Protein–RNA interactions for Protein: P29478

SEC65, Signal recognition particle subunit SEC65, yeastyeast

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC65P29478 NSR1YGR159C 1245 nt22.18■■□□□ 1.14
SEC65P29478 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.04■■□□□ 1.12
SEC65P29478 NOP1YDL014W 984 nt21.24■□□□□ 0.99
SEC65P29478 MDJ1YFL016C 1536 nt20.02■□□□□ 0.79
SEC65P29478 YKL036CYKL036C 393 nt19.37■□□□□ 0.69
SEC65P29478 SRX1YKL086W 384 nt18.63■□□□□ 0.57
SEC65P29478 Q0297Q0297 156 nt18.58■□□□□ 0.56
SEC65P29478 YJL027CYJL027C 417 nt18.38■□□□□ 0.53
SEC65P29478 DBP2YNL112W 1641 nt17.65■□□□□ 0.42
SEC65P29478 YCR051WYCR051W 669 nt17.62■□□□□ 0.41
SEC65P29478 SCS3YGL126W 1143 nt17.51■□□□□ 0.39
SEC65P29478 YBR190WYBR190W 312 nt17.11■□□□□ 0.33
SEC65P29478 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.05■□□□□ 0.32
SEC65P29478 CCC1YLR220W 969 nt16.84■□□□□ 0.29
SEC65P29478 YOL085CYOL085C 342 nt16.84■□□□□ 0.29
SEC65P29478 RTC3YHR087W 336 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC65P29478 RPP1BYDL130W 321 nt16.65■□□□□ 0.26
SEC65P29478 PKP1YIL042C 1185 nt16.61■□□□□ 0.25
SEC65P29478 SCJ1YMR214W 1134 nt16.37■□□□□ 0.21
SEC65P29478 RVS167YDR388W 1449 nt16.36■□□□□ 0.21
SEC65P29478 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.02■□□□□ 0.16
SEC65P29478 PET122YER153C 765 nt15.98■□□□□ 0.15
SEC65P29478 PUT4YOR348C 1884 nt15.84■□□□□ 0.13
SEC65P29478 SHR5YOL110W 714 nt15.79■□□□□ 0.12
SEC65P29478 SCR1SCR1 522 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC65P29478 ATS1YAL020C 1002 nt15.57■□□□□ 0.08
SEC65P29478 URN1YPR152C 1398 nt15.55■□□□□ 0.08
SEC65P29478 SSA3YBL075C 1950 nt15.51■□□□□ 0.07
SEC65P29478 RRN5YLR141W 1092 nt15.48■□□□□ 0.07
SEC65P29478 YDJ1YNL064C 1230 nt15.48■□□□□ 0.07
SEC65P29478 ARE1YCR048W 1833 nt15.46■□□□□ 0.07
SEC65P29478 DEP1YAL013W 1218 nt15.46■□□□□ 0.07
SEC65P29478 OPI9YLR338W 858 nt15.39■□□□□ 0.05
SEC65P29478 SAH1YER043C 1350 nt15.38■□□□□ 0.05
SEC65P29478 POA1YBR022W 534 nt15.29■□□□□ 0.04
SEC65P29478 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.22■□□□□ 0.03
SEC65P29478 GAR1YHR089C 618 nt15.19■□□□□ 0.02
SEC65P29478 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.18■□□□□ 0.02
SEC65P29478 RPN10YHR200W 807 nt15.15■□□□□ 0.02
SEC65P29478 YNL208WYNL208W 600 nt15.15■□□□□ 0.02
SEC65P29478 RSB1YOR049C 1065 nt15.03■□□□□ -0
SEC65P29478 BSC6YOL137W 1494 nt15.01□□□□□ -0.01
SEC65P29478 PUN1YLR414C 792 nt14.89□□□□□ -0.03
SEC65P29478 BUD23YCR047C 828 nt14.8□□□□□ -0.04
SEC65P29478 YJR018WYJR018W 363 nt14.8□□□□□ -0.04
