RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167218.9

PDCD2-201, Transcript of programmed cell death 2, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD2, Length 1,118 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2-201ENST00000167218 JPH4Q96JJ6 628 aa48.13■■■■■ 5.3
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PDCD2-201ENST00000167218 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
PDCD2-201ENST00000167218 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.78■■■■■ 5.24
PDCD2-201ENST00000167218 IQGAP2Q13576 1575 aa47.65■■■■■ 5.22
PDCD2-201ENST00000167218 PRXQ9BXM0 1461 aa47.53■■■■■ 5.2
PDCD2-201ENST00000167218 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.47■■■■■ 5.19
PDCD2-201ENST00000167218 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.44■■■■■ 5.18
PDCD2-201ENST00000167218 DISP1Q96F81 1524 aa47.42■■■■■ 5.18
PDCD2-201ENST00000167218 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.41■■■■■ 5.18
PDCD2-201ENST00000167218 PTPRGP23470 1445 aa47.41■■■■■ 5.18
PDCD2-201ENST00000167218 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.4■■■■■ 5.18
PDCD2-201ENST00000167218 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.35■■■■■ 5.17
PDCD2-201ENST00000167218 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.32■■■■■ 5.17
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PDCD2-201ENST00000167218 MAPKBP1O60336 1514 aa47.23■■■■■ 5.15
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PDCD2-201ENST00000167218 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.15■■■■■ 5.14
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PDCD2-201ENST00000167218 ABCC2Q92887 1545 aa47.07■■■■■ 5.13
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PDCD2-201ENST00000167218 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.11
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PDCD2-201ENST00000167218 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.89■■■■■ 5.1
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PDCD2-201ENST00000167218 GLI2P10070 1586 aa46.64■■■■■ 5.06
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PDCD2-201ENST00000167218 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
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PDCD2-201ENST00000167218 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.41■■■■■ 5.02
PDCD2-201ENST00000167218 ATP10BO94823 1461 aa46.39■■■■■ 5.02
PDCD2-201ENST00000167218 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
PDCD2-201ENST00000167218 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.38■■■■■ 5.02
PDCD2-201ENST00000167218 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.38■■■■■ 5.01
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PDCD2-201ENST00000167218 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.13■■■■■ 4.98
PDCD2-201ENST00000167218 CD109Q6YHK3 1445 aa46.12■■■■■ 4.97
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PDCD2-201ENST00000167218 FMN1Q68DA7 1419 aa45.95■■■■■ 4.95
PDCD2-201ENST00000167218 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.88■■■■■ 4.94
PDCD2-201ENST00000167218 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
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PDCD2-201ENST00000167218 HECW1Q76N89 1606 aa45.8■■■■■ 4.92
PDCD2-201ENST00000167218 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
PDCD2-201ENST00000167218 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.72■■■■■ 4.91
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PDCD2-201ENST00000167218 NEO1Q92859 1461 aa45.64■■■■■ 4.9
PDCD2-201ENST00000167218 CLIP1P30622 1438 aa45.63■■■■■ 4.9
PDCD2-201ENST00000167218 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.63■■■■■ 4.9
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PDCD2-201ENST00000167218 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
PDCD2-201ENST00000167218 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.3■■■■■ 4.84
PDCD2-201ENST00000167218 CEP162Q5TB80 1403 aa45.3■■■■■ 4.84
PDCD2-201ENST00000167218 RICTORQ6R327 1708 aa45.29■■■■■ 4.84
PDCD2-201ENST00000167218 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.23■■■■■ 4.83
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PDCD2-201ENST00000167218 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.15■■■■■ 4.82
PDCD2-201ENST00000167218 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.11■■■■■ 4.81
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