Protein–RNA interactions for Protein: Q03660

TRS130, Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130, yeastyeast

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRS130Q03660 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.27■■□□□ 1.16
TRS130Q03660 NSR1YGR159C 1245 nt21.96■■□□□ 1.11
TRS130Q03660 NOP1YDL014W 984 nt21.67■■□□□ 1.06
TRS130Q03660 YKL036CYKL036C 393 nt20.16■□□□□ 0.82
TRS130Q03660 MDJ1YFL016C 1536 nt19.4■□□□□ 0.7
TRS130Q03660 Q0297Q0297 156 nt19.04■□□□□ 0.64
TRS130Q03660 SRX1YKL086W 384 nt18.96■□□□□ 0.63
TRS130Q03660 YJL027CYJL027C 417 nt18.85■□□□□ 0.61
TRS130Q03660 SCS3YGL126W 1143 nt18.44■□□□□ 0.54
TRS130Q03660 YCR051WYCR051W 669 nt18■□□□□ 0.47
TRS130Q03660 YOL085CYOL085C 342 nt17.47■□□□□ 0.39
TRS130Q03660 DBP2YNL112W 1641 nt17.23■□□□□ 0.35
TRS130Q03660 PKP1YIL042C 1185 nt17.2■□□□□ 0.34
TRS130Q03660 RPP1BYDL130W 321 nt17.09■□□□□ 0.33
TRS130Q03660 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.06■□□□□ 0.32
TRS130Q03660 CCC1YLR220W 969 nt16.89■□□□□ 0.29
TRS130Q03660 ATS1YAL020C 1002 nt16.53■□□□□ 0.24
TRS130Q03660 SCJ1YMR214W 1134 nt16.49■□□□□ 0.23
TRS130Q03660 YBR190WYBR190W 312 nt16.47■□□□□ 0.23
TRS130Q03660 PET122YER153C 765 nt16.33■□□□□ 0.2
TRS130Q03660 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.19■□□□□ 0.18
TRS130Q03660 RVS167YDR388W 1449 nt16.19■□□□□ 0.18
TRS130Q03660 SCR1SCR1 522 nt16.16■□□□□ 0.18
TRS130Q03660 RTC3YHR087W 336 nt16.11■□□□□ 0.17
TRS130Q03660 RRN5YLR141W 1092 nt15.87■□□□□ 0.13
TRS130Q03660 SHR5YOL110W 714 nt15.68■□□□□ 0.1
TRS130Q03660 YDJ1YNL064C 1230 nt15.65■□□□□ 0.1
TRS130Q03660 RSB1YOR049C 1065 nt15.58■□□□□ 0.08
TRS130Q03660 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.56■□□□□ 0.08
TRS130Q03660 PST2YDR032C 597 nt15.29■□□□□ 0.04
TRS130Q03660 GAR1YHR089C 618 nt15.29■□□□□ 0.04
TRS130Q03660 DEP1YAL013W 1218 nt15.21■□□□□ 0.03
TRS130Q03660 URN1YPR152C 1398 nt15.15■□□□□ 0.02
TRS130Q03660 YNL208WYNL208W 600 nt14.96□□□□□ -0.01
TRS130Q03660 RPN10YHR200W 807 nt14.94□□□□□ -0.02
TRS130Q03660 OPI9YLR338W 858 nt14.9□□□□□ -0.02
TRS130Q03660 PUT4YOR348C 1884 nt14.85□□□□□ -0.03
TRS130Q03660 SAH1YER043C 1350 nt14.77□□□□□ -0.04
TRS130Q03660 TIR1YER011W 765 nt14.77□□□□□ -0.05
TRS130Q03660 YKL097CYKL097C 411 nt14.75□□□□□ -0.05
TRS130Q03660 SHU1YHL006C 453 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS130Q03660 ARE1YCR048W 1833 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS130Q03660 SSA1YAL005C 1929 nt14.57□□□□□ -0.08
TRS130Q03660 YJR018WYJR018W 363 nt14.47□□□□□ -0.09
TRS130Q03660 PUN1YLR414C 792 nt14.46□□□□□ -0.09
