RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000094245.3

Cldn3-201, Transcript of Claudin-3, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn3, Length 1,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.97■■■□□ 2.71
Cldn3-201ENSMUST00000094245 PtprtQ99M80 1454 aa31.97■■■□□ 2.71
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abcc1O35379 1528 aa31.96■■■□□ 2.71
Cldn3-201ENSMUST00000094245 SynmQ70IV5 1561 aa31.94■■■□□ 2.7
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Shroom4Q1W617 1475 aa31.93■■■□□ 2.7
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CadpsQ80TJ1 1355 aa31.81■■■□□ 2.68
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Chd1P40201 1711 aa31.81■■■□□ 2.68
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pprc1Q6NZN1 1644 aa31.77■■■□□ 2.68
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa31.77■■■□□ 2.68
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zeb1Q64318 1117 aa31.75■■■□□ 2.67
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Chic1Q8CBW7 227 aa31.73■■■□□ 2.67
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Soga1E1U8D0 1418 aa31.71■■■□□ 2.67
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abca16E9PWJ7 1678 aa31.69■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Neo1P97798 1493 aa31.68■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa31.67■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abcc2Q8VI47 1543 aa31.65■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 BC005561E9Q5E2 1589 aa31.65■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgap27A2AB59 869 aa31.64■■■□□ 2.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Map3k4O08648 1597 aa31.63■■■□□ 2.65
Cldn3-201ENSMUST00000094245 WizO88286 1684 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
Cldn3-201ENSMUST00000094245 PxdnQ3UQ28 1475 aa31.6■■■□□ 2.65
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Setbp1Q9Z180 1582 aa31.57■■■□□ 2.64
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm14025A2AP89 1413 aa31.57■■■□□ 2.64
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Adamts12Q811B3 1600 aa31.55■■■□□ 2.64
Cldn3-201ENSMUST00000094245 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa31.47■■■□□ 2.63
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AI481877A2ALV5 1481 aa31.44■■■□□ 2.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa31.43■■■□□ 2.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ak9G3UYQ4 1894 aa31.42■■■□□ 2.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Npm2Q80W85 207 aa31.4■■■□□ 2.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slx4Q6P1D7 1565 aa31.39■■■□□ 2.61
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa31.31■■■□□ 2.6
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rpap1Q80TE0 1409 aa31.31■■■□□ 2.6
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31.25■■■□□ 2.59
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa31.23■■■□□ 2.59
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Jph4Q80WT0 628 aa31.23■■■□□ 2.59
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Map3k1P53349 1493 aa31.19■■■□□ 2.58
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abca5Q8K448 1642 aa31.14■■■□□ 2.58
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AdgbG3UZ78 1657 aa31.1■■■□□ 2.57
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ttc37F8VPK0 1563 aa31.09■■■□□ 2.57
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgap35Q91YM2 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa31.04■■■□□ 2.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 WrnO09053 1401 aa31.03■■■□□ 2.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arid3cA6PWV5 409 aa31.02■■■□□ 2.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa31.01■■■□□ 2.55
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa30.98■■■□□ 2.55
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kdm5bQ80Y84 1544 aa30.97■■■□□ 2.55
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Igf1rQ60751 1373 aa30.96■■■□□ 2.55
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Depdc5P61460 1591 aa30.96■■■□□ 2.55
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf608Q56A10 1511 aa30.92■■■□□ 2.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cux1P53564 1515 aa30.91■■■□□ 2.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.9■■■□□ 2.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gab3Q8BSM5 595 aa30.89■■■□□ 2.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Wdr7Q920I9 1489 aa30.87■■■□□ 2.53
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zfyve16Q80U44 1528 aa30.86■■■□□ 2.53
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Clip1Q922J3 1391 aa30.83■■■□□ 2.53
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NhsB1AV60 1647 aa30.78■■■□□ 2.52
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fyco1Q8VDC1 1437 aa30.78■■■□□ 2.52
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.77■■■□□ 2.52
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fndc1E9Q043 1732 aa30.77■■■□□ 2.52
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cul7Q8VE73 1689 aa30.77■■■□□ 2.52
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa30.73■■■□□ 2.51
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plppr3Q7TPB0 716 aa30.72■■■□□ 2.51
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Alpk3Q924C5 1678 aa30.71■■■□□ 2.51
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cep162Q6ZQ06 1403 aa30.69■■■□□ 2.5
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atp10dQ8K2X1 1416 aa30.68■■■□□ 2.5
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Myt1lP97500 1187 aa30.64■■■□□ 2.5
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AglF8VPN4 1532 aa30.62■■■□□ 2.49
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mroh2aD3Z750 1679 aa30.57■■■□□ 2.48
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gcc2Q8CHG3 1679 aa30.57■■■□□ 2.48
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dnajc5gQ8C632 165 aa30.56■■■□□ 2.48
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ankrd26Q811D2 1581 aa30.5■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.48■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ncoa2Q61026 1462 aa30.48■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa30.47■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fancd2Q80V62 1450 aa30.46■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abca8bQ8K440 1620 aa30.46■■■□□ 2.47
Cldn3-201ENSMUST00000094245 BlmO88700 1416 aa30.44■■■□□ 2.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rnf17Q99MV7 1640 aa30.43■■■□□ 2.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 HrcG5E8J6 738 aa30.4■■■□□ 2.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 A2mQ6GQT1 1474 aa30.39■■■□□ 2.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kif27Q7M6Z4 1394 aa30.39■■■□□ 2.45
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arap1Q4LDD4 1452 aa30.38■■■□□ 2.45
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aebp1Q640N1 1128 aa30.37■■■□□ 2.45
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Magi1Q6RHR9 1471 aa30.33■■■□□ 2.45
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.27■■■□□ 2.44
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prex2Q3LAC4 1598 aa30.27■■■□□ 2.44
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa30.21■■■□□ 2.43
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Setd5Q5XJV7 1441 aa30.18■■■□□ 2.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Erich3F6QRE9 1637 aa30.17■■■□□ 2.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.3 ms