RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000178728.1

Gm3005-202, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Gm3005, Length 1,955 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Zeb1Q64318 1117 aa23.83■■□□□ 1.41
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Chd1P40201 1711 aa23.79■■□□□ 1.4
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Npm2Q80W85 207 aa23.79■■□□□ 1.4
Gm3005-202ENSMUST00000178728 WizO88286 1684 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Abcc1O35379 1528 aa23.79■■□□□ 1.4
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Adamts12Q811B3 1600 aa23.73■■□□□ 1.39
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Gm156Q58A37 223 aa23.65■■□□□ 1.38
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.56■■□□□ 1.36
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Carmil1Q6EDY6 1374 aa23.54■■□□□ 1.36
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.54■■□□□ 1.36
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Slx4Q6P1D7 1565 aa23.53■■□□□ 1.36
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Map3k1P53349 1493 aa23.52■■□□□ 1.36
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Abca5Q8K448 1642 aa23.46■■□□□ 1.35
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Myt1lP97500 1187 aa23.44■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Setbp1Q9Z180 1582 aa23.42■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ak9G3UYQ4 1894 aa23.41■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Cux1P53564 1515 aa23.4■■□□□ 1.34
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Clip1Q922J3 1391 aa23.38■■□□□ 1.33
Gm3005-202ENSMUST00000178728 AI481877A2ALV5 1481 aa23.35■■□□□ 1.33
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Jph4Q80WT0 628 aa23.31■■□□□ 1.32
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.15■■□□□ 1.3
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Znf608Q56A10 1511 aa23.13■■□□□ 1.29
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.09■■□□□ 1.29
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ttc37F8VPK0 1563 aa23.08■■□□□ 1.29
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.07■■□□□ 1.28
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arid3cA6PWV5 409 aa23.07■■□□□ 1.28
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.05■■□□□ 1.28
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.04■■□□□ 1.28
Gm3005-202ENSMUST00000178728 AdgbG3UZ78 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Wdr7Q920I9 1489 aa23.02■■□□□ 1.28
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Depdc5P61460 1591 aa23.02■■□□□ 1.28
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Pcf11G3X9Z4 1553 aa22.93■■□□□ 1.26
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Atp10dQ8K2X1 1416 aa22.92■■□□□ 1.26
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 BlmO88700 1416 aa22.91■■□□□ 1.26
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.89■■□□□ 1.25
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.85■■□□□ 1.25
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arhgef11Q68FM7 1552 aa22.85■■□□□ 1.25
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Abca8bQ8K440 1620 aa22.85■■□□□ 1.25
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Fancd2Q80V62 1450 aa22.85■■□□□ 1.25
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Fndc1E9Q043 1732 aa22.83■■□□□ 1.24
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Prex2Q3LAC4 1598 aa22.82■■□□□ 1.24
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.8■■□□□ 1.24
Gm3005-202ENSMUST00000178728 AglF8VPN4 1532 aa22.78■■□□□ 1.24
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ncoa3O09000 1398 aa22.72■■□□□ 1.23
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa22.71■■□□□ 1.23
Gm3005-202ENSMUST00000178728 CntlnA2AM05 1397 aa22.7■■□□□ 1.22
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.69■■□□□ 1.22
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Gm3005-202ENSMUST00000178728 Naip1Q9QWK5 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
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