RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	SEC65	P29478	273 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	AFG3	P39925	761 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	STR2	P47164	639 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	HFM1	P51979	1187 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	YNL146W	P53906	100 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	ATG11	Q12527	1178 aa		6.21	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.21	□□□□□ -1.42	not detected
AMD1	YML035C	PAH1	P32567	862 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	NPP2	P39997	493 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	TIM8	P57744	87 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SPO75	Q07798	868 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	TMT1	P32643	299 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	KTR2	P33550	425 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VFA1	P40080	203 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VPS62	P53285	467 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	HMI1	Q12039	706 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YOL098C	Q12496	1037 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.2	□□□□□ -1.42	RIP-Chip
AMD1	YML035C	SWI6	P09959	803 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MSS51	P32335	436 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SDS3	P40505	327 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ACF4	P47129	309 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ENV11	P53246	860 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YCG1	Q06680	1035 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MLH2	Q07980	695 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	CHS2	P14180	963 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	DUR3	P33413	735 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	LTV1	P34078	463 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YLR297W	Q05899	129 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RAD26	P40352	1085 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YLR287C	Q05881	355 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	WHI2	P12611	486 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	LDH1	P38139	375 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SEC9	P40357	651 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.18	□□□□□ -1.42	RIP-Chip
AMD1	YML035C	ORC5	P50874	479 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YGR130C	P53278	816 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VID24	P38263	362 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SMC3	P47037	1230 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ALF1	P53904	254 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	TRS130	Q03660	1102 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YPR078C	Q06813	372 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ATG9	Q12142	997 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MAM3	Q12296	706 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YDL206W	Q12424	762 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	BUD2	P33314	1104 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.17	□□□□□ -1.42	not detected
AMD1	YML035C	UIP5	P36137	443 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MRX3	P38172	270 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	MMS4	P38257	691 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YAP1801	P38856	637 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	DAS1	P47005	663 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ESBP6	P53918	673 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YDR090C	Q03193	310 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	LAA1	P39526	2014 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	FTR1	P40088	404 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	AZR1	P50080	613 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ERG5	P54781	538 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	UME1	Q03010	460 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VPS72	Q03388	795 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	VPS38	Q05919	439 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ECM30	Q06673	1274 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	TUP1	P16649	713 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SDH2	P21801	266 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	CEP3	P40969	608 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	ISM1	P48526	1002 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	FMP30	Q02883	468 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	GIS3	Q12418	502 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	SPO12	P17123	173 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	GLN3	P18494	730 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	KIP1	P28742	1111 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	RAD54	P32863	898 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AMD1	YML035C	NIP100	P33420	868 aa		6.16	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.3 ms