Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.59■■■■■ 7.13
PtprmP28828 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.75■■■■■ 6.51
PtprmP28828 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
PtprmP28828 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.32■■■■■ 5.97
PtprmP28828 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
PtprmP28828 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
PtprmP28828 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
PtprmP28828 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
PtprmP28828 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
PtprmP28828 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
PtprmP28828 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
PtprmP28828 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
PtprmP28828 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
PtprmP28828 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
PtprmP28828 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
PtprmP28828 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.56■■■■■ 5.36
PtprmP28828 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PtprmP28828 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PtprmP28828 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
PtprmP28828 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.43■■■■■ 5.18
PtprmP28828 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
PtprmP28828 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.11■■■■■ 5.13
PtprmP28828 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
PtprmP28828 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
PtprmP28828 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
PtprmP28828 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
PtprmP28828 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
PtprmP28828 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.72■■■■■ 4.91
PtprmP28828 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
PtprmP28828 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
PtprmP28828 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
PtprmP28828 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PtprmP28828 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PtprmP28828 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
PtprmP28828 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PtprmP28828 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
PtprmP28828 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
PtprmP28828 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PtprmP28828 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
PtprmP28828 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PtprmP28828 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PtprmP28828 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PtprmP28828 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PtprmP28828 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PtprmP28828 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PtprmP28828 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
PtprmP28828 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
PtprmP28828 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
PtprmP28828 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
PtprmP28828 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PtprmP28828 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PtprmP28828 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PtprmP28828 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PtprmP28828 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PtprmP28828 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PtprmP28828 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
PtprmP28828 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PtprmP28828 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
PtprmP28828 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PtprmP28828 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PtprmP28828 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
PtprmP28828 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PtprmP28828 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PtprmP28828 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PtprmP28828 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PtprmP28828 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PtprmP28828 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
PtprmP28828 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PtprmP28828 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PtprmP28828 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PtprmP28828 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PtprmP28828 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PtprmP28828 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
PtprmP28828 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PtprmP28828 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PtprmP28828 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PtprmP28828 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PtprmP28828 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PtprmP28828 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PtprmP28828 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PtprmP28828 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PtprmP28828 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PtprmP28828 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PtprmP28828 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
PtprmP28828 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PtprmP28828 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PtprmP28828 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PtprmP28828 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PtprmP28828 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PtprmP28828 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PtprmP28828 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
PtprmP28828 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PtprmP28828 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PtprmP28828 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PtprmP28828 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms