RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
PLGRKT-201ENST00000223864 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM41Q8WV44 630 aa30.07■■■□□ 2.4
PLGRKT-201ENST00000223864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNJ2O15056 1496 aa30.06■■■□□ 2.4
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF11O15085 1522 aa30.01■■■□□ 2.4
PLGRKT-201ENST00000223864 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.93■■■□□ 2.38
PLGRKT-201ENST00000223864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.88■■■□□ 2.37
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS12P58397 1594 aa29.88■■■□□ 2.37
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIN2AQ12879 1464 aa29.82■■■□□ 2.36
PLGRKT-201ENST00000223864 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.8■■■□□ 2.36
PLGRKT-201ENST00000223864 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.75■■■□□ 2.35
PLGRKT-201ENST00000223864 ARAP1Q96P48 1450 aa29.74■■■□□ 2.35
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC4A2P04920 1241 aa29.7■■■□□ 2.35
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP160Q12769 1436 aa29.7■■■□□ 2.34
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP170Q5SW79 1584 aa29.69■■■□□ 2.34
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF27Q86VH2 1401 aa29.68■■■□□ 2.34
PLGRKT-201ENST00000223864 IGF1RP08069 1367 aa29.59■■■□□ 2.33
PLGRKT-201ENST00000223864 CUL7Q14999 1698 aa29.58■■■□□ 2.33
PLGRKT-201ENST00000223864 SHROOM2Q13796 1616 aa29.56■■■□□ 2.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.48■■■□□ 2.31
PLGRKT-201ENST00000223864 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.31
PLGRKT-201ENST00000223864 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.4■■■□□ 2.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB22O15209 634 aa29.4■■■□□ 2.3
PLGRKT-201ENST00000223864 JPH4Q96JJ6 628 aa29.39■■■□□ 2.3
PLGRKT-201ENST00000223864 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.35■■■□□ 2.29
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF39Q9H2S5 420 aa29.29■■■□□ 2.28
PLGRKT-201ENST00000223864 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PLGRKT-201ENST00000223864 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.21■■■□□ 2.27
PLGRKT-201ENST00000223864 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PLGRKT-201ENST00000223864 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.16■■■□□ 2.26
PLGRKT-201ENST00000223864 IQGAP2Q13576 1575 aa29.15■■■□□ 2.26
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXD4L1Q9NU39 408 aa29.13■■■□□ 2.25
PLGRKT-201ENST00000223864 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
PLGRKT-201ENST00000223864 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.03■■■□□ 2.24
PLGRKT-201ENST00000223864 PRXQ9BXM0 1461 aa29.02■■■□□ 2.24
PLGRKT-201ENST00000223864 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.99■■■□□ 2.23
PLGRKT-201ENST00000223864 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.98■■■□□ 2.23
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRGP23470 1445 aa28.97■■■□□ 2.23
PLGRKT-201ENST00000223864 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.97■■■□□ 2.23
PLGRKT-201ENST00000223864 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.96■■■□□ 2.23
PLGRKT-201ENST00000223864 DISP1Q96F81 1524 aa28.94■■■□□ 2.22
PLGRKT-201ENST00000223864 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
PLGRKT-201ENST00000223864 EEA1Q15075 1411 aa28.9■■■□□ 2.22
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.9■■■□□ 2.22
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA0556O60303 1618 aa28.87■■■□□ 2.21
PLGRKT-201ENST00000223864 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PLGRKT-201ENST00000223864 MAPKBP1O60336 1514 aa28.86■■■□□ 2.21
PLGRKT-201ENST00000223864 GOLGA3Q08378 1498 aa28.78■■■□□ 2.2
PLGRKT-201ENST00000223864 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.78■■■□□ 2.2
PLGRKT-201ENST00000223864 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PLGRKT-201ENST00000223864 UACAQ9BZF9 1416 aa28.77■■■□□ 2.2
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC2Q92887 1545 aa28.76■■■□□ 2.19
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.76■■■□□ 2.19
PLGRKT-201ENST00000223864 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PLGRKT-201ENST00000223864 DIP2BQ9P265 1576 aa28.72■■■□□ 2.19
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.69■■■□□ 2.18
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF21BO75037 1637 aa28.65■■■□□ 2.18
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.64■■■□□ 2.18
PLGRKT-201ENST00000223864 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PLGRKT-201ENST00000223864 ASXL2Q76L83 1435 aa28.6■■■□□ 2.17
PLGRKT-201ENST00000223864 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.6■■■□□ 2.17
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA8O94911 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
PLGRKT-201ENST00000223864 SAMD9Q5K651 1589 aa28.58■■■□□ 2.17
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPOAP1O95153 1857 aa28.56■■■□□ 2.16
PLGRKT-201ENST00000223864 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PLGRKT-201ENST00000223864 P3H3Q8IVL6 736 aa28.53■■■□□ 2.16
PLGRKT-201ENST00000223864 GLI2P10070 1586 aa28.51■■■□□ 2.15
PLGRKT-201ENST00000223864 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PLGRKT-201ENST00000223864 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PLGRKT-201ENST00000223864 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.41■■■□□ 2.14
PLGRKT-201ENST00000223864 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.39■■■□□ 2.14
PLGRKT-201ENST00000223864 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.39■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.38■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM6BO15054 1643 aa28.36■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.35■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP10BO94823 1461 aa28.33■■■□□ 2.13
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.27■■■□□ 2.12
PLGRKT-201ENST00000223864 ARID3CA6NKF2 412 aa28.27■■■□□ 2.12
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNH8Q96L42 1107 aa28.26■■■□□ 2.11
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PLGRKT-201ENST00000223864 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.24■■■□□ 2.11
PLGRKT-201ENST00000223864 CD109Q6YHK3 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.18■■■□□ 2.1
PLGRKT-201ENST00000223864 CAPN15O75808 1086 aa28.17■■■□□ 2.1
PLGRKT-201ENST00000223864 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.16■■■□□ 2.1
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.12■■■□□ 2.09
PLGRKT-201ENST00000223864 FMN1Q68DA7 1419 aa28.11■■■□□ 2.09
PLGRKT-201ENST00000223864 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms