RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpatch8A2A6A1 1505 aa30.85■■■□□ 2.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpap1Q80TE0 1409 aa30.81■■■□□ 2.52
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cux1P53564 1515 aa30.81■■■□□ 2.52
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Grin2aP35436 1464 aa30.77■■■□□ 2.52
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.42■■■□□ 2.3
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