RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006658.10

SPATA20-201, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPATA20, Length 2,719 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-201ENST00000006658 MIER1Q8N108 512 aa22.62■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.59■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.59■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 ARAP1Q96P48 1450 aa22.57■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 APLP2Q06481 763 aa22.55■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.52■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
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SPATA20-201ENST00000006658 WDR97A6NE52 1622 aa22.4■■□□□ 1.18
SPATA20-201ENST00000006658 P3H3Q8IVL6 736 aa22.4■■□□□ 1.18
SPATA20-201ENST00000006658 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.37■■□□□ 1.17
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SPATA20-201ENST00000006658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.35■■□□□ 1.17
SPATA20-201ENST00000006658 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.33■■□□□ 1.17
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SPATA20-201ENST00000006658 CUL7Q14999 1698 aa22.3■■□□□ 1.16
SPATA20-201ENST00000006658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.167e-8■■■□□ 18.3
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SPATA20-201ENST00000006658 ERCC6Q03468 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 WDR62O43379 1518 aa22.16■■□□□ 1.14
SPATA20-201ENST00000006658 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPATA20-201ENST00000006658 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.15■■□□□ 1.14
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SPATA20-201ENST00000006658 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 PBRM1Q86U86 1689 aa22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 IFT140Q96RY7 1462 aa22.1■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 TIAM1Q13009 1591 aa22.09■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 GRIN2BQ13224 1484 aa22.07■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
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SPATA20-201ENST00000006658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 ADAMTS12P58397 1594 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 MSH5O43196 834 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 ITGAEP38570 1179 aa22.02■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 MAP3K1Q13233 1512 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 SAMD9Q5K651 1589 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 FMN1Q68DA7 1419 aa21.97■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.92■■□□□ 1.1
SPATA20-201ENST00000006658 IQGAP2Q13576 1575 aa21.91■■□□□ 1.1
SPATA20-201ENST00000006658 FBLN2P98095 1184 aa21.91■■□□□ 1.1
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SPATA20-201ENST00000006658 ARID3CA6NKF2 412 aa21.86■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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SPATA20-201ENST00000006658 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.85■■□□□ 1.09
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SPATA20-201ENST00000006658 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.84■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.82■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.79■■□□□ 1.08
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SPATA20-201ENST00000006658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.77■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 SYNJ2O15056 1496 aa21.76■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 DISP1Q96F81 1524 aa21.75■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CEP170Q5SW79 1584 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.71■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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SPATA20-201ENST00000006658 KIAA0556O60303 1618 aa21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 HECW1Q76N89 1606 aa21.65■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 JPH4Q96JJ6 628 aa21.64■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 NEFLP07196 543 aa21.64■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.63■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 NUP160Q12769 1436 aa21.63■■□□□ 1.05
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SPATA20-201ENST00000006658 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 KCNH8Q96L42 1107 aa21.59■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.57■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 ARHGEF11O15085 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.52■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 MAPKBP1O60336 1514 aa21.5■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.49■■□□□ 1.03
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