RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227756.4

GALNT18-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT18, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18-201ENST00000227756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.24■■■■□ 3.39
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GALNT18-201ENST00000227756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.44■■■□□ 2.46
GALNT18-201ENST00000227756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.11■■■□□ 2.41
GALNT18-201ENST00000227756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.8■■■□□ 2.36
GALNT18-201ENST00000227756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
GALNT18-201ENST00000227756 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.13■■■□□ 2.25
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC9O60706 1549 aa29.11■■■□□ 2.25
GALNT18-201ENST00000227756 SCRIBQ14160 1630 aa28.98■■■□□ 2.23
GALNT18-201ENST00000227756 NACADO15069 1562 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT18-201ENST00000227756 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.64■■■□□ 2.17
GALNT18-201ENST00000227756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.47■■■□□ 2.15
GALNT18-201ENST00000227756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GALNT18-201ENST00000227756 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
GALNT18-201ENST00000227756 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.12■■■□□ 2.09
GALNT18-201ENST00000227756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28■■■□□ 2.07
GALNT18-201ENST00000227756 WIZO95785 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
GALNT18-201ENST00000227756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
GALNT18-201ENST00000227756 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.72■■■□□ 2.03
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GALNT18-201ENST00000227756 SMARCA4P51532 1647 aa27.7■■■□□ 2.03
GALNT18-201ENST00000227756 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.67■■■□□ 2.02
GALNT18-201ENST00000227756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
GALNT18-201ENST00000227756 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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GALNT18-201ENST00000227756 SMARCA2P51531 1590 aa27.36■■□□□ 1.97
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GALNT18-201ENST00000227756 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.22■■□□□ 1.95
GALNT18-201ENST00000227756 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.13■■□□□ 1.93
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC8Q09428 1581 aa27.13■■□□□ 1.93
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GALNT18-201ENST00000227756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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GALNT18-201ENST00000227756 SOGA1O94964 1423 aa26.78■■□□□ 1.88
GALNT18-201ENST00000227756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
GALNT18-201ENST00000227756 NCAPD3P42695 1498 aa26.68■■□□□ 1.86
GALNT18-201ENST00000227756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.66■■□□□ 1.86
GALNT18-201ENST00000227756 EEA1Q15075 1411 aa26.65■■□□□ 1.86
GALNT18-201ENST00000227756 HMGXB3Q12766 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
GALNT18-201ENST00000227756 SYNJ1O43426 1573 aa26.64■■□□□ 1.86
GALNT18-201ENST00000227756 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.63■■□□□ 1.85
GALNT18-201ENST00000227756 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.48■■□□□ 1.83
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GALNT18-201ENST00000227756 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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GALNT18-201ENST00000227756 TOP2BQ02880 1626 aa26.39■■□□□ 1.82
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GALNT18-201ENST00000227756 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.32■■□□□ 1.8
GALNT18-201ENST00000227756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.31■■□□□ 1.8
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GALNT18-201ENST00000227756 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.16■■□□□ 1.78
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GALNT18-201ENST00000227756 CLIP1P30622 1438 aa26.08■■□□□ 1.77
GALNT18-201ENST00000227756 KIF27Q86VH2 1401 aa26.01■■□□□ 1.76
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GALNT18-201ENST00000227756 PRXQ9BXM0 1461 aa25.99■■□□□ 1.75
GALNT18-201ENST00000227756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.96■■□□□ 1.75
GALNT18-201ENST00000227756 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.91■■□□□ 1.74
GALNT18-201ENST00000227756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.86■■□□□ 1.73
GALNT18-201ENST00000227756 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GALNT18-201ENST00000227756 CUX2O14529 1486 aa25.84■■□□□ 1.73
GALNT18-201ENST00000227756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.84■■□□□ 1.73
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GALNT18-201ENST00000227756 TOPBP1Q92547 1522 aa25.64■■□□□ 1.7
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GALNT18-201ENST00000227756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.63■■□□□ 1.69
GALNT18-201ENST00000227756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.61■■□□□ 1.69
GALNT18-201ENST00000227756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GALNT18-201ENST00000227756 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.57■■□□□ 1.68
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GALNT18-201ENST00000227756 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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GALNT18-201ENST00000227756 WDR97A6NE52 1622 aa25.34■■□□□ 1.65
GALNT18-201ENST00000227756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
GALNT18-201ENST00000227756 P3H3Q8IVL6 736 aa25.3■■□□□ 1.64
GALNT18-201ENST00000227756 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.25■■□□□ 1.63
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GALNT18-201ENST00000227756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.23■■□□□ 1.63
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GALNT18-201ENST00000227756 TIAM1Q13009 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
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