RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227756.4

GALNT18-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT18, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18-201ENST00000227756 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.2■■□□□ 1.63
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GALNT18-201ENST00000227756 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
GALNT18-201ENST00000227756 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.16■■□□□ 1.62
GALNT18-201ENST00000227756 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.16■■□□□ 1.62
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GALNT18-201ENST00000227756 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GALNT18-201ENST00000227756 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.13■■□□□ 1.61
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GALNT18-201ENST00000227756 ITGAEP38570 1179 aa25.07■■□□□ 1.6
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GALNT18-201ENST00000227756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.93■■□□□ 1.58
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GALNT18-201ENST00000227756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GALNT18-201ENST00000227756 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.84■■□□□ 1.57
GALNT18-201ENST00000227756 ERCC6Q03468 1493 aa24.84■■□□□ 1.57
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GALNT18-201ENST00000227756 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.79■■□□□ 1.56
GALNT18-201ENST00000227756 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.79■■□□□ 1.56
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GALNT18-201ENST00000227756 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.72■■□□□ 1.55
GALNT18-201ENST00000227756 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
GALNT18-201ENST00000227756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GALNT18-201ENST00000227756 NCOA2Q15596 1464 aa24.68■■□□□ 1.54
GALNT18-201ENST00000227756 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.66■■□□□ 1.54
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GALNT18-201ENST00000227756 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.65■■□□□ 1.54
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GALNT18-201ENST00000227756 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GALNT18-201ENST00000227756 HECW1Q76N89 1606 aa24.64■■□□□ 1.53
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GALNT18-201ENST00000227756 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
GALNT18-201ENST00000227756 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.61■■□□□ 1.53
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GALNT18-201ENST00000227756 KIAA0556O60303 1618 aa24.54■■□□□ 1.52
GALNT18-201ENST00000227756 ARHGEF11O15085 1522 aa24.54■■□□□ 1.52
GALNT18-201ENST00000227756 FBLN2P98095 1184 aa24.54■■□□□ 1.52
GALNT18-201ENST00000227756 SYNJ2O15056 1496 aa24.51■■□□□ 1.51
GALNT18-201ENST00000227756 MIER1Q8N108 512 aa24.51■■□□□ 1.51
GALNT18-201ENST00000227756 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.5■■□□□ 1.51
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GALNT18-201ENST00000227756 HFM1A2PYH4 1435 aa24.46■■□□□ 1.51
GALNT18-201ENST00000227756 CEP170Q5SW79 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
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GALNT18-201ENST00000227756 NAIPQ13075 1403 aa24.41■■□□□ 1.5
GALNT18-201ENST00000227756 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GALNT18-201ENST00000227756 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GALNT18-201ENST00000227756 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.4■■□□□ 1.5
GALNT18-201ENST00000227756 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.38■■□□□ 1.49
GALNT18-201ENST00000227756 JPH4Q96JJ6 628 aa24.37■■□□□ 1.49
GALNT18-201ENST00000227756 NUP160Q12769 1436 aa24.37■■□□□ 1.49
GALNT18-201ENST00000227756 MIA2Q96PC5 1412 aa24.37■■□□□ 1.49
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GALNT18-201ENST00000227756 UACAQ9BZF9 1416 aa24.36■■□□□ 1.49
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GALNT18-201ENST00000227756 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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GALNT18-201ENST00000227756 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.33■■□□□ 1.49
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GALNT18-201ENST00000227756 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GALNT18-201ENST00000227756 AKNAQ7Z591 1439 aa24.23■■□□□ 1.47
GALNT18-201ENST00000227756 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GALNT18-201ENST00000227756 TRIM52Q96A61 297 aa24.21■■□□□ 1.47
GALNT18-201ENST00000227756 TONSLQ96HA7 1378 aa24.21■■□□□ 1.47
GALNT18-201ENST00000227756 DAPK1P53355 1430 aa24.18■■□□□ 1.46
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GALNT18-201ENST00000227756 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
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