Protein–RNA interactions for Protein: P39925

AFG3, Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein AFG3, yeastyeast

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFG3P39925 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.81■■□□□ 1.24
AFG3P39925 NOP1YDL014W 984 nt22.32■■□□□ 1.16
AFG3P39925 NSR1YGR159C 1245 nt22.08■■□□□ 1.13
AFG3P39925 YKL036CYKL036C 393 nt21.2■□□□□ 0.98
AFG3P39925 YJL027CYJL027C 417 nt19.92■□□□□ 0.78
AFG3P39925 Q0297Q0297 156 nt19.78■□□□□ 0.76
AFG3P39925 SCS3YGL126W 1143 nt19.65■□□□□ 0.74
AFG3P39925 SRX1YKL086W 384 nt19.55■□□□□ 0.72
AFG3P39925 MDJ1YFL016C 1536 nt19.15■□□□□ 0.66
AFG3P39925 YCR051WYCR051W 669 nt18.62■□□□□ 0.57
AFG3P39925 YOL085CYOL085C 342 nt18.38■□□□□ 0.53
AFG3P39925 PKP1YIL042C 1185 nt18.09■□□□□ 0.49
AFG3P39925 SCJ1YMR214W 1134 nt18.05■□□□□ 0.48
AFG3P39925 RPP1BYDL130W 321 nt17.75■□□□□ 0.43
AFG3P39925 ATS1YAL020C 1002 nt17.72■□□□□ 0.43
AFG3P39925 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.35■□□□□ 0.37
AFG3P39925 CCC1YLR220W 969 nt17.22■□□□□ 0.35
AFG3P39925 DBP2YNL112W 1641 nt17.19■□□□□ 0.34
AFG3P39925 PET122YER153C 765 nt16.94■□□□□ 0.3
AFG3P39925 SCR1SCR1 522 nt16.83■□□□□ 0.28
AFG3P39925 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.61■□□□□ 0.25
AFG3P39925 RRN5YLR141W 1092 nt16.51■□□□□ 0.23
AFG3P39925 RTC3YHR087W 336 nt16.5■□□□□ 0.23
AFG3P39925 PST2YDR032C 597 nt16.33■□□□□ 0.2
AFG3P39925 RSB1YOR049C 1065 nt16.33■□□□□ 0.2
AFG3P39925 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.19■□□□□ 0.18
AFG3P39925 RVS167YDR388W 1449 nt16.18■□□□□ 0.18
AFG3P39925 YBR190WYBR190W 312 nt16.08■□□□□ 0.16
AFG3P39925 YDJ1YNL064C 1230 nt16.02■□□□□ 0.16
AFG3P39925 YKL097CYKL097C 411 nt15.96■□□□□ 0.15
AFG3P39925 SHR5YOL110W 714 nt15.79■□□□□ 0.12
AFG3P39925 GAR1YHR089C 618 nt15.63■□□□□ 0.09
AFG3P39925 SHU1YHL006C 453 nt15.55■□□□□ 0.08
AFG3P39925 YOR139CYOR139C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
AFG3P39925 DEP1YAL013W 1218 nt15.23■□□□□ 0.03
AFG3P39925 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.17■□□□□ 0.02
AFG3P39925 TIR1YER011W 765 nt15.06■□□□□ 0
AFG3P39925 URN1YPR152C 1398 nt15.02■□□□□ -0
AFG3P39925 YNL208WYNL208W 600 nt14.96□□□□□ -0.01
AFG3P39925 NPL3YDR432W 1245 nt14.95□□□□□ -0.02
AFG3P39925 RPN10YHR200W 807 nt14.84□□□□□ -0.03
AFG3P39925 SSA1YAL005C 1929 nt14.8□□□□□ -0.04
AFG3P39925 SRB2YHR041C 633 nt14.75□□□□□ -0.05
AFG3P39925 MNP1YGL068W 585 nt14.66□□□□□ -0.06
AFG3P39925 OPI9YLR338W 858 nt14.65□□□□□ -0.06
AFG3P39925 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.62□□□□□ -0.07
AFG3P39925 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.62□□□□□ -0.07
AFG3P39925 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.62□□□□□ -0.07
AFG3P39925 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.62□□□□□ -0.07
AFG3P39925 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.62□□□□□ -0.07
AFG3P39925 HOM6YJR139C 1080 nt14.59□□□□□ -0.07
AFG3P39925 WWM1YFL010C 636 nt14.55□□□□□ -0.08
AFG3P39925 YGR021WYGR021W 873 nt14.54□□□□□ -0.08
AFG3P39925 YOL037CYOL037C 354 nt14.54□□□□□ -0.08
AFG3P39925 SAH1YER043C 1350 nt14.46□□□□□ -0.1
AFG3P39925 RKM5YLR137W 1104 nt14.37□□□□□ -0.11
AFG3P39925 YJR018WYJR018W 363 nt14.35□□□□□ -0.11
AFG3P39925 YJR120WYJR120W 351 nt14.34□□□□□ -0.11
AFG3P39925 MOT3YMR070W 1473 nt14.29□□□□□ -0.12
AFG3P39925 PUS2YGL063W 1113 nt14.28□□□□□ -0.12
AFG3P39925 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.22□□□□□ -0.13
AFG3P39925 YLR281CYLR281C 468 nt14.21□□□□□ -0.13
AFG3P39925 PUN1YLR414C 792 nt14.2□□□□□ -0.14
AFG3P39925 PUT4YOR348C 1884 nt14.19□□□□□ -0.14
AFG3P39925 SSA3YBL075C 1950 nt14.18□□□□□ -0.14
AFG3P39925 RPP2BYDR382W 333 nt14.16□□□□□ -0.14
AFG3P39925 ARE1YCR048W 1833 nt14.15□□□□□ -0.14
AFG3P39925 BSC6YOL137W 1494 nt14.12□□□□□ -0.15
AFG3P39925 WHI5YOR083W 888 nt14.09□□□□□ -0.15
AFG3P39925 BDH2YAL061W 1254 nt14.02□□□□□ -0.17
AFG3P39925 PTC2YER089C 1395 nt13.98□□□□□ -0.17
AFG3P39925 YPR011CYPR011C 981 nt13.96□□□□□ -0.17
AFG3P39925 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.95□□□□□ -0.18
AFG3P39925 FMP45YDL222C 930 nt13.94□□□□□ -0.18
AFG3P39925 LSM3YLR438C-A 270 nt13.92□□□□□ -0.18
AFG3P39925 MRPL8YJL063C 717 nt13.86□□□□□ -0.19
AFG3P39925 YLR236CYLR236C 324 nt13.86□□□□□ -0.19
AFG3P39925 DSK2YMR276W 1122 nt13.84□□□□□ -0.19
AFG3P39925 POA1YBR022W 534 nt13.82□□□□□ -0.2
AFG3P39925 YCH1YGR203W 447 nt13.8□□□□□ -0.2
AFG3P39925 UBX6YJL048C 1191 nt13.74□□□□□ -0.21
AFG3P39925 YBL100CYBL100C 315 nt13.73□□□□□ -0.21
AFG3P39925 INM2YDR287W 879 nt13.71□□□□□ -0.21
AFG3P39925 BUD23YCR047C 828 nt13.68□□□□□ -0.22
AFG3P39925 NAB2YGL122C 1578 nt13.67□□□□□ -0.22
AFG3P39925 IMP2'YIL154C 1041 nt13.67□□□□□ -0.22
AFG3P39925 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.64□□□□□ -0.23
AFG3P39925 FPR4YLR449W 1179 nt13.64□□□□□ -0.23
AFG3P39925 TRM9YML014W 840 nt13.64□□□□□ -0.23
AFG3P39925 DAL1YIR027C 1383 nt13.62□□□□□ -0.23
AFG3P39925 ADO1YJR105W 1023 nt13.62□□□□□ -0.23
AFG3P39925 SPP1YPL138C 1062 nt13.61□□□□□ -0.23
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