RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032198.10

Usp18-201, Transcript of Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp18, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20.58■□□□□ 0.88
Usp18-201ENSMUST00000032198 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.54■□□□□ 0.88
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ankrd26Q811D2 1581 aa20.54■□□□□ 0.88
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.53■□□□□ 0.88
Usp18-201ENSMUST00000032198 Erich3F6QRE9 1637 aa20.51■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cux1P53564 1515 aa20.47■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.47■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pla2r1Q62028 1487 aa20.47■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.46■□□□□ 0.87
Usp18-201ENSMUST00000032198 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.44■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Grin2aP35436 1464 aa20.43■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.43■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.41■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 UbtfP25976 765 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pcf11G3X9Z4 1553 aa20.4■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fyco1Q8VDC1 1437 aa20.39■□□□□ 0.86
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.39■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.37■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 Tiam1Q60610 1591 aa20.35■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gpatch8A2A6A1 1505 aa20.34■□□□□ 0.85
Usp18-201ENSMUST00000032198 Dnajc5P60904 198 aa20.3■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mier1Q5UAK0 511 aa20.3■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Adamts12Q811B3 1600 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Naip1Q9QWK5 1403 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 WizO88286 1684 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Usp18-201ENSMUST00000032198 Abca5Q8K448 1642 aa20.27■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 Slx4Q6P1D7 1565 aa20.25■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 CntlnA2AM05 1397 aa20.25■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 CadpsQ80TJ1 1355 aa20.25■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa20.25■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 Peg3Q3URU2 1571 aa20.22■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 BlmO88700 1416 aa20.21■□□□□ 0.83
Usp18-201ENSMUST00000032198 Abca16E9PWJ7 1678 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 Aebp1Q640N1 1128 aa20.19■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 PxdnQ3UQ28 1475 aa20.18■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 Soga1E1U8D0 1418 aa20.17■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.16■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 Col17a1Q07563 1470 aa20.15■□□□□ 0.82
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.12■□□□□ 0.81
Usp18-201ENSMUST00000032198 AknaQ80VW7 1404 aa20.11■□□□□ 0.81
Usp18-201ENSMUST00000032198 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.1■□□□□ 0.81
Usp18-201ENSMUST00000032198 Abcc2Q8VI47 1543 aa20.08■□□□□ 0.81
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 NefmP08553 848 aa20.06■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20.04■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arhgap27A2AB59 869 aa20.04■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.03■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 Abcc1O35379 1528 aa20.02■□□□□ 0.8
Usp18-201ENSMUST00000032198 WrnO09053 1401 aa20.01■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Chd1P40201 1711 aa20.01■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Map3k4O08648 1597 aa19.99■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Neo1P97798 1493 aa19.98■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa19.97■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cep170Q6A065 1588 aa19.97■□□□□ 0.79
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa19.92■□□□□ 0.78
Usp18-201ENSMUST00000032198 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa19.89■□□□□ 0.78
Usp18-201ENSMUST00000032198 Adgrl3Q80TS3 1537 aa19.89■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 NexmifQ5DTT1 1515 aa19.88■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa19.87■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 PtprtQ99M80 1454 aa19.86■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ccnb3Q810T2 1396 aa19.85■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gm14025A2AP89 1413 aa19.85■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gcc2Q8CHG3 1679 aa19.84■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Gm156Q58A37 223 aa19.83■□□□□ 0.77
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mug1P28665 1476 aa19.82■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arhgef11Q68FM7 1552 aa19.82■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa19.81■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Kdm5bQ80Y84 1544 aa19.81■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ncoa2Q61026 1462 aa19.8■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa19.8■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ncoa3O09000 1398 aa19.79■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Jph4Q80WT0 628 aa19.75■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 A2mQ6GQT1 1474 aa19.74■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa19.73■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mroh2aD3Z750 1679 aa19.73■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa19.72■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mia2Q91ZV0 1396 aa19.72■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Magi1Q6RHR9 1471 aa19.71■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa19.71■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Naip2Q9QUK4 1447 aa19.71■□□□□ 0.75
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fhad1A6PWD2 1420 aa19.69■□□□□ 0.74
Usp18-201ENSMUST00000032198 Pprc1Q6NZN1 1644 aa19.68■□□□□ 0.74
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa19.67■□□□□ 0.74
Usp18-201ENSMUST00000032198 Vps8Q0P5W1 1427 aa19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.2 ms