RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224652.10

ATE1-201, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATE1, Length 4,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-201ENST00000224652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.5■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 HMGXB3Q12766 1538 aa20.5■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 TONSLQ96HA7 1378 aa20.49■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.48■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 ANP32CO43423 234 aa20.47■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 PRXQ9BXM0 1461 aa20.46■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.46■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.45■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 ARAP1Q96P48 1450 aa20.45■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.43■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.4■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.4■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 BCANQ96GW7 911 aa20.39■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ATE1-201ENST00000224652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.37■□□□□ 0.85
ATE1-201ENST00000224652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATE1-201ENST00000224652 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.36■□□□□ 0.85
ATE1-201ENST00000224652 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.35■□□□□ 0.85
ATE1-201ENST00000224652 NESP48681 1621 aa20.33■□□□□ 0.85
ATE1-201ENST00000224652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
ATE1-201ENST00000224652 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.31■□□□□ 0.84
ATE1-201ENST00000224652 FMN1Q68DA7 1419 aa20.26■□□□□ 0.83
ATE1-201ENST00000224652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.22■□□□□ 0.83
ATE1-201ENST00000224652 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.21■□□□□ 0.83
ATE1-201ENST00000224652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.19■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 ERCC6Q03468 1493 aa20.17■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.15■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 TOPBP1Q92547 1522 aa20.15■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.15■□□□□ 0.82
ATE1-201ENST00000224652 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ATE1-201ENST00000224652 FKBP8Q14318 412 aa20.12■□□□□ 0.81
ATE1-201ENST00000224652 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
ATE1-201ENST00000224652 FOXD1Q16676 465 aa20.08■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.07■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.06■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 TSPY4P0CV99 314 aa20.06■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 TSPY10P0CW01 314 aa20.06■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.04■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.03■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.02■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 TIAM1Q13009 1591 aa20.02■□□□□ 0.8
ATE1-201ENST00000224652 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 KCNH8Q96L42 1107 aa20■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.98■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.98■□□□□ 0.79
ATE1-201ENST00000224652 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.95■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.94■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.93■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 MRS2Q9HD23 443 aa19.92■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ATE1-201ENST00000224652 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.89■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.89■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 NCOA2Q15596 1464 aa19.88■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.85■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 JPH4Q96JJ6 628 aa19.85■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 RGL3Q3MIN7 710 aa19.83■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.83■□□□□ 0.77
ATE1-201ENST00000224652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.83■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.82■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 PKD2Q13563 968 aa19.8■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 GRIN2BQ13224 1484 aa19.78■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 CCER2I3L3R5 266 aa19.78■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 MAP3K1Q13233 1512 aa19.77■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 UACAQ9BZF9 1416 aa19.77■□□□□ 0.76
ATE1-201ENST00000224652 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ATE1-201ENST00000224652 CUL7Q14999 1698 aa19.75■□□□□ 0.75
ATE1-201ENST00000224652 TMC1Q8TDI8 760 aa19.75■□□□□ 0.75
ATE1-201ENST00000224652 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.75■□□□□ 0.75
ATE1-201ENST00000224652 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.75■□□□□ 0.75
ATE1-201ENST00000224652 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 29.2
ATE1-201ENST00000224652 WDR97A6NE52 1622 aa19.7■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 PRDM2Q13029 1718 aa19.7■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.69■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 NUP155O75694 1391 aa19.69■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 HFM1A2PYH4 1435 aa19.68■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.67■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.66■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
ATE1-201ENST00000224652 NAIPQ13075 1403 aa19.64■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 IFT140Q96RY7 1462 aa19.63■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.63■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms