RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	TMA16	Q08687	178 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	TFC8	Q12308	588 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	ERP3	Q12403	225 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CYC8	P14922	966 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	OM45	P16547	393 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	ASH1	P34233	588 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	MGA2	P40578	1113 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PSO2	P30620	661 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	FIS1	P40515	155 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YFL034W	P43564	1073 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	LSC2	P53312	427 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	VPS75	P53853	264 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	SPC110	P32380	944 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YET1	P35723	206 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PPS1	P38148	807 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	REG2	P38232	338 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	CTM1	P38818	585 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	COG4	Q06096	861 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	CRD1	Q07560	283 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PHO13	P19881	312 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MSH3	P25336	1018 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	HUL4	P40985	892 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	VID30	P53076	958 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	SLD5	Q03406	294 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	TCO89	Q08921	799 aa		12	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PCK1	P10963	549 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	TFC4	P33339	1025 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	TVP38	P36164	337 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PXL1	P36166	706 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	UBP15	P50101	1230 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	CUR1	Q06469	252 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	SPO11	P23179	398 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	CTR1	P49573	406 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	SVF1	Q05515	481 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	DUS4	Q06063	367 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YAP7	Q08182	245 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YOL075C	Q08234	1294 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YPL277C	Q08989	487 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MED1	Q12321	566 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	UBP13	P38187	747 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	SPT8	P38915	602 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MXR1	P40029	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	YDL057W	Q07379	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	RGT1	P32862	1170 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	BIM1	P40013	344 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDR2	YOL052C-A	RPC53	P25441	422 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ATG19	P35193	415 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	TOS3	P43637	560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ATG1	P53104	897 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	MDR1	P53258	950 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ESC2	Q06340	456 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SMC5	Q08204	1093 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YPL216W	Q08964	1102 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ECM29	P38737	1868 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	DAL7	P21826	554 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SEC65	P29478	273 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	TIM23	P32897	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	VPS35	P34110	944 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	EFM2	P38347	419 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	LEO1	P38439	464 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YEL025C	P39991	1188 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	VPS53	P47061	822 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	STR2	P47164	639 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	TOF1	P53840	1238 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YCG1	Q06680	1035 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	PLP2	Q12017	286 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	TRM11	Q12463	433 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	APL1	P27351	700 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	TRK2	P28584	889 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	STU2	P46675	888 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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