RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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HOXA11-201ENST00000006015 IFT140Q96RY7 1462 aa27.39■■□□□ 1.97
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HOXA11-201ENST00000006015 WDR62O43379 1518 aa27.35■■□□□ 1.97
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HOXA11-201ENST00000006015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
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HOXA11-201ENST00000006015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.29■■□□□ 1.96
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HOXA11-201ENST00000006015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
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HOXA11-201ENST00000006015 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA11-201ENST00000006015 DISP1Q96F81 1524 aa27.19■■□□□ 1.94
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HOXA11-201ENST00000006015 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
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