RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224652.10

ATE1-201, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATE1, Length 4,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-201ENST00000224652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.32■■■□□ 2.12
ATE1-201ENST00000224652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.69■■□□□ 1.7
ATE1-201ENST00000224652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.39■■□□□ 1.66
ATE1-201ENST00000224652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ATE1-201ENST00000224652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ATE1-201ENST00000224652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.64■■□□□ 1.37
ATE1-201ENST00000224652 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.62■■□□□ 1.37
ATE1-201ENST00000224652 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.56■■□□□ 1.36
ATE1-201ENST00000224652 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
ATE1-201ENST00000224652 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.39■■□□□ 1.33
ATE1-201ENST00000224652 TRIM41Q8WV44 630 aa23.28■■□□□ 1.32
ATE1-201ENST00000224652 ABCC9O60706 1549 aa23.28■■□□□ 1.32
ATE1-201ENST00000224652 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.2■■□□□ 1.3
ATE1-201ENST00000224652 SCRIBQ14160 1630 aa22.94■■□□□ 1.26
ATE1-201ENST00000224652 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ATE1-201ENST00000224652 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
ATE1-201ENST00000224652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.76■■□□□ 1.23
ATE1-201ENST00000224652 HRCP23327 699 aa22.74■■□□□ 1.23
ATE1-201ENST00000224652 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ATE1-201ENST00000224652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
ATE1-201ENST00000224652 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ATE1-201ENST00000224652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ATE1-201ENST00000224652 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
ATE1-201ENST00000224652 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ATE1-201ENST00000224652 APLP2Q06481 763 aa22.35■■□□□ 1.17
ATE1-201ENST00000224652 NACADO15069 1562 aa22.34■■□□□ 1.17
ATE1-201ENST00000224652 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ATE1-201ENST00000224652 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATE1-201ENST00000224652 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.29■■□□□ 1.16
ATE1-201ENST00000224652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.21■■□□□ 1.15
ATE1-201ENST00000224652 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.07■■□□□ 1.12
ATE1-201ENST00000224652 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
ATE1-201ENST00000224652 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.93■■□□□ 1.1
ATE1-201ENST00000224652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ATE1-201ENST00000224652 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ATE1-201ENST00000224652 WIZO95785 1651 aa21.85■■□□□ 1.09
ATE1-201ENST00000224652 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ATE1-201ENST00000224652 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.66■■□□□ 1.06
ATE1-201ENST00000224652 ITGAEP38570 1179 aa21.63■■□□□ 1.05
ATE1-201ENST00000224652 ABCC8Q09428 1581 aa21.62■■□□□ 1.05
ATE1-201ENST00000224652 SOGA1O94964 1423 aa21.56■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 CEP162Q5TB80 1403 aa21.53■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATE1-201ENST00000224652 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATE1-201ENST00000224652 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ATE1-201ENST00000224652 SMARCA4P51532 1647 aa21.49■■□□□ 1.03
ATE1-201ENST00000224652 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ATE1-201ENST00000224652 EEA1Q15075 1411 aa21.43■■□□□ 1.02
ATE1-201ENST00000224652 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.4■■□□□ 1.02
ATE1-201ENST00000224652 GOLGA3Q08378 1498 aa21.39■■□□□ 1.01
ATE1-201ENST00000224652 CLIP1P30622 1438 aa21.35■■□□□ 1.01
ATE1-201ENST00000224652 P3H3Q8IVL6 736 aa21.3■■□□□ 1
ATE1-201ENST00000224652 SMARCA2P51531 1590 aa21.29■■□□□ 1
ATE1-201ENST00000224652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.27■■□□□ 1
ATE1-201ENST00000224652 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.24■□□□□ 0.99
ATE1-201ENST00000224652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.23■□□□□ 0.99
ATE1-201ENST00000224652 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
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ATE1-201ENST00000224652 KIF27Q86VH2 1401 aa21.05■□□□□ 0.96
ATE1-201ENST00000224652 NEUROD1Q13562 356 aa21.02■□□□□ 0.96
ATE1-201ENST00000224652 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.98■□□□□ 0.95
ATE1-201ENST00000224652 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.97■□□□□ 0.95
ATE1-201ENST00000224652 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.95■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.93■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.93■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 ARID3CA6NKF2 412 aa20.92■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ATE1-201ENST00000224652 CUX2O14529 1486 aa20.89■□□□□ 0.93
ATE1-201ENST00000224652 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ATE1-201ENST00000224652 SYNJ1O43426 1573 aa20.85■□□□□ 0.93
ATE1-201ENST00000224652 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.79■□□□□ 0.92
ATE1-201ENST00000224652 TRIM52Q96A61 297 aa20.77■□□□□ 0.92
ATE1-201ENST00000224652 FBLN2P98095 1184 aa20.76■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 MIER1Q8N108 512 aa20.76■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 MYT1Q01538 1121 aa20.74■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.74■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 NCAPD3P42695 1498 aa20.74■□□□□ 0.91
ATE1-201ENST00000224652 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.65■□□□□ 0.9
ATE1-201ENST00000224652 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.64■□□□□ 0.9
ATE1-201ENST00000224652 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.62■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 KIF21BO75037 1637 aa20.61■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.6■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.6■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 NEFLP07196 543 aa20.59■□□□□ 0.89
ATE1-201ENST00000224652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 TOP2BQ02880 1626 aa20.55■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 CFTRP13569 1480 aa20.54■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 IGF1RP08069 1367 aa20.53■□□□□ 0.88
ATE1-201ENST00000224652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.52■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 CUX1P39880 1505 aa20.51■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.51■□□□□ 0.87
ATE1-201ENST00000224652 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.51■□□□□ 0.87
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