RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217971.7

PGRMC1-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC1, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1-201ENST00000217971 CUL7Q14999 1698 aa23.06■■□□□ 1.28
PGRMC1-201ENST00000217971 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.04■■□□□ 1.28
PGRMC1-201ENST00000217971 GOLGA3Q08378 1498 aa23.03■■□□□ 1.28
PGRMC1-201ENST00000217971 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.03■■□□□ 1.28
PGRMC1-201ENST00000217971 NUP160Q12769 1436 aa23.01■■□□□ 1.27
PGRMC1-201ENST00000217971 CEP170Q5SW79 1584 aa23■■□□□ 1.27
PGRMC1-201ENST00000217971 ARAP1Q96P48 1450 aa22.99■■□□□ 1.27
PGRMC1-201ENST00000217971 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PGRMC1-201ENST00000217971 SHROOM2Q13796 1616 aa22.89■■□□□ 1.26
PGRMC1-201ENST00000217971 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.88■■□□□ 1.25
PGRMC1-201ENST00000217971 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.88■■□□□ 1.25
PGRMC1-201ENST00000217971 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1-201ENST00000217971 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1-201ENST00000217971 CEP162Q5TB80 1403 aa22.73■■□□□ 1.23
PGRMC1-201ENST00000217971 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.73■■□□□ 1.23
PGRMC1-201ENST00000217971 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PGRMC1-201ENST00000217971 JPH4Q96JJ6 628 aa22.68■■□□□ 1.22
PGRMC1-201ENST00000217971 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PGRMC1-201ENST00000217971 CLIP1P30622 1438 aa22.64■■□□□ 1.21
PGRMC1-201ENST00000217971 IQGAP2Q13576 1575 aa22.61■■□□□ 1.21
PGRMC1-201ENST00000217971 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.54■■□□□ 1.2
PGRMC1-201ENST00000217971 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.51■■□□□ 1.19
PGRMC1-201ENST00000217971 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.49■■□□□ 1.19
PGRMC1-201ENST00000217971 SAMD9Q5K651 1589 aa22.49■■□□□ 1.19
PGRMC1-201ENST00000217971 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
PGRMC1-201ENST00000217971 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PGRMC1-201ENST00000217971 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 DISP1Q96F81 1524 aa22.43■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 P3H3Q8IVL6 736 aa22.42■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 KIAA0556O60303 1618 aa22.4■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.4■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.4■■□□□ 1.18
PGRMC1-201ENST00000217971 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
PGRMC1-201ENST00000217971 MAPKBP1O60336 1514 aa22.34■■□□□ 1.17
PGRMC1-201ENST00000217971 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.3■■□□□ 1.16
PGRMC1-201ENST00000217971 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
PGRMC1-201ENST00000217971 FMN1Q68DA7 1419 aa22.29■■□□□ 1.16
PGRMC1-201ENST00000217971 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.29■■□□□ 1.16
PGRMC1-201ENST00000217971 ABCC2Q92887 1545 aa22.27■■□□□ 1.16
PGRMC1-201ENST00000217971 UACAQ9BZF9 1416 aa22.26■■□□□ 1.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.23■■□□□ 1.15
PGRMC1-201ENST00000217971 DIP2BQ9P265 1576 aa22.23■■□□□ 1.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.14
PGRMC1-201ENST00000217971 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.2■■□□□ 1.14
PGRMC1-201ENST00000217971 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.18■■□□□ 1.14
PGRMC1-201ENST00000217971 ABCA8O94911 1581 aa22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1-201ENST00000217971 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1-201ENST00000217971 APLP2Q06481 763 aa22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 ASXL2Q76L83 1435 aa22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 HECW1Q76N89 1606 aa22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 MAP3K1Q13233 1512 aa22.08■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 TIAM1Q13009 1591 aa22.08■■□□□ 1.13
PGRMC1-201ENST00000217971 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.08■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 GLI2P10070 1586 aa22.07■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.03■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PGRMC1-201ENST00000217971 TSPOAP1O95153 1857 aa22.02■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.01■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 ARID3CA6NKF2 412 aa21.97■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.97■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PGRMC1-201ENST00000217971 ATP10BO94823 1461 aa21.92■■□□□ 1.1
PGRMC1-201ENST00000217971 KDM6BO15054 1643 aa21.91■■□□□ 1.1
PGRMC1-201ENST00000217971 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.9■■□□□ 1.1
PGRMC1-201ENST00000217971 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.9■■□□□ 1.1
PGRMC1-201ENST00000217971 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PGRMC1-201ENST00000217971 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PGRMC1-201ENST00000217971 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.88■■□□□ 1.09
PGRMC1-201ENST00000217971 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.85■■□□□ 1.09
PGRMC1-201ENST00000217971 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PGRMC1-201ENST00000217971 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.79■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.78■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 CD109Q6YHK3 1445 aa21.78■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNH8Q96L42 1107 aa21.78■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 NCOA2Q15596 1464 aa21.77■■□□□ 1.08
PGRMC1-201ENST00000217971 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.74■■□□□ 1.07
PGRMC1-201ENST00000217971 KIF14Q15058 1648 aa21.72■■□□□ 1.07
PGRMC1-201ENST00000217971 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PGRMC1-201ENST00000217971 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.68■■□□□ 1.06
PGRMC1-201ENST00000217971 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PGRMC1-201ENST00000217971 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.65■■□□□ 1.06
PGRMC1-201ENST00000217971 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
PGRMC1-201ENST00000217971 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.62■■□□□ 1.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.62■■□□□ 1.05
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.61■■□□□ 1.05
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