TRS130Q03660 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.45□□□□□ -0.1
TRS130Q03660 POA1YBR022W 534 nt14.41□□□□□ -0.1
TRS130Q03660 SRB2YHR041C 633 nt14.39□□□□□ -0.11
TRS130Q03660 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.38□□□□□ -0.11
TRS130Q03660 YJR120WYJR120W 351 nt14.31□□□□□ -0.12
TRS130Q03660 PTC2YER089C 1395 nt14.26□□□□□ -0.13
TRS130Q03660 RPP2BYDR382W 333 nt14.19□□□□□ -0.14
TRS130Q03660 WWM1YFL010C 636 nt14.16□□□□□ -0.14
TRS130Q03660 YOR139CYOR139C 393 nt14.16□□□□□ -0.14
TRS130Q03660 BUD23YCR047C 828 nt14.12□□□□□ -0.15
TRS130Q03660 YGR021WYGR021W 873 nt14.09□□□□□ -0.15
TRS130Q03660 HOM6YJR139C 1080 nt14.08□□□□□ -0.16
TRS130Q03660 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
TRS130Q03660 MNP1YGL068W 585 nt14.05□□□□□ -0.16
TRS130Q03660 NAB2YGL122C 1578 nt14.05□□□□□ -0.16
TRS130Q03660 NPL3YDR432W 1245 nt13.98□□□□□ -0.17
TRS130Q03660 SSA3YBL075C 1950 nt13.96□□□□□ -0.18
TRS130Q03660 BDH2YAL061W 1254 nt13.95□□□□□ -0.18
TRS130Q03660 INM2YDR287W 879 nt13.91□□□□□ -0.18
TRS130Q03660 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.91□□□□□ -0.18
TRS130Q03660 DAL1YIR027C 1383 nt13.9□□□□□ -0.18
TRS130Q03660 FIS1YIL065C 468 nt13.89□□□□□ -0.19
TRS130Q03660 FPR4YLR449W 1179 nt13.87□□□□□ -0.19
TRS130Q03660 RKM5YLR137W 1104 nt13.86□□□□□ -0.19
TRS130Q03660 YOL037CYOL037C 354 nt13.84□□□□□ -0.19
TRS130Q03660 YBL100CYBL100C 315 nt13.82□□□□□ -0.2
TRS130Q03660 LSM3YLR438C-A 270 nt13.79□□□□□ -0.2
TRS130Q03660 PHO4YFR034C 939 nt13.78□□□□□ -0.2
TRS130Q03660 FUN26YAL022C 1554 nt13.66□□□□□ -0.22
TRS130Q03660 TRM9YML014W 840 nt13.65□□□□□ -0.22
TRS130Q03660 Q0182Q0182 405 nt13.61□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.59□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.59□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.59□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.59□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.59□□□□□ -0.23
TRS130Q03660 YLR281CYLR281C 468 nt13.52□□□□□ -0.25
TRS130Q03660 CCT6YDR188W 1641 nt13.51□□□□□ -0.25
TRS130Q03660 WHI5YOR083W 888 nt13.46□□□□□ -0.25
TRS130Q03660 YPS1YLR120C 1710 nt13.44□□□□□ -0.26
TRS130Q03660 PUS2YGL063W 1113 nt13.44□□□□□ -0.26
TRS130Q03660 ALF1YNL148C 765 nt13.42□□□□□ -0.26
TRS130Q03660 YDR095CYDR095C 411 nt13.39□□□□□ -0.27
TRS130Q03660 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
TRS130Q03660 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.37□□□□□ -0.27
TRS130Q03660 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.37□□□□□ -0.27
TRS130Q03660 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms