Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Ppp4r2Q0VGB7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ppp4r2Q0VGB7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Ppp4r2Q0VGB7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Ppp4r2Q0VGB7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Ppp4r2Q0VGB7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ppp4r2Q0VGB7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ppp4r2Q0VGB7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ppp4r2Q0VGB7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ppp4r2Q0VGB7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ppp4r2Q0VGB7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ppp4r2Q0VGB7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ppp4r2Q0VGB7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ppp4r2Q0VGB7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ppp4r2Q0VGB7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ppp4r2Q0VGB7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ppp4r2Q0VGB7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ppp4r2Q0VGB7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ppp4r2Q0VGB7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ppp4r2Q0VGB7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ppp4r2Q0VGB7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ppp4r2Q0VGB7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ppp4r2Q0VGB7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ppp4r2Q0VGB7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ppp4r2Q0VGB7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ppp4r2Q0VGB7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ppp4r2Q0VGB7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Ppp4r2Q0VGB7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ppp4r2Q0VGB7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ppp4r2Q0VGB7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ppp4r2Q0VGB7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ppp4r2Q0VGB7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ppp4r2Q0VGB7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ppp4r2Q0VGB7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ppp4r2Q0VGB7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ppp4r2Q0VGB7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ppp4r2Q0VGB7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ppp4r2Q0VGB7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ppp4r2Q0VGB7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ppp4r2Q0VGB7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ppp4r2Q0VGB7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ppp4r2Q0VGB7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ppp4r2Q0VGB7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ppp4r2Q0VGB7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ppp4r2Q0VGB7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ppp4r2Q0VGB7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ppp4r2Q0VGB7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Ppp4r2Q0VGB7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ppp4r2Q0VGB7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ppp4r2Q0VGB7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ppp4r2Q0VGB7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ppp4r2Q0VGB7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ppp4r2Q0VGB7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ppp4r2Q0VGB7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ppp4r2Q0VGB7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ppp4r2Q0VGB7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ppp4r2Q0VGB7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ppp4r2Q0VGB7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ppp4r2Q0VGB7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ppp4r2Q0VGB7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Ppp4r2Q0VGB7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Ppp4r2Q0VGB7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ppp4r2Q0VGB7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.5 ms