Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 NSR1YGR159C 1245 nt21.89■■□□□ 1.09
NEW1Q08972 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.83■■□□□ 1.09
NEW1Q08972 NOP1YDL014W 984 nt21.03■□□□□ 0.96
NEW1Q08972 MDJ1YFL016C 1536 nt19.83■□□□□ 0.77
NEW1Q08972 YKL036CYKL036C 393 nt19.11■□□□□ 0.65
NEW1Q08972 SRX1YKL086W 384 nt18.36■□□□□ 0.53
NEW1Q08972 Q0297Q0297 156 nt18.27■□□□□ 0.52
NEW1Q08972 YJL027CYJL027C 417 nt18.25■□□□□ 0.51
NEW1Q08972 YCR051WYCR051W 669 nt17.48■□□□□ 0.39
NEW1Q08972 DBP2YNL112W 1641 nt17.35■□□□□ 0.37
NEW1Q08972 SCS3YGL126W 1143 nt17.24■□□□□ 0.35
NEW1Q08972 YBR190WYBR190W 312 nt16.91■□□□□ 0.3
NEW1Q08972 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.79■□□□□ 0.28
NEW1Q08972 CCC1YLR220W 969 nt16.73■□□□□ 0.27
NEW1Q08972 RTC3YHR087W 336 nt16.62■□□□□ 0.25
NEW1Q08972 YOL085CYOL085C 342 nt16.57■□□□□ 0.24
NEW1Q08972 PKP1YIL042C 1185 nt16.44■□□□□ 0.22
NEW1Q08972 RPP1BYDL130W 321 nt16.42■□□□□ 0.22
NEW1Q08972 RVS167YDR388W 1449 nt16.26■□□□□ 0.19
NEW1Q08972 SCJ1YMR214W 1134 nt16.13■□□□□ 0.17
NEW1Q08972 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.81■□□□□ 0.12
NEW1Q08972 PET122YER153C 765 nt15.76■□□□□ 0.11
NEW1Q08972 PUT4YOR348C 1884 nt15.61■□□□□ 0.09
NEW1Q08972 SHR5YOL110W 714 nt15.6■□□□□ 0.09
NEW1Q08972 SCR1SCR1 522 nt15.49■□□□□ 0.07
NEW1Q08972 URN1YPR152C 1398 nt15.4■□□□□ 0.06
NEW1Q08972 DEP1YAL013W 1218 nt15.37■□□□□ 0.05
NEW1Q08972 SSA3YBL075C 1950 nt15.31■□□□□ 0.04
NEW1Q08972 ATS1YAL020C 1002 nt15.31■□□□□ 0.04
NEW1Q08972 RRN5YLR141W 1092 nt15.28■□□□□ 0.04
NEW1Q08972 SAH1YER043C 1350 nt15.24■□□□□ 0.03
NEW1Q08972 ARE1YCR048W 1833 nt15.24■□□□□ 0.03
NEW1Q08972 YDJ1YNL064C 1230 nt15.24■□□□□ 0.03
NEW1Q08972 OPI9YLR338W 858 nt15.2■□□□□ 0.02
NEW1Q08972 POA1YBR022W 534 nt15.17■□□□□ 0.02
NEW1Q08972 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.09■□□□□ 0.01
NEW1Q08972 RPN10YHR200W 807 nt15.07■□□□□ 0
NEW1Q08972 GAR1YHR089C 618 nt15.05■□□□□ -0
NEW1Q08972 YNL208WYNL208W 600 nt15□□□□□ -0.01
NEW1Q08972 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.96□□□□□ -0.01
NEW1Q08972 RSB1YOR049C 1065 nt14.89□□□□□ -0.03
NEW1Q08972 BSC6YOL137W 1494 nt14.87□□□□□ -0.03
NEW1Q08972 BUD23YCR047C 828 nt14.76□□□□□ -0.05
NEW1Q08972 PUN1YLR414C 792 nt14.76□□□□□ -0.05
NEW1Q08972 PTC2YER089C 1395 nt14.68□□□□□ -0.06
NEW1Q08972 YJR018WYJR018W 363 nt14.66□□□□□ -0.06
NEW1Q08972 TIR1YER011W 765 nt14.52□□□□□ -0.09
NEW1Q08972 NAB2YGL122C 1578 nt14.49□□□□□ -0.09
NEW1Q08972 SSA1YAL005C 1929 nt14.42□□□□□ -0.1
