RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.44■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 PRXQ9BXM0 1461 aa37.44■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 JPH4Q96JJ6 628 aa37.43■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.43■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.41■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.41■■■■□ 3.58
SYF2-201ENST00000236273 EEA1Q15075 1411 aa37.37■■■■□ 3.57
SYF2-201ENST00000236273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
SYF2-201ENST00000236273 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
SYF2-201ENST00000236273 IQGAP2Q13576 1575 aa37.2■■■■□ 3.55
SYF2-201ENST00000236273 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.08■■■■□ 3.53
SYF2-201ENST00000236273 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.06■■■■□ 3.52
SYF2-201ENST00000236273 DISP1Q96F81 1524 aa37.02■■■■□ 3.52
SYF2-201ENST00000236273 KIF21BO75037 1637 aa37.02■■■■□ 3.52
SYF2-201ENST00000236273 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.96■■■■□ 3.51
SYF2-201ENST00000236273 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.9■■■■□ 3.5
SYF2-201ENST00000236273 PTPRGP23470 1445 aa36.88■■■■□ 3.49
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0556O60303 1618 aa36.87■■■■□ 3.49
SYF2-201ENST00000236273 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.78■■■■□ 3.48
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA3Q08378 1498 aa36.77■■■■□ 3.48
SYF2-201ENST00000236273 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
SYF2-201ENST00000236273 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.75■■■■□ 3.47
SYF2-201ENST00000236273 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
SYF2-201ENST00000236273 SAMD9Q5K651 1589 aa36.67■■■■□ 3.46
SYF2-201ENST00000236273 UACAQ9BZF9 1416 aa36.63■■■■□ 3.46
SYF2-201ENST00000236273 P3H3Q8IVL6 736 aa36.63■■■■□ 3.45
SYF2-201ENST00000236273 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
SYF2-201ENST00000236273 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
SYF2-201ENST00000236273 ABCC2Q92887 1545 aa36.55■■■■□ 3.44
SYF2-201ENST00000236273 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.54■■■■□ 3.44
SYF2-201ENST00000236273 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SYF2-201ENST00000236273 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
SYF2-201ENST00000236273 ABCA8O94911 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
SYF2-201ENST00000236273 MAPKBP1O60336 1514 aa36.48■■■■□ 3.43
SYF2-201ENST00000236273 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.46■■■■□ 3.43
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.46■■■■□ 3.43
SYF2-201ENST00000236273 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.44■■■■□ 3.42
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.39■■■■□ 3.42
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SYF2-201ENST00000236273 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.32■■■■□ 3.41
SYF2-201ENST00000236273 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.32■■■■□ 3.4
SYF2-201ENST00000236273 ASXL2Q76L83 1435 aa36.3■■■■□ 3.4
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.27■■■■□ 3.4
SYF2-201ENST00000236273 DIP2BQ9P265 1576 aa36.25■■■■□ 3.39
SYF2-201ENST00000236273 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.24■■■■□ 3.39
SYF2-201ENST00000236273 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.23■■■■□ 3.39
SYF2-201ENST00000236273 ATP10BO94823 1461 aa36.22■■■■□ 3.39
SYF2-201ENST00000236273 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
SYF2-201ENST00000236273 ARID3CA6NKF2 412 aa36.17■■■■□ 3.38
SYF2-201ENST00000236273 CLIP1P30622 1438 aa36.14■■■■□ 3.38
SYF2-201ENST00000236273 FMN1Q68DA7 1419 aa36.13■■■■□ 3.37
SYF2-201ENST00000236273 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.11■■■■□ 3.37
SYF2-201ENST00000236273 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
SYF2-201ENST00000236273 GLI2P10070 1586 aa36.08■■■■□ 3.37
SYF2-201ENST00000236273 CEP162Q5TB80 1403 aa36.01■■■■□ 3.36
SYF2-201ENST00000236273 KCNH8Q96L42 1107 aa35.97■■■■□ 3.35
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
SYF2-201ENST00000236273 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 TSPOAP1O95153 1857 aa35.92■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 HECW1Q76N89 1606 aa35.92■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.91■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.91■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
SYF2-201ENST00000236273 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.88■■■■□ 3.33
SYF2-201ENST00000236273 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.85■■■■□ 3.33
SYF2-201ENST00000236273 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.79■■■■□ 3.32
SYF2-201ENST00000236273 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.78■■■■□ 3.32
SYF2-201ENST00000236273 CD109Q6YHK3 1445 aa35.78■■■■□ 3.32
SYF2-201ENST00000236273 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.76■■■■□ 3.31
SYF2-201ENST00000236273 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.72■■■■□ 3.31
SYF2-201ENST00000236273 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.69■■■■□ 3.3
SYF2-201ENST00000236273 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
SYF2-201ENST00000236273 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.66■■■■□ 3.3
SYF2-201ENST00000236273 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
SYF2-201ENST00000236273 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SYF2-201ENST00000236273 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SYF2-201ENST00000236273 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.58■■■■□ 3.29
SYF2-201ENST00000236273 KDM6BO15054 1643 aa35.58■■■■□ 3.29
SYF2-201ENST00000236273 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.58■■■■□ 3.29
SYF2-201ENST00000236273 KIF14Q15058 1648 aa35.55■■■■□ 3.28
SYF2-201ENST00000236273 PLCH2O75038 1416 aa35.45■■■■□ 3.26
SYF2-201ENST00000236273 NEO1Q92859 1461 aa35.43■■■■□ 3.26
SYF2-201ENST00000236273 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.42■■■■□ 3.26
SYF2-201ENST00000236273 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.41■■■■□ 3.26
SYF2-201ENST00000236273 FANCAO15360 1455 aa35.37■■■■□ 3.25
SYF2-201ENST00000236273 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.35■■■■□ 3.25
SYF2-201ENST00000236273 TIAM1Q13009 1591 aa35.33■■■■□ 3.25
SYF2-201ENST00000236273 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.33■■■■□ 3.25
SYF2-201ENST00000236273 AKNAQ7Z591 1439 aa35.33■■■■□ 3.25
SYF2-201ENST00000236273 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.28■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.27■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K1Q13233 1512 aa35.27■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.27■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF3O95398 923 aa35.27■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.27■■■■□ 3.24
SYF2-201ENST00000236273 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.25■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms