RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AknaQ80VW7 1404 aa33.11■■■□□ 2.89
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abcc1O35379 1528 aa33.1■■■□□ 2.89
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm156Q58A37 223 aa33.09■■■□□ 2.89
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Chd1P40201 1711 aa33.01■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PtprtQ99M80 1454 aa32.99■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa32.99■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa32.99■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CadpsQ80TJ1 1355 aa32.96■■■□□ 2.87
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zeb1Q64318 1117 aa32.94■■■□□ 2.86
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abca16E9PWJ7 1678 aa32.94■■■□□ 2.86
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abcc2Q8VI47 1543 aa32.9■■■□□ 2.86
Sumo3-209ENSMUST00000174113 WizO88286 1684 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32.87■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa32.85■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PxdnQ3UQ28 1475 aa32.84■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pprc1Q6NZN1 1644 aa32.84■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 BC005561E9Q5E2 1589 aa32.83■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Map3k4O08648 1597 aa32.83■■■□□ 2.85
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Neo1P97798 1493 aa32.82■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adamts12Q811B3 1600 aa32.82■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgap27A2AB59 869 aa32.81■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Soga1E1U8D0 1418 aa32.81■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm14025A2AP89 1413 aa32.7■■■□□ 2.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Setbp1Q9Z180 1582 aa32.67■■■□□ 2.82
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Npm2Q80W85 207 aa32.67■■■□□ 2.82
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slx4Q6P1D7 1565 aa32.62■■■□□ 2.81
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Carmil1Q6EDY6 1374 aa32.56■■■□□ 2.8
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AI481877A2ALV5 1481 aa32.55■■■□□ 2.8
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ak9G3UYQ4 1894 aa32.55■■■□□ 2.8
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rpap1Q80TE0 1409 aa32.52■■■□□ 2.8
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Map3k1P53349 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa32.48■■■□□ 2.79
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.45■■■□□ 2.79
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abca5Q8K448 1642 aa32.42■■■□□ 2.78
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Jph4Q80WT0 628 aa32.42■■■□□ 2.78
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa32.4■■■□□ 2.78
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa32.32■■■□□ 2.76
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gab3Q8BSM5 595 aa32.27■■■□□ 2.76
Sumo3-209ENSMUST00000174113 WrnO09053 1401 aa32.25■■■□□ 2.75
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cux1P53564 1515 aa32.22■■■□□ 2.75
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttc37F8VPK0 1563 aa32.17■■■□□ 2.74
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Clip1Q922J3 1391 aa32.16■■■□□ 2.74
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32.16■■■□□ 2.74
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa32.15■■■□□ 2.74
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AdgbG3UZ78 1657 aa32.13■■■□□ 2.73
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Igf1rQ60751 1373 aa32.12■■■□□ 2.73
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cep162Q6ZQ06 1403 aa32.1■■■□□ 2.73
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arid3cA6PWV5 409 aa32.09■■■□□ 2.73
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa32.09■■■□□ 2.73
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fyco1Q8VDC1 1437 aa32.07■■■□□ 2.72
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Znf608Q56A10 1511 aa32.05■■■□□ 2.72
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Depdc5P61460 1591 aa32.02■■■□□ 2.72
Sumo3-209ENSMUST00000174113 HrcG5E8J6 738 aa32.02■■■□□ 2.72
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cul7Q8VE73 1689 aa32■■■□□ 2.71
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Wdr7Q920I9 1489 aa31.99■■■□□ 2.71
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NhsB1AV60 1647 aa31.98■■■□□ 2.71
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa31.96■■■□□ 2.71
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfyve16Q80U44 1528 aa31.94■■■□□ 2.7
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Myt1lP97500 1187 aa31.93■■■□□ 2.7
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa31.93■■■□□ 2.7
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgef11Q68FM7 1552 aa31.88■■■□□ 2.69
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ankrd26Q811D2 1581 aa31.85■■■□□ 2.69
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Atp10dQ8K2X1 1416 aa31.83■■■□□ 2.69
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mroh2aD3Z750 1679 aa31.81■■■□□ 2.68
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fndc1E9Q043 1732 aa31.8■■■□□ 2.68
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gcc2Q8CHG3 1679 aa31.8■■■□□ 2.68
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa31.77■■■□□ 2.68
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa31.74■■■□□ 2.67
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AglF8VPN4 1532 aa31.73■■■□□ 2.67
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa31.7■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 BlmO88700 1416 aa31.68■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Alpk3Q924C5 1678 aa31.68■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ncoa2Q61026 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Aebp1Q640N1 1128 aa31.67■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fancd2Q80V62 1450 aa31.66■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abca8bQ8K440 1620 aa31.66■■■□□ 2.66
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kif27Q7M6Z4 1394 aa31.62■■■□□ 2.65
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arap1Q4LDD4 1452 aa31.59■■■□□ 2.65
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnajc5gQ8C632 165 aa31.59■■■□□ 2.65
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Plppr3Q7TPB0 716 aa31.58■■■□□ 2.65
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Erich3F6QRE9 1637 aa31.56■■■□□ 2.64
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Magi1Q6RHR9 1471 aa31.55■■■□□ 2.64
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Setd5Q5XJV7 1441 aa31.5■■■□□ 2.63
Sumo3-209ENSMUST00000174113 A2mQ6GQT1 1474 aa31.49■■■□□ 2.63
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Prex2Q3LAC4 1598 aa31.48■■■□□ 2.63
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rnf17Q99MV7 1640 aa31.46■■■□□ 2.63
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pcf11G3X9Z4 1553 aa31.43■■■□□ 2.62
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ncoa3O09000 1398 aa31.38■■■□□ 2.61
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.2 ms