Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6K3

Pibf1, Progesterone immunomodulatory-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pibf1E9Q6K3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
Pibf1E9Q6K3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Pibf1E9Q6K3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Pibf1E9Q6K3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Pibf1E9Q6K3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Pibf1E9Q6K3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Pibf1E9Q6K3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Pibf1E9Q6K3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
Pibf1E9Q6K3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Pibf1E9Q6K3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Pibf1E9Q6K3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Pibf1E9Q6K3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Pibf1E9Q6K3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Pibf1E9Q6K3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Pibf1E9Q6K3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Pibf1E9Q6K3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Pibf1E9Q6K3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pibf1E9Q6K3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Pibf1E9Q6K3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Pibf1E9Q6K3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Pibf1E9Q6K3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Pibf1E9Q6K3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Pibf1E9Q6K3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pibf1E9Q6K3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pibf1E9Q6K3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Pibf1E9Q6K3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pibf1E9Q6K3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Pibf1E9Q6K3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Pibf1E9Q6K3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Pibf1E9Q6K3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Pibf1E9Q6K3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Pibf1E9Q6K3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pibf1E9Q6K3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Pibf1E9Q6K3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Pibf1E9Q6K3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Pibf1E9Q6K3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pibf1E9Q6K3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Pibf1E9Q6K3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pibf1E9Q6K3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Pibf1E9Q6K3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pibf1E9Q6K3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pibf1E9Q6K3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Pibf1E9Q6K3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Pibf1E9Q6K3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pibf1E9Q6K3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pibf1E9Q6K3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pibf1E9Q6K3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Pibf1E9Q6K3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Pibf1E9Q6K3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pibf1E9Q6K3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pibf1E9Q6K3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pibf1E9Q6K3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pibf1E9Q6K3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pibf1E9Q6K3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pibf1E9Q6K3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Pibf1E9Q6K3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pibf1E9Q6K3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pibf1E9Q6K3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pibf1E9Q6K3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pibf1E9Q6K3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pibf1E9Q6K3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pibf1E9Q6K3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Pibf1E9Q6K3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pibf1E9Q6K3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Pibf1E9Q6K3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pibf1E9Q6K3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Pibf1E9Q6K3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pibf1E9Q6K3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pibf1E9Q6K3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pibf1E9Q6K3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pibf1E9Q6K3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pibf1E9Q6K3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pibf1E9Q6K3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pibf1E9Q6K3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pibf1E9Q6K3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pibf1E9Q6K3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pibf1E9Q6K3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pibf1E9Q6K3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Pibf1E9Q6K3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Pibf1E9Q6K3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pibf1E9Q6K3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pibf1E9Q6K3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pibf1E9Q6K3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pibf1E9Q6K3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pibf1E9Q6K3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pibf1E9Q6K3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pibf1E9Q6K3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Pibf1E9Q6K3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pibf1E9Q6K3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pibf1E9Q6K3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pibf1E9Q6K3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pibf1E9Q6K3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pibf1E9Q6K3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pibf1E9Q6K3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms