.22■■□□□ 1.31
LRP11-201ENST00000239367 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
LRP11-201ENST00000239367 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.17■■□□□ 1.3
LRP11-201ENST00000239367 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.15■■□□□ 1.3
LRP11-201ENST00000239367 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.15■■□□□ 1.3
LRP11-201ENST00000239367 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.14■■□□□ 1.3
LRP11-201ENST00000239367 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.13■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.09■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 MSH5O43196 834 aa23.09■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 WDR97A6NE52 1622 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
LRP11-201ENST00000239367 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LRP11-201ENST00000239367 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LRP11-201ENST00000239367 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP11-201ENST00000239367 ANP32CO43423 234 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 NBR1Q14596 966 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP11-201ENST00000239367 CCER2I3L3R5 266 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.92■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.92■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.9■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 P3H3Q8IVL6 736 aa22.9■■□□□ 1.26
LRP11-201ENST00000239367 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 CUL7Q14999 1698 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 FMN1Q68DA7 1419 aa22.86■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.86■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.84■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.83■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LRP11-201ENST00000239367 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 HFM1A2PYH4 1435 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 UACAQ9BZF9 1416 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 TOPBP1Q92547 1522 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 TONSLQ96HA7 1378 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP11-201ENST00000239367 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 PTPRKQ15262 1439 aa22.71■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 SAMD9Q5K651 1589 aa22.7■■□□□ 1.23
LRP11-201ENST00000239367 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 NAIPQ13075 1403 aa22.69■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.69■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 NCOA2Q15596 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 GRIN2BQ13224 1484 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP11-201ENST00000239367 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.62■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 ARHGEF11O15085 1522 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP11-201ENST00000239367 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.58■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.56■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.56■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 NESP48681 1621 aa22.55■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.53■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 AKNAQ7Z591 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.52■■□□□ 1.2
LRP11-201ENST00000239367 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.51■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 HECW1Q76N89 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.49■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 CCDC184Q52MB2 194 aa22.47■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP11-201ENST00000239367 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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