RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arap1Q4LDD4 1452 aa34.24■■■■□ 3.07
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
Opn3-201ENSMUST00000027809 Grin2aP35436 1464 aa34.21■■■■□ 3.07
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cux1P53564 1515 aa34.21■■■■□ 3.07
Opn3-201ENSMUST00000027809 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
Opn3-201ENSMUST00000027809 Setd5Q5XJV7 1441 aa34.19■■■■□ 3.06
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa34.14■■■■□ 3.06
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa34.14■■■■□ 3.06
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rpap1Q80TE0 1409 aa34.11■■■■□ 3.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fyco1Q8VDC1 1437 aa34.08■■■■□ 3.05
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Setd1bQ8CFT2 1985 aa34.04■■■■□ 3.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pcf11G3X9Z4 1553 aa34.03■■■■□ 3.04
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adamts12Q811B3 1600 aa33.98■■■■□ 3.03
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tiam1Q60610 1591 aa33.95■■■■□ 3.02
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa33.94■■■■□ 3.02
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abca5Q8K448 1642 aa33.9■■■■□ 3.02
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rusc2Q80U22 1514 aa33.9■■■■□ 3.02
Opn3-201ENSMUST00000027809 CadpsQ80TJ1 1355 aa33.89■■■■□ 3.02
Opn3-201ENSMUST00000027809 WizO88286 1684 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
Opn3-201ENSMUST00000027809 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa33.86■■■■□ 3.01
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa33.84■■■■□ 3.01
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33.83■■■■□ 3.01
Opn3-201ENSMUST00000027809 Naip1Q9QWK5 1403 aa33.83■■■■□ 3.01
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa33.82■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Peg3Q3URU2 1571 aa33.81■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abca16E9PWJ7 1678 aa33.8■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 CntlnA2AM05 1397 aa33.8■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slx4Q6P1D7 1565 aa33.77■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 PxdnQ3UQ28 1475 aa33.77■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Soga1E1U8D0 1418 aa33.77■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 BlmO88700 1416 aa33.76■■■■□ 3
Opn3-201ENSMUST00000027809 UbtfP25976 765 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
Opn3-201ENSMUST00000027809 Aebp1Q640N1 1128 aa33.68■■■□□ 2.98
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abcc2Q8VI47 1543 aa33.65■■■□□ 2.98
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mier1Q5UAK0 511 aa33.58■■■□□ 2.97
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa33.54■■■□□ 2.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33.49■■■□□ 2.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Map3k4O08648 1597 aa33.49■■■□□ 2.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Shroom2A2ALU4 1481 aa33.48■■■□□ 2.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif27Q7M6Z4 1394 aa33.42■■■□□ 2.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 WrnO09053 1401 aa33.42■■■□□ 2.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgap27A2AB59 869 aa33.4■■■□□ 2.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lmod2Q3UHZ5 550 aa33.32■■■□□ 2.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 BC005561E9Q5E2 1589 aa33.32■■■□□ 2.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fgd6Q69ZL1 1399 aa33.31■■■□□ 2.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa33.29■■■□□ 2.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa33.28■■■□□ 2.92
Opn3-201ENSMUST00000027809 Neo1P97798 1493 aa33.19■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 NefmP08553 848 aa33.17■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa33.16■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 NexmifQ5DTT1 1515 aa33.15■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef11Q68FM7 1552 aa33.14■■■□□ 2.9
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gcc2Q8CHG3 1679 aa33.13■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mug1P28665 1476 aa33.12■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa33.11■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncoa2Q61026 1462 aa33.09■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 AknaQ80VW7 1404 aa33.09■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa33.08■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ncoa3O09000 1398 aa33.08■■■□□ 2.89
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ccnb3Q810T2 1396 aa33.07■■■□□ 2.88
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kdm5bQ80Y84 1544 aa33.07■■■□□ 2.88
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa33.02■■■□□ 2.88
Opn3-201ENSMUST00000027809 Jph4Q80WT0 628 aa33■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mroh2aD3Z750 1679 aa33■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa32.98■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abcc1O35379 1528 aa32.96■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Magi1Q6RHR9 1471 aa32.95■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm14025A2AP89 1413 aa32.95■■■□□ 2.87
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
Opn3-201ENSMUST00000027809 A2mQ6GQT1 1474 aa32.91■■■□□ 2.86
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa32.88■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Chd1P40201 1711 aa32.88■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Naip2Q9QUK4 1447 aa32.87■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam163aQ8CAA5 168 aa32.85■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mia2Q91ZV0 1396 aa32.83■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fhad1A6PWD2 1420 aa32.83■■■□□ 2.85
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prex2Q3LAC4 1598 aa32.8■■■□□ 2.84
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fancd2Q80V62 1450 aa32.79■■■□□ 2.84
Opn3-201ENSMUST00000027809 Vps8Q0P5W1 1427 aa32.77■■■□□ 2.84
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adcy10Q8C0T9 1614 aa32.75■■■□□ 2.83
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa32.73■■■□□ 2.83
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cul7Q8VE73 1689 aa32.71■■■□□ 2.83
Opn3-201ENSMUST00000027809 UacaQ8CGB3 1411 aa32.7■■■□□ 2.83
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa32.69■■■□□ 2.82
Opn3-201ENSMUST00000027809 NhsB1AV60 1647 aa32.68■■■□□ 2.82
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa32.65■■■□□ 2.82
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa32.63■■■□□ 2.81
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wdr7Q920I9 1489 aa32.62■■■□□ 2.81
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abcc5Q9R1X5 1436 aa32.62■■■□□ 2.81
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rfx7F8VPJ6 1459 aa32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.2 ms