Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQI7

Telomere length and silencing protein 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.88■■■■■ 5.42
Q3TQI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Q3TQI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Q3TQI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Q3TQI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
Q3TQI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
Q3TQI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Q3TQI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Q3TQI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Q3TQI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Q3TQI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Q3TQI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Q3TQI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Q3TQI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Q3TQI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Q3TQI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Q3TQI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Q3TQI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Q3TQI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Q3TQI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Q3TQI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Q3TQI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Q3TQI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Q3TQI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Q3TQI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Q3TQI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Q3TQI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Q3TQI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Q3TQI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Q3TQI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Q3TQI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Q3TQI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Q3TQI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Q3TQI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Q3TQI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Q3TQI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Q3TQI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Q3TQI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Q3TQI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Q3TQI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Q3TQI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Q3TQI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Q3TQI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Q3TQI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Q3TQI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Q3TQI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Q3TQI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Q3TQI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Q3TQI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Q3TQI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Q3TQI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Q3TQI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Q3TQI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Q3TQI7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Q3TQI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Q3TQI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Q3TQI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Q3TQI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Q3TQI7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Q3TQI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Q3TQI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Q3TQI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Q3TQI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Q3TQI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Q3TQI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Q3TQI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Q3TQI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Q3TQI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Q3TQI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Q3TQI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Q3TQI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Q3TQI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Q3TQI7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Q3TQI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Q3TQI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Q3TQI7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Q3TQI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Q3TQI7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Q3TQI7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Q3TQI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Q3TQI7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Q3TQI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Q3TQI7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Q3TQI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Q3TQI7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Q3TQI7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Q3TQI7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Q3TQI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Q3TQI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Q3TQI7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Q3TQI7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Q3TQI7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Q3TQI7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Q3TQI7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Q3TQI7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Q3TQI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Q3TQI7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Q3TQI7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Q3TQI7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Q3TQI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms