Protein–RNA interactions for Protein: P38148

PPS1, Dual specificity protein phosphatase PPS1, yeastyeast

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPS1P38148 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.56■■□□□ 1.2
PPS1P38148 NSR1YGR159C 1245 nt22.45■■□□□ 1.18
PPS1P38148 NOP1YDL014W 984 nt21.89■■□□□ 1.09
PPS1P38148 YKL036CYKL036C 393 nt20.22■□□□□ 0.83
PPS1P38148 MDJ1YFL016C 1536 nt19.98■□□□□ 0.79
PPS1P38148 Q0297Q0297 156 nt19.22■□□□□ 0.67
PPS1P38148 SRX1YKL086W 384 nt19.18■□□□□ 0.66
PPS1P38148 YJL027CYJL027C 417 nt18.85■□□□□ 0.61
PPS1P38148 SCS3YGL126W 1143 nt18.42■□□□□ 0.54
PPS1P38148 YCR051WYCR051W 669 nt18.17■□□□□ 0.5
PPS1P38148 DBP2YNL112W 1641 nt17.72■□□□□ 0.43
PPS1P38148 YOL085CYOL085C 342 nt17.54■□□□□ 0.4
PPS1P38148 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.38■□□□□ 0.37
PPS1P38148 PKP1YIL042C 1185 nt17.26■□□□□ 0.35
PPS1P38148 RPP1BYDL130W 321 nt17.24■□□□□ 0.35
PPS1P38148 CCC1YLR220W 969 nt17.15■□□□□ 0.34
PPS1P38148 YBR190WYBR190W 312 nt17.03■□□□□ 0.32
PPS1P38148 RTC3YHR087W 336 nt16.6■□□□□ 0.25
PPS1P38148 SCJ1YMR214W 1134 nt16.56■□□□□ 0.24
PPS1P38148 RVS167YDR388W 1449 nt16.54■□□□□ 0.24
PPS1P38148 PET122YER153C 765 nt16.49■□□□□ 0.23
PPS1P38148 ATS1YAL020C 1002 nt16.46■□□□□ 0.23
PPS1P38148 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.42■□□□□ 0.22
PPS1P38148 SCR1SCR1 522 nt16.23■□□□□ 0.19
PPS1P38148 SHR5YOL110W 714 nt16.01■□□□□ 0.15
PPS1P38148 RRN5YLR141W 1092 nt16■□□□□ 0.15
PPS1P38148 YDJ1YNL064C 1230 nt15.89■□□□□ 0.13
PPS1P38148 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.69■□□□□ 0.1
PPS1P38148 RSB1YOR049C 1065 nt15.63■□□□□ 0.09
PPS1P38148 URN1YPR152C 1398 nt15.58■□□□□ 0.08
PPS1P38148 DEP1YAL013W 1218 nt15.56■□□□□ 0.08
PPS1P38148 PUT4YOR348C 1884 nt15.52■□□□□ 0.07
PPS1P38148 GAR1YHR089C 618 nt15.51■□□□□ 0.07
PPS1P38148 OPI9YLR338W 858 nt15.38■□□□□ 0.05
PPS1P38148 YNL208WYNL208W 600 nt15.3■□□□□ 0.04
PPS1P38148 RPN10YHR200W 807 nt15.29■□□□□ 0.04
PPS1P38148 SAH1YER043C 1350 nt15.27■□□□□ 0.04
PPS1P38148 PST2YDR032C 597 nt15.27■□□□□ 0.04
PPS1P38148 ARE1YCR048W 1833 nt15.23■□□□□ 0.03
PPS1P38148 TIR1YER011W 765 nt15.01□□□□□ -0.01
PPS1P38148 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.01□□□□□ -0.01
PPS1P38148 POA1YBR022W 534 nt14.99□□□□□ -0.01
PPS1P38148 PUN1YLR414C 792 nt14.9□□□□□ -0.02
PPS1P38148 SSA3YBL075C 1950 nt14.9□□□□□ -0.02
PPS1P38148 SSA1YAL005C 1929 nt14.86□□□□□ -0.03
PPS1P38148 YJR018WYJR018W 363 nt14.86□□□□□ -0.03
PPS1P38148 PTC2YER089C 1395 nt14.73□□□□□ -0.05
PPS1P38148 YJR120WYJR120W 351 nt14.71□□□□□ -0.05
PPS1P38148 BSC6YOL137W 1494 nt14.69□□□□□ -0.06
PPS1P38148 SHU1YHL006C 453 nt14.66□□□□□ -0.06
PPS1P38148 SRB2YHR041C 633 nt14.66□□□□□ -0.06
PPS1P38148 BUD23YCR047C 828 nt14.63□□□□□ -0.07
PPS1P38148 YKL097CYKL097C 411 nt14.6□□□□□ -0.07
PPS1P38148 NAB2YGL122C 1578 nt14.53□□□□□ -0.08
PPS1P38148 RPP2BYDR382W 333 nt14.5□□□□□ -0.09
PPS1P38148 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.43□□□□□ -0.1
PPS1P38148 FIS1YIL065C 468 nt14.38□□□□□ -0.11
PPS1P38148 WWM1YFL010C 636 nt14.36□□□□□ -0.11
PPS1P38148 DAL1YIR027C 1383 nt14.34□□□□□ -0.11
PPS1P38148 INM2YDR287W 879 nt14.31□□□□□ -0.12
PPS1P38148 BDH2YAL061W 1254 nt14.27□□□□□ -0.13
PPS1P38148 FPR4YLR449W 1179 nt14.27□□□□□ -0.13
PPS1P38148 YGR021WYGR021W 873 nt14.23□□□□□ -0.13
PPS1P38148 PHO4YFR034C 939 nt14.22□□□□□ -0.13
PPS1P38148 HOM6YJR139C 1080 nt14.22□□□□□ -0.13
PPS1P38148 YBL100CYBL100C 315 nt14.18□□□□□ -0.14
PPS1P38148 MNP1YGL068W 585 nt14.16□□□□□ -0.14
PPS1P38148 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.11□□□□□ -0.15
PPS1P38148 YOR139CYOR139C 393 nt14.09□□□□□ -0.15
PPS1P38148 SPT5YML010W 3192 nt14.08□□□□□ -0.16
PPS1P38148 LSM3YLR438C-A 270 nt14.07□□□□□ -0.16
PPS1P38148 FUN26YAL022C 1554 nt14.03□□□□□ -0.16
PPS1P38148 RKM5YLR137W 1104 nt14.01□□□□□ -0.17
PPS1P38148 YPS1YLR120C 1710 nt13.96□□□□□ -0.17
PPS1P38148 TRM9YML014W 840 nt13.96□□□□□ -0.17
PPS1P38148 NPL3YDR432W 1245 nt13.9□□□□□ -0.18
PPS1P38148 YDR095CYDR095C 411 nt13.88□□□□□ -0.19
PPS1P38148 YOL037CYOL037C 354 nt13.88□□□□□ -0.19
PPS1P38148 CCT6YDR188W 1641 nt13.87□□□□□ -0.19
PPS1P38148 MEP2YNL142W 1500 nt13.8□□□□□ -0.2
PPS1P38148 ALF1YNL148C 765 nt13.78□□□□□ -0.2
PPS1P38148 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.76□□□□□ -0.21
PPS1P38148 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.69□□□□□ -0.22
PPS1P38148 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.69□□□□□ -0.22
PPS1P38148 SIS1YNL007C 1059 nt13.64□□□□□ -0.23
PPS1P38148 DCW1YKL046C 1350 nt13.6□□□□□ -0.23
PPS1P38148 PTP1YDL230W 1008 nt13.6□□□□□ -0.23
PPS1P38148 RPP2AYOL039W 321 nt13.59□□□□□ -0.23
PPS1P38148 YLR281CYLR281C 468 nt13.58□□□□□ -0.24
PPS1P38148 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.53□□□□□ -0.24
PPS1P38148 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.53□□□□□ -0.24
PPS1P38148 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms