RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.21■■□□□ 1.63
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ScribQ80U72 1612 aa24.71■■□□□ 1.55
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NacadQ5SWP3 1504 aa23.85■■□□□ 1.41
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa23.83■■□□□ 1.4
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23.77■■□□□ 1.4
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kdm5dQ62240 1548 aa23.74■■□□□ 1.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Chic1Q8CBW7 227 aa23.5■■□□□ 1.35
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.42■■□□□ 1.34
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 BicraF8VPZ9 1578 aa23.21■■□□□ 1.31
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.45■■□□□ 1.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.39■■□□□ 1.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.22■■□□□ 1.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnajc5P60904 198 aa22.18■■□□□ 1.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.11■■□□□ 1.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Baz1aO88379 1555 aa22.08■■□□□ 1.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.08■■□□□ 1.12
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trim41Q5NCC3 630 aa21.83■■□□□ 1.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.82■■□□□ 1.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Frmpd1A2AKB4 1549 aa21.79■■□□□ 1.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.79■■□□□ 1.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Baz1bQ9Z277 1479 aa21.78■■□□□ 1.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rhox8Q6VSS7 320 aa21.74■■□□□ 1.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.73■■□□□ 1.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.67■■□□□ 1.06
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mrc2Q64449 1479 aa21.62■■□□□ 1.05
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Unc13aQ4KUS2 1712 aa21.35■■□□□ 1.01
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.16■□□□□ 0.98
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Shroom2A2ALU4 1481 aa21.04■□□□□ 0.96
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CftrP26361 1476 aa21.01■□□□□ 0.95
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cux2P70298 1426 aa20.95■□□□□ 0.94
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Col17a1Q07563 1470 aa20.93■□□□□ 0.94
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa20.93■□□□□ 0.94
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Synj1Q8CHC4 1574 aa20.88■□□□□ 0.93
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kif21aQ9QXL2 1672 aa20.87■□□□□ 0.93
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.82■□□□□ 0.92
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.52■□□□□ 0.88
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.5■□□□□ 0.87
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa20.46■□□□□ 0.87
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Il27Q8K3I6 234 aa20.36■□□□□ 0.85
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rusc2Q80U22 1514 aa20.33■□□□□ 0.85
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.28■□□□□ 0.84
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ift140E9PY46 1464 aa20.26■□□□□ 0.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.25■□□□□ 0.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rtl1Q7M732 1744 aa20.24■□□□□ 0.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.24■□□□□ 0.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.21■□□□□ 0.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.19■□□□□ 0.82
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm156Q58A37 223 aa20.06■□□□□ 0.8
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Golga3P55937 1487 aa19.95■□□□□ 0.78
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Samd9lQ69Z37 1561 aa19.81■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Setd1bQ8CFT2 1985 aa19.81■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pprc1Q6NZN1 1644 aa19.8■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gab3Q8BSM5 595 aa19.8■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.78■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Grin2bQ01097 1482 aa19.77■□□□□ 0.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AknaQ80VW7 1404 aa19.76■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rad54l2Q99NG0 1466 aa19.74■□□□□ 0.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa19.73■□□□□ 0.75
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