Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.65■■■■■ 7.14
Ercc6l2Q9JIM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56■■■■■ 6.56
Ercc6l2Q9JIM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.62■■■■■ 6.01
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
Ercc6l2Q9JIM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
Ercc6l2Q9JIM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
Ercc6l2Q9JIM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
Ercc6l2Q9JIM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Ercc6l2Q9JIM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
Ercc6l2Q9JIM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Ercc6l2Q9JIM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Ercc6l2Q9JIM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
Ercc6l2Q9JIM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Ercc6l2Q9JIM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.31■■■■■ 5
Ercc6l2Q9JIM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
Ercc6l2Q9JIM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
Ercc6l2Q9JIM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Ercc6l2Q9JIM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
Ercc6l2Q9JIM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Ercc6l2Q9JIM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Ercc6l2Q9JIM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Ercc6l2Q9JIM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Ercc6l2Q9JIM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Ercc6l2Q9JIM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Ercc6l2Q9JIM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Ercc6l2Q9JIM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Ercc6l2Q9JIM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ercc6l2Q9JIM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Ercc6l2Q9JIM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
Ercc6l2Q9JIM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Ercc6l2Q9JIM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Ercc6l2Q9JIM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Ercc6l2Q9JIM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Ercc6l2Q9JIM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ercc6l2Q9JIM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
Ercc6l2Q9JIM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
Ercc6l2Q9JIM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ercc6l2Q9JIM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Ercc6l2Q9JIM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ercc6l2Q9JIM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ercc6l2Q9JIM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Ercc6l2Q9JIM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ercc6l2Q9JIM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Ercc6l2Q9JIM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ercc6l2Q9JIM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ercc6l2Q9JIM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Ercc6l2Q9JIM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ercc6l2Q9JIM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
Ercc6l2Q9JIM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Ercc6l2Q9JIM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ercc6l2Q9JIM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ercc6l2Q9JIM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Ercc6l2Q9JIM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ercc6l2Q9JIM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ercc6l2Q9JIM3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
Ercc6l2Q9JIM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ercc6l2Q9JIM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ercc6l2Q9JIM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1400.9 ms