RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa19.73■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abcc1O35379 1528 aa19.73■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Grin2aP35436 1464 aa19.71■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Efcab5A0JP43 1406 aa19.68■□□□□ 0.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magi3Q9EQJ9 1476 aa19.68■□□□□ 0.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fmn1Q05860 1466 aa19.67■□□□□ 0.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa19.66■□□□□ 0.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CadpsQ80TJ1 1355 aa19.64■□□□□ 0.73
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Setbp1Q9Z180 1582 aa19.61■□□□□ 0.73
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Soga1E1U8D0 1418 aa19.57■□□□□ 0.72
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Chd1P40201 1711 aa19.52■□□□□ 0.71
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pla2r1Q62028 1487 aa19.48■□□□□ 0.71
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plppr3Q7TPB0 716 aa19.47■□□□□ 0.71
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Neo1P97798 1493 aa19.44■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AI481877A2ALV5 1481 aa19.44■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa19.42■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm14025A2AP89 1413 aa19.42■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgap27A2AB59 869 aa19.42■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ak9G3UYQ4 1894 aa19.41■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpatch8A2A6A1 1505 aa19.4■□□□□ 0.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.39■□□□□ 0.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NrkQ9R0G8 1455 aa19.34■□□□□ 0.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 BC005561E9Q5E2 1589 aa19.34■□□□□ 0.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SynmQ70IV5 1561 aa19.34■□□□□ 0.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abcc2Q8VI47 1543 aa19.33■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Map3k4O08648 1597 aa19.32■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Alpk3Q924C5 1678 aa19.29■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PxdnQ3UQ28 1475 aa19.28■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AdgbG3UZ78 1657 aa19.27■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef11Q68FM7 1552 aa19.27■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa19.26■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ttc37F8VPK0 1563 aa19.25■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zeb1Q64318 1117 aa19.25■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abca16E9PWJ7 1678 aa19.24■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa19.24■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arid3cA6PWV5 409 aa19.23■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Shroom4Q1W617 1475 aa19.23■□□□□ 0.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 WizO88286 1684 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Jph4Q80WT0 628 aa19.18■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Depdc5P61460 1591 aa19.17■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slx4Q6P1D7 1565 aa19.16■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyb5rlB1AS42 316 aa19.16■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnajc5gQ8C632 165 aa19.15■□□□□ 0.66
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adamts12Q811B3 1600 aa19.13■□□□□ 0.65
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfyve16Q80U44 1528 aa19.11■□□□□ 0.65
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fndc1E9Q043 1732 aa19.11■□□□□ 0.65
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa19.07■□□□□ 0.64
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Igf1rQ60751 1373 aa19.07■□□□□ 0.64
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rpap1Q80TE0 1409 aa19.05■□□□□ 0.64
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf608Q56A10 1511 aa19.02■□□□□ 0.63
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa18.96■□□□□ 0.63
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kdm5bQ80Y84 1544 aa18.95■□□□□ 0.62
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa18.95■□□□□ 0.62
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa18.94■□□□□ 0.62
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr7Q920I9 1489 aa18.94■□□□□ 0.62
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Brwd3A2AHJ4 1799 aa18.9■□□□□ 0.62
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hecw2Q6I6G8 1578 aa18.89■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 WrnO09053 1401 aa18.89■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abca5Q8K448 1642 aa18.87■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AglF8VPN4 1532 aa18.86■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.85■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa18.85■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fbxo41Q6NS60 873 aa18.84■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Npm2Q80W85 207 aa18.84■□□□□ 0.61
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rnf17Q99MV7 1640 aa18.81■□□□□ 0.6
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp10dQ8K2X1 1416 aa18.8■□□□□ 0.6
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Map3k1P53349 1493 aa18.79■□□□□ 0.6
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Naip2Q9QUK4 1447 aa18.77■□□□□ 0.59
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NhsB1AV60 1647 aa18.76■□□□□ 0.59
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa18.72■□□□□ 0.59
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cul7Q8VE73 1689 aa18.68■□□□□ 0.58
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 A2mQ6GQT1 1474 aa18.68■□□□□ 0.58
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa18.65■□□□□ 0.58
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cypt1Q8CH20 168 aa18.65■□□□□ 0.58
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PtprmP28828 1452 aa18.62■□□□□ 0.57
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.59■□□□□ 0.57
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cux1P53564 1515 aa18.58■□□□□ 0.57
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MyclP10166 368 aa18.55■□□□□ 0.56
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abca8bQ8K440 1620 aa18.55■□□□□ 0.56
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Synj2Q9D2G5 1434 aa18.53■□□□□ 0.56
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fancd2Q80V62 1450 aa18.52■□□□□ 0.56
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mroh2aD3Z750 1679 aa18.51■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gcc2Q8CHG3 1679 aa18.51■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fyco1Q8VDC1 1437 aa18.5■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa18.49■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Clip1Q922J3 1391 aa18.48■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa18.48■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Neurl4Q5NCX5 1563 aa18.48■□□□□ 0.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Qser1A2BIE1 1698 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 1014.2 ms