NEW1Q08972 YJR120WYJR120W 351 nt14.35□□□□□ -0.11
NEW1Q08972 FPR4YLR449W 1179 nt14.31□□□□□ -0.12
NEW1Q08972 SPT5YML010W 3192 nt14.29□□□□□ -0.12
NEW1Q08972 RPP2BYDR382W 333 nt14.28□□□□□ -0.12
NEW1Q08972 FIS1YIL065C 468 nt14.26□□□□□ -0.13
NEW1Q08972 DAL1YIR027C 1383 nt14.24□□□□□ -0.13
NEW1Q08972 PST2YDR032C 597 nt14.22□□□□□ -0.13
NEW1Q08972 INM2YDR287W 879 nt14.15□□□□□ -0.14
NEW1Q08972 SRB2YHR041C 633 nt14.14□□□□□ -0.15
NEW1Q08972 PHO4YFR034C 939 nt14.13□□□□□ -0.15
NEW1Q08972 YBL100CYBL100C 315 nt14□□□□□ -0.17
NEW1Q08972 SSA4YER103W 1929 nt14□□□□□ -0.17
NEW1Q08972 MEP2YNL142W 1500 nt13.96□□□□□ -0.17
NEW1Q08972 YPS1YLR120C 1710 nt13.94□□□□□ -0.18
NEW1Q08972 BDH2YAL061W 1254 nt13.91□□□□□ -0.18
NEW1Q08972 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.87□□□□□ -0.19
NEW1Q08972 WWM1YFL010C 636 nt13.85□□□□□ -0.19
NEW1Q08972 Q0182Q0182 405 nt13.84□□□□□ -0.19
NEW1Q08972 FUN26YAL022C 1554 nt13.82□□□□□ -0.2
NEW1Q08972 YDR095CYDR095C 411 nt13.79□□□□□ -0.2
NEW1Q08972 DCW1YKL046C 1350 nt13.79□□□□□ -0.2
NEW1Q08972 SHU1YHL006C 453 nt13.76□□□□□ -0.21
NEW1Q08972 TRM9YML014W 840 nt13.73□□□□□ -0.21
NEW1Q08972 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.71□□□□□ -0.21
NEW1Q08972 ALF1YNL148C 765 nt13.71□□□□□ -0.21
NEW1Q08972 LSM3YLR438C-A 270 nt13.65□□□□□ -0.22
NEW1Q08972 YGR021WYGR021W 873 nt13.61□□□□□ -0.23
NEW1Q08972 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.58□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 EMI2YDR516C 1503 nt13.58□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 CCT6YDR188W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 HOM6YJR139C 1080 nt13.56□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 RPP2AYOL039W 321 nt13.56□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 PTP1YDL230W 1008 nt13.53□□□□□ -0.24
NEW1Q08972 YKL097CYKL097C 411 nt13.52□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 CAC2YML102W 1407 nt13.51□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 MNP1YGL068W 585 nt13.51□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.49□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.49□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 YMR090WYMR090W 684 nt13.49□□□□□ -0.25
NEW1Q08972 SIS1YNL007C 1059 nt13.45□□□□□ -0.26
NEW1Q08972 YDL221WYDL221W 552 nt13.44□□□□□ -0.26
NEW1Q08972 BDF1YLR399C 2061 nt13.44□□□□□ -0.26
NEW1Q08972 YBR220CYBR220C 1683 nt13.4□□□□□ -0.26
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