RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216456.6

VTI1B-201, Transcript of vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VTI1B, Length 1,103 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1B-201ENST00000216456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.5■■■■□ 3.75
VTI1B-201ENST00000216456 CUL7Q14999 1698 aa38.36■■■■□ 3.73
VTI1B-201ENST00000216456 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.31■■■■□ 3.72
VTI1B-201ENST00000216456 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.3■■■■□ 3.72
VTI1B-201ENST00000216456 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
VTI1B-201ENST00000216456 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.06■■■■□ 3.68
VTI1B-201ENST00000216456 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.98■■■■□ 3.67
VTI1B-201ENST00000216456 IQGAP2Q13576 1575 aa37.97■■■■□ 3.67
VTI1B-201ENST00000216456 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.96■■■■□ 3.67
VTI1B-201ENST00000216456 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.95■■■■□ 3.67
VTI1B-201ENST00000216456 PTPRGP23470 1445 aa37.94■■■■□ 3.66
VTI1B-201ENST00000216456 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.89■■■■□ 3.66
VTI1B-201ENST00000216456 MAPKBP1O60336 1514 aa37.87■■■■□ 3.65
VTI1B-201ENST00000216456 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.87■■■■□ 3.65
VTI1B-201ENST00000216456 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.86■■■■□ 3.65
VTI1B-201ENST00000216456 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.85■■■■□ 3.65
VTI1B-201ENST00000216456 DISP1Q96F81 1524 aa37.85■■■■□ 3.65
VTI1B-201ENST00000216456 DIP2BQ9P265 1576 aa37.78■■■■□ 3.64
VTI1B-201ENST00000216456 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.74■■■■□ 3.63
VTI1B-201ENST00000216456 ABCC2Q92887 1545 aa37.68■■■■□ 3.62
VTI1B-201ENST00000216456 PRXQ9BXM0 1461 aa37.66■■■■□ 3.62
VTI1B-201ENST00000216456 KIAA0556O60303 1618 aa37.65■■■■□ 3.62
VTI1B-201ENST00000216456 UACAQ9BZF9 1416 aa37.64■■■■□ 3.62
VTI1B-201ENST00000216456 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.6■■■■□ 3.61
VTI1B-201ENST00000216456 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.59■■■■□ 3.61
VTI1B-201ENST00000216456 ASXL2Q76L83 1435 aa37.58■■■■□ 3.61
VTI1B-201ENST00000216456 TSPOAP1O95153 1857 aa37.54■■■■□ 3.6
VTI1B-201ENST00000216456 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.46■■■■□ 3.59
VTI1B-201ENST00000216456 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.45■■■■□ 3.59
VTI1B-201ENST00000216456 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
VTI1B-201ENST00000216456 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.44■■■■□ 3.58
VTI1B-201ENST00000216456 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
VTI1B-201ENST00000216456 GOLGA3Q08378 1498 aa37.38■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 KDM6BO15054 1643 aa37.37■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 P3H3Q8IVL6 736 aa37.36■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 GLI2P10070 1586 aa37.34■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
VTI1B-201ENST00000216456 ABCA8O94911 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
VTI1B-201ENST00000216456 ARID3CA6NKF2 412 aa37.23■■■■□ 3.55
VTI1B-201ENST00000216456 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.2■■■■□ 3.55
VTI1B-201ENST00000216456 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
VTI1B-201ENST00000216456 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.18■■■■□ 3.54
VTI1B-201ENST00000216456 EEA1Q15075 1411 aa37.18■■■■□ 3.54
VTI1B-201ENST00000216456 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
VTI1B-201ENST00000216456 KCNH8Q96L42 1107 aa37.14■■■■□ 3.54
VTI1B-201ENST00000216456 SAMD9Q5K651 1589 aa37.12■■■■□ 3.53
VTI1B-201ENST00000216456 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.06■■■■□ 3.52
VTI1B-201ENST00000216456 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.06■■■■□ 3.52
VTI1B-201ENST00000216456 ATP10BO94823 1461 aa37.03■■■■□ 3.52
VTI1B-201ENST00000216456 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.03■■■■□ 3.52
VTI1B-201ENST00000216456 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37■■■■□ 3.51
VTI1B-201ENST00000216456 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.99■■■■□ 3.51
VTI1B-201ENST00000216456 CD109Q6YHK3 1445 aa36.97■■■■□ 3.51
VTI1B-201ENST00000216456 KIF21BO75037 1637 aa36.94■■■■□ 3.5
VTI1B-201ENST00000216456 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.92■■■■□ 3.5
VTI1B-201ENST00000216456 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.89■■■■□ 3.5
VTI1B-201ENST00000216456 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.88■■■■□ 3.49
VTI1B-201ENST00000216456 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
VTI1B-201ENST00000216456 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
VTI1B-201ENST00000216456 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
VTI1B-201ENST00000216456 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
VTI1B-201ENST00000216456 ADGRL1O94910 1474 aa36.73■■■■□ 3.47
VTI1B-201ENST00000216456 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.71■■■■□ 3.47
VTI1B-201ENST00000216456 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.7■■■■□ 3.47
VTI1B-201ENST00000216456 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.58■■■■□ 3.45
VTI1B-201ENST00000216456 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
VTI1B-201ENST00000216456 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.58■■■■□ 3.45
VTI1B-201ENST00000216456 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.57■■■■□ 3.44
VTI1B-201ENST00000216456 RAPGEF3O95398 923 aa36.54■■■■□ 3.44
VTI1B-201ENST00000216456 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
VTI1B-201ENST00000216456 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
VTI1B-201ENST00000216456 NEO1Q92859 1461 aa36.46■■■■□ 3.43
VTI1B-201ENST00000216456 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.43■■■■□ 3.42
VTI1B-201ENST00000216456 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.42■■■■□ 3.42
VTI1B-201ENST00000216456 FMN1Q68DA7 1419 aa36.41■■■■□ 3.42
VTI1B-201ENST00000216456 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.4■■■■□ 3.42
VTI1B-201ENST00000216456 HECW1Q76N89 1606 aa36.34■■■■□ 3.41
VTI1B-201ENST00000216456 AKNAQ7Z591 1439 aa36.33■■■■□ 3.41
VTI1B-201ENST00000216456 FANCAO15360 1455 aa36.32■■■■□ 3.41
VTI1B-201ENST00000216456 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
VTI1B-201ENST00000216456 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.25■■■■□ 3.39
VTI1B-201ENST00000216456 KIF14Q15058 1648 aa36.22■■■■□ 3.39
VTI1B-201ENST00000216456 RICTORQ6R327 1708 aa36.21■■■■□ 3.39
VTI1B-201ENST00000216456 PLCH2O75038 1416 aa36.19■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.17■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.14■■■■□ 3.38
VTI1B-201ENST00000216456 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.12■■■■□ 3.37
VTI1B-201ENST00000216456 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.11■■■■□ 3.37
VTI1B-201ENST00000216456 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.11■■■■□ 3.37
VTI1B-201ENST00000216456 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.1■■■■□ 3.37
VTI1B-201ENST00000216456 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.09■■■■□ 3.37
VTI1B-201ENST00000216456 CLIP1P30622 1438 aa36.07■■■■□ 3.36
VTI1B-201ENST00000216456 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.05■■■■□ 3.36
VTI1B-201ENST00000216456 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms