RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aplp2Q06335 707 aa23.4■■□□□ 1.34
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm20521D3Z5F7 333 aa23.27■■□□□ 1.32
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stag3O70576 1240 aa23.21■■□□□ 1.31
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrs2Q5NCE8 434 aa23.17■■□□□ 1.3
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plin1Q8CGN5 517 aa23.07■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.06■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AknaQ80VW7 1404 aa23.06■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neurod2Q62414 383 aa23.05■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sox12Q04890 314 aa23.04■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa23.04■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm6268A2A3U9 297 aa23.03■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk26Q99JT2 416 aa23.02■■□□□ 1.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myt1Q8CFC2 1127 aa23■■□□□ 1.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep164Q5DU05 1446 aa23■■□□□ 1.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.96■■□□□ 1.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psme1P97371 249 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Card11Q8CIS0 1159 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmod3E9QA62 571 aa22.9■■□□□ 1.26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.89■■□□□ 1.25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.87■■□□□ 1.25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Txndc2Q6P902 515 aa22.87■■□□□ 1.25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calr4Q3TQS0 420 aa22.87■■□□□ 1.25
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnnt1O88346 262 aa22.78■■□□□ 1.24
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ciz1Q8VEH2 845 aa22.74■■□□□ 1.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chrna2Q91X60 512 aa22.73■■□□□ 1.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22.71■■□□□ 1.23
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.67■■□□□ 1.22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lemd3Q9WU40 921 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HdgfP51859 237 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eea1Q8BL66 1411 aa22.62■■□□□ 1.21
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpap1Q80TE0 1409 aa22.6■■□□□ 1.21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anapc15P60007 132 aa22.48■■□□□ 1.19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp777B9EKF4 885 aa22.48■■□□□ 1.19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Golga3P55937 1487 aa22.47■■□□□ 1.19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q3TQI7 289 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pibf1E9Q6K3 756 aa22.47■■□□□ 1.19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.45■■□□□ 1.18
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chmp3Q9CQ10 224 aa22.42■■□□□ 1.18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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