SEC65P29478 PTC2YER089C 1395 nt14.8□□□□□ -0.04
SEC65P29478 TIR1YER011W 765 nt14.7□□□□□ -0.06
SEC65P29478 SPT5YML010W 3192 nt14.65□□□□□ -0.06
SEC65P29478 SSA1YAL005C 1929 nt14.63□□□□□ -0.07
SEC65P29478 NAB2YGL122C 1578 nt14.63□□□□□ -0.07
SEC65P29478 YJR120WYJR120W 351 nt14.62□□□□□ -0.07
SEC65P29478 PST2YDR032C 597 nt14.51□□□□□ -0.09
SEC65P29478 FIS1YIL065C 468 nt14.46□□□□□ -0.09
SEC65P29478 SRB2YHR041C 633 nt14.42□□□□□ -0.1
SEC65P29478 DAL1YIR027C 1383 nt14.38□□□□□ -0.11
SEC65P29478 RPP2BYDR382W 333 nt14.35□□□□□ -0.11
SEC65P29478 FPR4YLR449W 1179 nt14.31□□□□□ -0.12
SEC65P29478 INM2YDR287W 879 nt14.28□□□□□ -0.12
SEC65P29478 PHO4YFR034C 939 nt14.27□□□□□ -0.13
SEC65P29478 SSA4YER103W 1929 nt14.17□□□□□ -0.14
SEC65P29478 MEP2YNL142W 1500 nt14.13□□□□□ -0.15
SEC65P29478 YBL100CYBL100C 315 nt14.12□□□□□ -0.15
SEC65P29478 YPS1YLR120C 1710 nt14.12□□□□□ -0.15
SEC65P29478 BDH2YAL061W 1254 nt14.08□□□□□ -0.16
SEC65P29478 WWM1YFL010C 636 nt14.03□□□□□ -0.16
SEC65P29478 SHU1YHL006C 453 nt13.99□□□□□ -0.17
SEC65P29478 YDR095CYDR095C 411 nt13.98□□□□□ -0.17
SEC65P29478 FUN26YAL022C 1554 nt13.96□□□□□ -0.18
SEC65P29478 DCW1YKL046C 1350 nt13.94□□□□□ -0.18
SEC65P29478 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.93□□□□□ -0.18
SEC65P29478 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.87□□□□□ -0.19
SEC65P29478 LSM3YLR438C-A 270 nt13.83□□□□□ -0.2
SEC65P29478 TRM9YML014W 840 nt13.83□□□□□ -0.2
SEC65P29478 HOM6YJR139C 1080 nt13.79□□□□□ -0.2
SEC65P29478 YGR021WYGR021W 873 nt13.78□□□□□ -0.2
SEC65P29478 PTP1YDL230W 1008 nt13.76□□□□□ -0.21
SEC65P29478 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.76□□□□□ -0.21
SEC65P29478 CCT6YDR188W 1641 nt13.75□□□□□ -0.21
SEC65P29478 ALF1YNL148C 765 nt13.75□□□□□ -0.21
SEC65P29478 EMI2YDR516C 1503 nt13.71□□□□□ -0.21
SEC65P29478 YKL097CYKL097C 411 nt13.7□□□□□ -0.22
SEC65P29478 BDF1YLR399C 2061 nt13.7□□□□□ -0.22
SEC65P29478 MNP1YGL068W 585 nt13.69□□□□□ -0.22
SEC65P29478 RPP2AYOL039W 321 nt13.69□□□□□ -0.22
SEC65P29478 CAC2YML102W 1407 nt13.69□□□□□ -0.22
SEC65P29478 SIS1YNL007C 1059 nt13.65□□□□□ -0.22
SEC65P29478 YDL221WYDL221W 552 nt13.59□□□□□ -0.23
SEC65P29478 YBR220CYBR220C 1683 nt13.59□□□□□ -0.23
SEC65P29478 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.58□□□□□ -0.24
SEC65P29478 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.58□□□□□ -0.24
SEC65P29478 RKM5YLR137W 1104 nt13.57□□□□□ -0.24
SEC65P29478 YMR090WYMR090W 684 nt13.54□□□□□ -0.24
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